Le neuroblastome (NB) représente 8% de tous les cancers pédiatriques et est
caractérisé par sa grande hétérogénéité clinique. Afin d’évaluer son pronostic,
plusieurs facteurs génétiques sont utilisés : amplification de MYCN, délétion 1p, gain 11q et gain 17q. Les buts de notre travail étaient d’abord de vérifier si l’hybridation in situ en fluorescence (FISH) permet une analyse complète de ces anomalies et ensuite,
en utilisant une analyse globale du génome telle le polymorphisme nucléotidique
simple (SNP), de vérifier la concordance avec les résultats de la FISH et le pronostic
potentiel des anomalies du 14q, en particulier du gène AKT.
Nous avons donc établi un panel de sondes pour la FISH qui a été appliqué sur 16
tumeurs non-fixées. Après isolation de l’ADN de 36 tumeurs, nous avons effectué
une analyse génotypique par SNP utilisant les puces « Affymetrix Genome-Wide
Human SNP Array 6.0 » contenant 945,826 sondes non polymorphiques et 906,000
sondes polymorphiques.
Nos résultats ont démontré que la FISH permet l’évaluation complète des anomalies
génétiques importantes du NB et que les anomalies déséquilibrées sont détectées très
précisément par SNP. Les anomalies du 14q tendent à être associées avec des facteurs
cliniques comme le grade et l’évolution, contrairement aux anomalies d’AKT.
L’analyse du 14q a révélé trois gènes d’intérêt, MAX, BCL11B et GPHN, qui
devraient être analysés sur un plus grand échantillon.
Ainsi, l’étude par FISH semble adaptée pour détecter les anomalies génétiques
classiques du NB, alors que celles retrouvées en 14q représentent de potentielles cibles thérapeutiques pour cette tumeur. / Neuroblastoma (NB) accounts for 8% of all childhood cancers and is characterized by
its clinical heterogeneity. To evaluate its prognostic, many genetic markers are used:
MYCN amplification, 1p deletion, 11q gain and 17q gain. Our goals were first to
verify if fluorescence in situ hybridization (FISH) allows a complete analysis of these
abnormalities and, second, using a global genomic analysis as single nucleotide
polymorphism (SNP), to verify the concordance with FISH results and the prognostic potential of 14q abnormalities, especially these of AKT gene.
We then established a FISH panel that has been applied on 16 unfixed tumors. After
DNA isolation of 36 tumors, we made a genotypic analysis by SNP using « Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 » containing 945,826 nonpolymorphic probes and 906,000 polymorphic probes.
Our results have demonstrated that FISH allows a complete evaluation of the NB’s
important genetic abnormalities and that unbalanced abnormalities are detected very
precisely by SNP. 14q abnormalities seem to be associated with clinical factors such
as tumor grading and evolution, unlike AKT abnormalities. Analysis of 14q abnormalities revealed three genes of interest, MAX, BCL11B and GPHN, which should be analyzed on a larger sample.
Thereby, FISH study seems appropriate to detect the NB’s classic genetic
abnormalities, while those found in 14q represent potential therapeutic targets for this tumor.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:umontreal.ca/oai:papyrus.bib.umontreal.ca:1866/4867 |
| Date | 08 1900 |
| Creators | Arsenault, Marie-Pier |
| Contributors | Sartelet, Hervé, Fetni, Raouf |
| Source Sets | Université de Montréal |
| Language | French |
| Detected Language | French |
| Type | Thèse ou Mémoire numérique / Electronic Thesis or Dissertation |
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