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Tese_defesa_Paolla M. V. Abreu_para capa dura.pdf: 9884169 bytes, checksum: 4a899fd021d8b6129d63eb15679acdaf (MD5) / CAPES / O mamoeiro (Carica papaya L.) é uma das fruteiras mais cultivadas e o mamão um
dos frutos mais consumidos nas regiões tropicais e subtropicais do mundo. O Brasil
é um dos maiores produtores mundiais de mamão e está dentre os principais países
exportadores. As doenças, no entanto, constituem os principais fatores limitantes da
produção. A meleira do mamoeiro, causada pelo Papaya meleira virus (PMeV) é
uma doença importante na produção de mamão capaz de causar a perda completa
da produção. Apesar disso, pouco se conhece sobre os mecanismos de interação e
de resposta do mamoeiro contra o PMeV e ainda não existe no mercado cultivares
resistentes a este vírus. Sabe-se que a expressão de proteínas como a subunidade
20S do proteasoma é maior durante a infecção, sugerindo que a proteólise seja um
mecanismo importante de resposta de defesa. Atualmente 10.598 microRNAs de
plantas estão depositados no banco de dados Plant miRNAs Database, mas
somente dois, miR162 e miR403 são codificados especificamente por C. papaya.
Neste estudo, sequências conhecidas de microRNAs provenientes de diferentes
espécies de plantas foram utilizadas na predição in silico de microRNAs no genoma
de mamoeiro. Um total de 462 microRNAs foram preditos, representando 72 famílias
de miRNAs conhecidas. A expressão de 11 microRNAs, cujos alvos estão
envolvidos na degradação via proteasoma 20S e 26S e em outras vias de resposta a
estresse, foi comparada por qRT-PCR em amostras de folhas de plantas sadias e
infectadas com PMeV. A expressão de microRNAs envolvidos na degradação de
proteínas via proteasoma aumentou em resposta a um baixo acúmulo relativo de
PMeV e diminuiu com o aumento do acúmulo relativo viral. Por outro lado, a
expressão de microRNAs envolvidos na resposta da planta ao estresse biótico
diminuiu em resposta ao baixo acúmulo relativo viral e aumentou com o aumento do
acúmulo relativo de PMeV. Os genes descritos como alvos de alguns dos miRNAs
tiveram sua expressão modulada de uma maneira dependente. Diante dos
resultados, alguns miRNAs foram apontados como importantes para a aplicação
biotecnológica. Este estudo representa uma compreensiva predição de microRNAs
em mamoeiro. A expressão diferencial de microRNAs específicos e a modulação de
seus genes alvos é de grande ajuda para entender a interação particular entre o
mamoeiro e o PMeV, responsável pelo desenvolvimento da meleira. / Carica papaya L. is one of the most cultivated and consumed fruits in tropical and
subtropical regions worldwide. Brazil is among the largest producers and exporters of
papaya fruit. The pre-harvest diseases of papaya plants are the main limitation for
fruit production. Papaya sticky disease is caused by the Papaya meleira virus
(PMeV). It is a commercially important pathology in papaya culture potentially
causing the complete loss of fruit production. Despite of this, little is known about the
papaya interaction and response mechanisms against PMeV and there is not a
papaya variety resistant to the virus. It is known that papaya 20S proteasome subunit
levels of increase during PMeV infection, suggesting that proteolysis is an important
feature of the plant defense response mechanisms. To date, 10,598 plant microRNAs
have been identified in the Plant miRNAs Database (name of the DB), but only two
microRNAs, miR162 and miR403, are from papaya. In this study, plant microRNA
sequences were used to search for putative microRNAs in the papaya genome. A
total of 462 microRNAs, representing 72 microRNA families, were predicted to occur
in papaya. Out of these, the expression of 11 microRNAs, whose targets are known
to be involved in 20S and 26S proteasomal degradation and in other stress response
pathways, was estimated using real-time PCR, comparing healthy and infected
papaya leaf tissues. The expression of miRNAs involved in proteasomal degradation
increased in response to very low levels of PMeV titre and decreased as the viral titre
increased. In contrast, biotic stress-related miRNAs levels decreased in papaya
tissues infected with low virus titre and increased at high PMeV levels. Corroborating
this results, analysed target genes for this miRNAs had their expression modulated in
a dependent manner. With the results, some miRNAs were identified as relevant to
the biotechnological application. This study represents a comprehensive prediction of
miRNAs in papaya. The data presented here might help to complement the available
molecular and genomic tools for the study of papaya. The differential expression of
specific miRNAs and the modulation of their target genes will be helpful for
understanding the particular interaction of PMeV and papaya responsible of disease
development
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:dspace2.ufes.br:10/1888 |
| Date | 26 February 2015 |
| Creators | Abreu, Paolla Mendes do Vale de, Abreu, Paolla Mendes do Vale de |
| Contributors | Zanettini, Maria Helena Bodanese, Silva, Maite Vaslin de Freitas, Rodrigues, Silas Pessini, Fernandes, Antônio Alberto Ribeiro, Fernandes, Patrícia Machado Bueno |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | text |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFES, instname:Universidade Federal do Espírito Santo, instacron:UFES |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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