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Previous issue date: 2009-02-17 / Objectives: (i) to identify risk factors for S. pneumoniae penicillin nonsusceptible
isolates (PNSp) in children attending day-care centers (DCCs) in Goiânia, Brazil and to
assess the genetic patterns of pneumococcal isolates; (ii) to estimate the coverage for
carriage serotypes for the 7-valente (PCV7) pneumococcal conjugate vaccine, and for
the investigational 10 (PCV10) and 13-valent (PCV13) vaccines; (iii) to assess the
genetic relatedeness between isolates expressing capsular type 14 and those non(sero)-
typeable isolates (NTPn); (iv) to investigate if carriage isolates match genetically to any
international pneumococcal clone (PMEN network).
Methods: A cross-sectional survey of carriage PNSp was conducted among 1.192
children, 2 months to 5 years of age, attending 62 DCCs in Central Brazil. Capsular
typing was performed in PNSp isolates (CLSI, 2007) and in a sample of isolates
susceptible to penicillin (PSSp) matched to PNSp and DCCs whenever possible.
Serotyping was performed by Quellung reactions and confirmed by multibead assay.
NTPn isolates and serotype 14 were tested by PCR for capsule genes. Odds ratio for
PNSp carriage and respective 95% confidence interval (95%CI) were assessed by
logistic regression. Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) was applied to assess the
genetic similarity between PNSp serotype 14 and NTPn isolates. PCR was performed
for the presence of pneumococcal capsule gene locus. For comparison purpose we also
evaluated the genetic profile of PNSp serotype 14 invasive strains derived from the
current pneumococcal invasive disease surveillance for the same pediatric population.
Isolates were epidemiologically related if they shared ≥80% similarity on the
dendrogram (Dice coefficient). A cluster was defined as three or more related isolates.
Results: A total of 686 pneumococci were isolated for a colonization rate of 57.6% and
178 (25.8%) were PNSp. Among the PNSp isolates the usual common types were
found: 14 (53%), 23F (10.2%), 6B (6%), 19F (4.8%) and 19A (4.2%). PSSp isolates
displayed 30 different serotypes although serotype 14 was the most common. Overall a
high prevalence of NTPn (11.1%) was observed with 62.9% PNSp. Serotypes coverage
xvi
for the PCV7, PCV10 and PCV13 vaccines were 55.2%, 55.9% and 65.1%,
respectively. Being less than 24 months of age (OR=1.79; p=0.006), hospitalization in
the previous three months (OR=2.19; p=0.025), and recurrent acute otitis media
(OR=2.89; p=0.013) were independently associated with PNSp in a multivariate model.
Among the 123 PNSp submitted to PFGE (106/carriage and 17/ invasive isolates) a
major group of 34 serotype 14 strains (8 invasive and 26 carriage) was identified and
found to be genetically related to the global pneumococcal clone Spain 9V-3 (82.7%
similarity). All NTPn presented capsule gene locus and 10 (45.4%) of them presented
capsule gene locus to type 14.
Conclusions: (i) DCC attendees with history of recurrent AOM could significantly
contribute to the spread of nasopharyngeal PNSp strains into the community; (ii)
epidemiologic and molecular evidences support the findings that pneumococcal
nonypeable carriage isolates are genetically similar to carriage and invasive isolates
expressing capsular type 14; (iii) carriage and invasive isolates circulating in Goiânia
belong to a serotype 14 variant of the Spain 9V -3 clone and play a critical role in the
spread of PNSp strains to the entire pediatric community of Goiânia / Objetivo: (i) identificar fatores associados à colonização nasofaríngea por S.
pneumoniae não suscetíveis à penicilina em crianças que frequentam creches no
município de Goiânia-GO e caracterizar geneticamente as cepas não suscetíveis; (ii)
determinar a cobertura das vacinas conjugadas pneumocócicas 7, 10 e 13 valente; (iii)
avaliar o relacionamento genético entre cepas do sorotipo 14 e pneumococos não
tipáveis (PnNT); (iv) identificar a presença de cepas colonizadoras relacionadas
geneticamente aos clones internacionais de S. pneumoniae.
Metodologia: Um estudo de prevalência de portador de pneumococo não suscetível à
penicilina (SpNP) foi conduzido de agosto a dezembro de 2005, em 1192 crianças de
dois a 59 meses de idade, atendidas em 62 creches em Goiânia. Os testes de
suscetibilidade antimicrobiana seguiram as recomendações do CLSI de 2007 e a
sorotipagem foi realizada pela reação de Quellung e confirmada por ensaio multibead.
Isolados PnNT e do sorotipo 14 foram analisados por reação de PCR. Odds ratio para
portador de SpNP e respectivos intervalos de 95% de confiança foram estimados por
regressão logística. Para avaliar a similaridade genética entre os isolados de portador
(sorotipo 14 e PnNT) e isolados invasivos (sorotipo 14) obtidos de crianças de Goiânia
utilizou-se amostras de isolados invasivos de um estudo maior de vigilância
populacional que vem sendo conduzido desde 2007. Assim, eletroforese em campo
pulsado (PFGE) foi utilizada para a tipagem molecular. Definiu-se como linhagem a
presença de três ou mais cepas resistentes com similaridade genética ≥ 80%.
Resultados: S. pneumoniae foi isolado de 686 (57,6%) crianças das creches e 178
(25,9%) dessas eram portadoras de SpNS. Sorotipo 14 (53%), 23F (10,2%), 6B (6%),
19F (4,8%) e 19A (4,2%) estavam presentes em 78,2% dos PnNS. Detectou-se alta
prevalência (11,1%) de isolados não tipáveis, dos quais 62.9% eram resistentes à
penicilina. A cobertura dos sorotipos colonizadores para as vacinas 7-valente, 10-
valente e 13-valente foi respectivamente 55,2%, 55,9% e 65,1%. Crianças menores de
24 meses de idade (OR=1,79; p=0,006), hospitalização nos últimos três meses
(OR=2,19; p=0,025), e otite média aguda recorrente (OR=2,89; p=0,013) foram fatores
xiv
independentemente associados com SpNS na análise multivariada. Entre os 123
isolados submetidos à PFGE, 106 eram de nasofaringe de crianças das creches, dos
quais 84 expressavam a cápsula tipo 14 e 22 eram isolados PnNT. Todas as cepas
invasivas eram sorotipo 14. A maior linhagem agrupou 34 pneumococos do sorotipo 14,
com 82,7% de similaridade, os quais foram geneticamente relacionados ao clone Spain
9V-3. Todas as cepas PnNT apresentaram locus para o gene da cápsula para o tipo 14.
Houve uma diferença estatisticamente significante entre os valores da CIM para a
penicilina entre as três principais linhagens (Krukal-Wallis, p<0,001).
Conclusões: (i) crianças com otite média recorrente podem exercer papel importante na
disseminação de pneumococos resistentes para a comunidade; (ii) Evidências genéticas
apóiam os achados de que cepas de pneumococo não tipáveis assemelham-se ao
genótipo das cepas do sorotipo 14; (iii) isolados de portadores e invasivos que circulam
em Goiânia pertencem a um sorotipo 14 variante do clone Spain9V-3, responsável pela
disseminação da resistência do pneumococo na população pediátrica de Goiânia
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tde/1586 |
| Date | 17 February 2009 |
| Creators | FRANCO, Cáritas Marquez |
| Contributors | ANDRADE, Ana Lúcia Sampaio Sgambatti de |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Doutorado em Medicina Tropical, UFG, BR, Ciências da Saúde |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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