La matrice extracellulaire est un réseau tridimensionnel complexe qui joue le rôle de support aux cellules ainsi que de réservoir de molécules bioactives régulant le comportement cellulaire. Elle est composée de 1027 protéines chez l’Homme (Naba et al., Matrix Biol. 2016), 274 protéines constituant le matrisome et 753 associées (facteurs de croissance et protéines régulatrices de la matrice extracellulaire) et de 6 glycosaminoglycanes dont 5 sulfatés. La matrice extracellulaire est impliquée dans de nombreuses pathologies (Bonnans et al., Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2014). La lysyl oxydase, responsable de la réticulation des collagènes et de l’élastine est impliquée dans de nombreux cancers. La matrice extracellulaire est un réservoir de fragments bioactifs, nommés matricryptines, qui sont libérés par protéolyse des biomolécules de la matrice et régulent de nombreux processus biologiques tels que l’angiogenèse et l’adipogenèse (Ricard-Blum et Vallet Matrix Biol. 2017). Nous avons exprimé en cellules humaines plusieurs matricryptines dont les ectodomaines des collagènes membranaires XIII, XVII, XXIII et XXV et identifié leurs partenaires extracellulaires. Nous avons caractérisé le propeptide de la lysyl oxydase par SEC-MALS, diffusion dynamique de la lumière et par SAXS et avons modélisé à partir des données de SAXS sa structure tridimensionnelle. Nous avons identifié 17 nouveaux partenaires de ce fragment et analysé le mutant Arg158Gln dépourvu d’activité biologique. Cette mutation identifiée chez l’Homme inhibe les activités anti-prolifératives du propeptide et est associée à un risque accru de cancer du sein (Min et al., Cancer Res. 2009). Nous avons exprimé la lysyl oxydase mature et modélisé sa structure tridimensionnelle en utilisant toutes les données disponibles. Les interactions identifiées au cours de ce travail ont été associées à celles obtenues par curation manuelle de la littérature pour construire la première version de l’interactome extracellulaire humain / The extracellular matrix is an intricate tridimensional network supporting cells and a bioactive molecule reservoir involved in the regulation of cell behavior. It is composed of 1027 proteins in humans (Naba et al., Matrix Biol. 2016), including 274 of the core matrisome and 753 associated proteins (growth factors and extracellular matrix regulators) and 6 glycosaminoglycans including 5 sulfated. The extracellular matrix is altered in numerous pathologies (Bonnans et al., Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2014). The lysyl oxidase is responsible for the cross-linking of collagens and elastin and is involved in many cancers. The extracellular matrix is a reservoir of bioactive fragments named matricryptins which are released by proteolysis of extracellular matrix proteins and regulate numerous biological processes like angiogenesis and adipogenesis (Ricard-Blum et Vallet, Matrix Biol. 2017). We have expressed under a recombinant form in human cells some matricryptins including the ectodomains of the membrane collagens XIII, XVII, XXIII and XXV and have identified their extracellular partners. We have characterized the propeptide of lysyl oxidase by SEC-MALS, dynamic light scattering, and SAXS and have built a coarse-grained 3D model by SAXS-derived constraints. We have identified 17 new partners of this fragment and analyzed the mutant Arg158Gln which has no biological activity. This mutation has been identified in humans and inhibits the propeptide anti-proliferative properties. It is associated to an increased risk of breast cancer (Min et al., Cancer Res. 2009). We have expressed the mature lysyl oxidase and modelled its tridimensional structure using available data. All the interactions identified in this study were associated to manually curated interactions described in the literature to build the first version of the human extracellular interactions network
| Identifer | oai:union.ndltd.org:theses.fr/2018LYSE1296 |
| Date | 14 December 2018 |
| Creators | Vallet, Sylvain D. |
| Contributors | Lyon, Ricard-Blum, Sylvie |
| Source Sets | Dépôt national des thèses électroniques françaises |
| Language | French |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation, Text |
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