[pt] A aparição do HIV na década de 80 e de outros vírus
presentes no sangue dos doadores, assim como a expansão de
doenças como a hepatite C, tem estimulado as pesquisas para
desenvolver substitutos do sangue. Pesquisas recentes têm
sido realizadas em derivados artificiais da albumina de
soro humano (human serum albumin - HSA) associados com
heme, representando uma linha promissora nesse sentido. No
presente trabalho, fazemos um estudo computacional da
ligação do heme e de seu precursor, a protoporfirina IX,
com a HSA, com o objetivo de conhecer os aminoácidos que
contribuem à estabilidade da ligação, a natureza do sítio
de ligação, a formação de possíveis sítios secundários de
ligação e a influência das porfirinas na estrutura global
da proteína. Para conseguir este objetivo ut ilizamos
técnicas de cálculo quântico usando a Teoria do Funcional
de Densidade, Docking Molecular e Dinâmica Molecular.
Finalmente fazemos um estudo da correlação existente entre
as diferentes regiões da HSA e de como este padrão muda na
presença das porfirinas. Para este propósito usamos os
coeficientes de correlação generalizada baseados na
formulação de Kraskov. Com base nestas informações,
discutimos a contribuição que poderiam fornecer nossos
cálculos para a reengenharia do HSA, no sentido de
fornecer- lhe características de hemoproteínas. / [en] The uprising of HIV and other viruses in the beginning of
the 80s, as well as the expansion of other diseases like
hepatitis C has stimulated research in order to develop
blood substitutes. Research based on modified Human Serum
Albumin associated with heme has shown a promissory line in
this direction. In the present work we make a computational
study about the heme and its precursor, the Protoporphyrin
IX complexed with HSA, in order to know the contribution of
the main amino acids to the stability of the binding, the
character of the binding site, secondary binding sites
formation, and the influence of the porphyrins in the
global protein structure. To find this objective we use
quantum calculations based on Functional Density Theory,
Molecular Docking and Molecular Dynamics. Finally, a
correlation study between different regions of HSA and the
pattern modifications caused by the porphyrins were
performed, using the generalized correlation coefficients
based on the Kraskov formulation. We also discuss the
contribution that our calculations could give to the
reengineering of HSA, to provide them with hemeprotein
characteristics.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:puc-rio.br/oai:MAXWELL.puc-rio.br:12201 |
| Date | 17 September 2008 |
| Creators | TEOBALDO RICARDO CUYA GUIZADO |
| Contributors | SONIA RENAUX WANDERLEY LOURO |
| Publisher | MAXWELL |
| Source Sets | PUC Rio |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | TEXTO |
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