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Modelos probabilísticos de recombinación en genómica

Tesis para optar al grado de Magíster en Ciencias de la Ingeniería, Mención Matemáticas Aplicadas / Memoria para optar al título de Ingeniero Civil Matemático / En este trabajo se estudia la recombinación de genes a tiempo continuo, esto es la evolución
bajo la dinámica de recombinación de la distribución genética de una población. Por un
lado se cuenta con la generalidad de recombinaciones arbitrarias e incluso permitiendo una
cantidad arbitraria de padres. Por otro lado se trabaja bajo la hipótesis de población infinita
lo que lleva como ventaja, según lo visto en [17], [11] o [12], que la distribución de genes
esté determinada por una ecuación diferencial determinista en el espacio de las medidas.
Al resolver esta se obtiene que es la esperanza de un proceso estocástico, conocido como el
proceso de fragmentación. Uno de los primeros resultados es una demostración alternativa
de este hecho. Luego se busca una fórmula para la ley del proceso. En un contexto similar el trabajo reali-
zado en [11] da una fórmula recursiva, bajo ciertas hipótesis sobre las tasas de recombinación.
Basándonos en las técnicas desarrolladas en ese trabajo y en [12], [25], [4] se deduce otra fór-
mula que sirve para tasas, recombinaciones y una cantidad de padres arbitraria, bajo hipótesis
similares. La clave es relacionar el proceso de fragmentación con una familia de grafos, los
cuales denominaremos bosques de fragmentación. Estos fueron propuestos originalmente por
Mareike Esser en [12] como generalización de los bosques de segmentación encontrados en [4].
Aquí, salvo modificaciones necesarias para la notación, serán la herramienta principal para
obtener los resultados. Además esta fórmula permite apreciar que la hipótesis sobre las tasas
es para evitar ciertas singularidades que aparecen al realizar los cálculos en el grafo. Una vez
que se entiende esto, se discute como extender las soluciones relajando la condición sobre las
tasas. Además de lo anterior, se investiga el comportamiento asintótico del proceso de fragmen-
tación. Una gran cantidad de resultados interesantes fueron obtenidos por Servet Martínez
en [19] para el proceso a tiempo discreto, incluyendo distribución cuasi-estacionaria y una
descripción para el Q-proceso. Aquí se obtienen los que son la adaptación natural al tiempo
continuo. Es decir, se obtiene un teorema que caracteriza el comportamiento asintótico del
proceso de fragmentación y de este se deduce el comportamiento cuasi-estacionario. Por último se hace una síntesis de los resultados obtenidos y se discuten posibles exten-
siones a problemas relacionados. / CMM - Conicyt PIA AFB170001

Identiferoai:union.ndltd.org:UCHILE/oai:repositorio.uchile.cl:2250/151790
Date January 2018
CreatorsLetter Restuccia, Ian Patrick
ContributorsMartínez Aguilera, Servet, Baake, Ellen, San Martín Aristegui, Jaime, Matamala Vásquez, Martín
PublisherUniversidad de Chile
Source SetsUniversidad de Chile
LanguageSpanish
Detected LanguageSpanish
TypeTesis
RightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Chile, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/

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