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Análise in silico da Expressão Diferencial de Transcritos SuperSAGE de Proteínas Quinases em Cana-de-Açúcar em Resposta ao Déficit Hídrico

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Previous issue date: 2013 / FINEP / Estudos de expressão gênica diferencial associados a perfis metabólicos de
plantas submetidas a um estresse alvo são abordagens valiosas na compreensão da
tolerância vegetal. Por sua vez, proteínas quinases são importantes componentes da
sinalização celular, catalisando a transferência do grupo fosfato de uma molécula de
ATP para um substrato, em processo chamado fosforilação, com participação ativa
na aclimatação às mudanças ambientais. O presente trabalho teve como objetivo
comparar in silico perfis de transcrição, de unitags SuperSAGE diferencialmente
expressas e anotadas como prováveis quinases, de genótipos de cana-de-açúcar
tolerantes e sensíveis ao déficit hídrico (24 h de supressão de rega). Para tanto,
sequências expressas (EST) de gramíneas, de diversos bancos de dados públicos,
similares às unitags (análises BLASTn), foram caracterizadas em termos de
Ontologia Gênica, que conjuntamente com as anotações das EST permitiram
identificar e classificar as quinases em famílias. Através dos respectivos números de
Classificação Enzimática (EC), mapas metabólicos foram gerados, permitindo
comparar os grupos de genótipos contrastantes (tolerantes e sensíveis ao estresse).
Foram observadas 539 prováveis quinases, que distribuídas em 41 famílias e em 18
vias metabólicas, quando associadas às unitags, permitiram discuti-las com base em
oito classes hierárquicas funcionais. Importantes diferenças na expressão desses
transcritos mapeados como quinases, entre os grupos de genótipos tolerantes e
sensíveis, após 24 h de supressão de rega, foram observadas neste trabalho,
contribuindo para um melhor entendimento da percepção do estresse aplicado,
podendo ser útil ao melhoramento genético da cana-de-açúcar.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/13108
Date31 January 2013
CreatorsCorreia, Carolina Neves
ContributorsKido, Ederson Akio
PublisherUniversidade Federal de Pernambuco
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguageBreton
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE
RightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess

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