Return to search

Analysis of organic compounds in the rhizosphere soil of Cyperus rotundus using LC-MS / Analys av organiska föreningar i rhizosfärsjord från Cyperus rotundus med LC-MS

Den presenterade studien hade som syfte att utveckla en extraktions-, provpreparerings- och analysmetod för jorden, i vilken gräset Cyperus rotundus växer, i ett försök att identifiera möjliga äggläggningsattraherande ämnen för myggan Anopheles gambiae. Högupplösande vätskekromatografi med hydrofob stationär fas (RP-HPLC, en.) med Masspektrometri med Elektrosprejjonisering (ESI-MS, en.) användes för separation och detektion av de extraherade proverna. Ett flertal extraktionssatser gjordes, där parametrar och tekniker ändrades under utvecklingen av arbetet. Ultraljudsassisterad extraktion (UAE) av jord i en 50:50 (v/v) blandning av metanol och vatten visades vara mest effektiv av de undersökta metoderna. Upprening av jordextraktioner med fastfasextraktion (SPE, en.) visades ha en positiv inverkan på signalintensiteten i kromatogrammen såväl som att reducera intensiteten av de systemtoppar som eluerar vid dödtiden. Detta indikerar att de poläraste ämnena har renats bort. En jämförelse gjordes mellan en extraktion av jord som legat i blöt i fem dagar och jord som extraherats utan att blötläggas. En skillnad kunde ses och visades genom att jämföra kromatogram och masspektra från de två proverna. Tandem-MS-experiment gjordes för ett flertal prekursorjoner med avsikt att identifiera ämnena genom jämförelse med databaserna Human Metabolome Database (HMDB), Metlin och Massbank, men inga överrensstämmande jämförelser kunde göras. Tandem-MS-resultaten användes även för att jämföra efter varandra följande kromatografiska toppar med liknande MS1-spektrum. En identifieringsmetod bör utvecklas innan metoden som presenterats i detta arbete valideras och vidareutvecklas. / The present study aimed to develop an extraction, sample preparation and analysis method for the rhizosphere soil of the grass Cyperus rotundus in an attempt to identify possible oviposition attractants of the Anopheles gambiae mosquito. Reversed Phase High Performance Liquid Chromatography (RP-HPLC) coupled online with Electrospray Ionization Mass spectrometry (ESI-MS) was used for the separation and detection of the extracted samples. Multiple extraction batches were done, altering parameters and techniques along the way. Ultrasound-Assisted Extraction (UAE) of the soil with a 50:50 (v/v) mixture of methanol and water was determined to be the most effective of the attempted methods. Purifying soil extracts with Solid Phase Extraction (SPE) showed to have an impact on the signal intensities in the chromatogram as well as reducing the intensity of system peaks eluting at the dead-time. This indicates that more polar compounds were removed during the SPE purification. A comparison was done between an extraction of soil soaked in water for five days and soil extracted without prior wetting. A difference could be seen and was shown by comparing chromatograms and mass spectra from the two samples. Tandem MS experiments were done for multiple precursor ions in order to identify the compounds by comparison in databases Human Metabolome Database (HMDB), Metlin and Massbank, but no matches in the databases were found. The tandem MS results were also used for comparison of consecutive chromatographic peaks with similar MS1-spectra. An identification method should be developed before the method presented in this work is validated and optimized further.

Identiferoai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:kth-291534
Date January 2018
CreatorsRuotsalainen, Daniel
PublisherKTH, Kemi
Source SetsDiVA Archive at Upsalla University
LanguageEnglish
Detected LanguageEnglish
TypeStudent thesis, info:eu-repo/semantics/bachelorThesis, text
Formatapplication/pdf
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
RelationTRITA-CBH-GRU ; 2020:299

Page generated in 0.0028 seconds