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SuperSAGE: identificação e análise de genes super e sub regulados em soja (Glycine max) sob condições de desidratação radicular

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-13T12:16:01Z
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Previous issue date: 2014-02-28 / A soja (Glycine max) é o principal produto do agronegócio nacional. A despeito de sua
importância estratégica e dos progressos de seus programas de melhoramento, essa cultura
ainda sofre severas perdas devido à ocorrência de condições adversas, com ênfase à seca.
Desta forma, a adição de tecnologias que propiciem o uso de novas ferramentas no
melhoramento, se faz imperativo. Os trabalhos aqui apresentados tiveram como objetivos
analisar os transcriptomas de acessos contrastantes (tolerante e sensível) de soja, submetidos
à desidratação radicular, visando o seu entendimento e mineração de possíveis alvos
moleculares para aplicação no melhoramento da referida espécie. Análises globais dos
transcriptomas produzidos indicaram que tais acessos expressaram 120.770 tags
DeepSuperSAGE, dos quais 1.127 foram induzidos somente no acesso tolerante, enquanto
que 1.557 foram induzidos em ambos, quando comparados aos acessos seus respectivos
controles. A categorização do transcriptoma via ferramenta Gene Ontology, indicou que
CDPK e CBL foram as famílias proteicas com maior número de representantes induzidos
para a categoria “Função Molecular”. Adicionalmente, a validação de nove transcritos
(HMGR, XET, WRKY20, RAP2-4, EREBP, NAC3, PER, GPX5 e BMY) indicou que a
partir de 25 minutos de submissão do estresse os transcriptomas dos acessos analisados já
são submetidos à reorganização para enfrentar a nova condição imposta. Em outro trabalho,
foi realizada mineração de dados nas bibliotecas analisadas, buscando-se transcritos
específicos associados à osmoproteção. Foram encontrados 35 unitags diferencialmente
expressas associadas a quatro classes de osmoprotetores, sendo: prolina (P5CS: 4 transcritos,
P5CR: 2 transcritos), trealose (TPS1: 9, TPPB: 1), glicina betaina (BADH: 4) e myo-inositol
(MIPS: 7, INPS1: 8)], os quais foram mapeados em 25 loci no genoma de soja. A análise da
genômica estrutural dos genes ancoradores das referidas unitags indicou que os mesmos
estão presentes em todos os cromossomos da espécie analisada, com alta densidade para
algumas regiões subterminais e sintenia observada entre alguns pares cromossômicos. Tais
genes e loci são importantes alvos para futuros ensaios, visando obtenção de maior
tolerância ao estresse aqui analisado. Dessa forma os trabalhos aqui apresentados fornecem
recursos inéditos de genômica funcional para aplicação no melhoramento de soja, sendo
que, o desdobramento biotecnológico dos dados aqui obtidos auxiliará na manutenção da
estabilidade da cadeia produtiva dessa cultura e diminuição de perdas econômicas.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/12324
Date28 February 2014
CreatorsFERREIRA NETO, José Ribamar Costa
ContributorsKIDO, Ederson Akio, BENKO-ISEPPON, Ana Maria
PublisherUniversidade Federal de Pernambuco
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguageBreton
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE
RightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess

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