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Previous issue date: 2017-02-22 / FACEPE / O processamento e a análise de imagens caracterizam-se em 5 fases: aquisição, préprocessamento, segmentação, representação/descrição, e reconhecimento de imagens. Este trabalho situa-se na área de segmentação de imagens médicas 2D. O principal objetivo da segmentação consiste em dividir uma imagem em regiões ou objetos que a compõem. A segmentação de imagens é alvo de vários estudos e pesquisas para o desenvolvimento de métodos mais abrangentes e computacionalmente mais eficientes, principalmente em imagens médicas. Uma etapa crucial para a extração de informações automatizadas em imagens médicas, geralmente envolve a segmentação das regiões da imagem a fim de quantificar volumes e áreas de interesse de tecidos biológicos para posterior diagnóstico e localização de patologias. Um desafio importante que deve ser levado em consideração no desenvolvimento de algoritmos de segmentação de imagens médicas é como avaliar o desempenho do método. Este tipo de avaliação de desempenho geralmente é feito através da comparação dos resultados de algoritmos automáticos versus uma segmentação de referência, denominada de ground-truth. Em particular, a estimativa de ground-truth em imagens médicas pode ser obtida através do contorno manual ou ainda através de métodos interativos de segmentação. No entanto, essas abordagens podem ser extremamente trabalhosas e sujeitas a variabilidades inter e intra usuários. Uma alternativa para diminuir essa variabilidade é a segmentação utilizando o consenso da resposta de vários usuários para uma mesma imagem. Um método de consenso de segmentações tem a finalidade de combinar várias segmentações de uma mesma imagem. Este trabalho tem como principal objetivo propor uma abordagem para estimar o ground-truth em imagens médicas. A abordagem consiste nas duas principais contribuições deste trabalho. Na primeira, um novo sistema colaborativo COSE (Collaborative Segmentation) foi desenvolvido para obter várias segmentações de uma mesma imagem com o intuito de estimar o ground-truth. Já a segunda, propõe um novo método para o consenso de segmentações de imagens médicas, denominado ISECO (Intelligent SEgmentation COnsensus). Os principais métodos de consenso de segmentações utilizam apenas informações binárias. No entanto, o ISECO apresenta como principal diferencial o fato de utilizar informações extraídas da imagem em nível de cinza para auxiliar na classificação dos pixels em foreground ou background utilizando um modelo de aprendizagem. A extração de características é baseada em três extratores de textura: filtros de Gabor, Local Binary Pattern (LBP) e Local Directional Pattern (LDP). Outra abordagem para o consenso de segmentações, denominada Distance Transform Merge (DTM) também é proposta neste trabalho tendo como objetivo ser um método simples e rápido. Os métodos de consenso propostos são avaliados e comparados com outras abordagens disponíveis na literatura utilizando 4 bases de imagens. A avaliação das abordagens mostra que o ISECO apresenta resultado tão bom ou melhor que os principais métodos da literatura. / Image processing is characterized by five steps: acquisition, pre-processing, segmentation, representation/description and image recognition. In this thesis, we work with the problem the 2D medical image segmentation. The main purpose of image segmentation is to divide an image into regions. Image segmentation has been a subject of several studies and research for the development of more comprehensive and computationally more efficient methods, especially in medical imaging. A challenge that must be taken into account in the development of medical image segmentation algorithms is how to evaluate the performance of the method. This type of performance evaluation is usually done by comparing the results of automatic algorithms versus a reference segmentation, called the ground-truth. In particular, the estimation of ground-truth in medical images can be obtained through manual segmentation or interactive segmentation methods. However, these approaches can be extremely subjective and subject to both intra and inter user variability. An alternative to reduce this variability is image segmentation using the consensus of multiple segmentations of a single image. A segmentation consensus method has the purpose of combining multiple segmentations of the same image. This work proposes an approach to estimate the ground-truth in medical images. The approach consists of two parts. At first, we development a collaborative system called COSE (Collaborative SEgmentation) to obtain various segmentations of the same image in order to estimate the ground-truth. The second proposals is a new method for the consensus of medical image segmentations, called ISECO (Intelligent SEgmentation CCnsensus). The main consensus segmentation methods in the state-of-the-art uses only binary information. However, the ISECO proposes to use gray-scale image information to classify pixels in foreground or background. However, ISECO has as main differential the use of information extracted from the image in gray-scale to assist in the classification of pixels in foreground or background using a learning model. The features extraction is based on three texture extractors: Gabor filters, Local Binary Pattern (LBP) and Local Directional Pattern (LDP). Another approach to segmentation consensus, called Distance Transform Merge (DTM), is also proposed in this work, aiming to be a simple and fast method. The proposed consensus methods are evaluated and compared with other approaches available in the literature using 4 image database. Evaluation of the approaches shows that the ISECO presents better results than the main methods of the literature.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/25633 |
| Date | 22 February 2017 |
| Creators | OLIVEIRA, Wendeson da Silva |
| Contributors | http://lattes.cnpq.br/3084134533707587, REN, Tsang Ing, CAVALCANTI, George Darmiton da Cunha |
| Publisher | Universidade Federal de Pernambuco, Programa de Pos Graduacao em Ciencia da Computacao, UFPE, Brasil |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE |
| Rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
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