Orientadora: Profa. Dra. Márcia Aparecida Sperança / Tese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2017. / A dengue, causada por quatro diferentes sorotipos do vírus (DENV1-4), é a arbovirose de maior
prevalência em humanos no mundo. Estudos moleculares são necessários para melhor
entendimento de doenças causadas por diferentes sorotipos e variantes genéticas. Em relação á
sua origem e história evolucionária, análises filogenéticas e epidemiológicas sugerem que
genótipos mais virulentos estão substituindo os de menor virulência. Este trabalho teve como
objetivo a caracterização da dinâmica de transmissão e epidemiologia molecular dos DENV
circulantes na cidade de médio porte do Estado de São Paulo, Marília, com 233.639 habitantes,
durante uma epidemia de dengue ocorrida no ano de 2007. Para tanto foram obtidas amostras de
pacientes com diagnóstico clínico e epidemiológico (sem confirmação laboratorial) durante
ocorrência de epidemia de dengue. O estudo comparativo de características hematológicas e
demográficas dos pacientes com a presença de antígeno NS1 de DENV nas amostras revelou
associação significante com leucopenia e plaquetopenia (medianas: DENV+= 3.715 células/mL e
DENV- = 6.760 células/mL; e medianas: DENV+ = 134.896 células/mL e DENV- = 223.872
células/mL, respectivamente), e aumento de linfócitos atípicos. Esse padrão hematológico foi
mantido durante o longo período da epidemia, permitindo que, com a determinação do padrão
conservado nas primeiras fases de uma epidemia, este possa ser usado para implementar medidas
de diagnóstico de novos casos, bem como no controle e tratamento dos doentes em todo o
restante do período. A detecção e identificação do sorotipo viral, por PCR e Nested-PCR,
respectivamente, utilizando como alvo o gene que codifica a junção das proteínas estruturais do
capsídeo e pré-membrana (C/prM), confirmou a co-circulação de DENV1 (33%) e DENV3
(67%) em 2007. A partir das sequências obtidas da junção C/prM dos DENV1 e DENV3 dessas
amostras, foi feita a reconstrução filogenética. Os resultados indicaram que a população de
DENV1 provavelmente se originou da região norte do Brasil, por apresentar pouca variabilidade
genética e alta similaridade com amostras de DENV1 de pacientes de Belém do Pará isoladas no
mesmo ano. A população de DENV3 apresentou variabilidade genética, provavelmente, devido à
microevolução na própria região, visto que as amostras de Marília-SP apresentaram alta
similaridade com amostras de vírus isoladas de pacientes da Venezuela, em 2001. Os dois
sorotipos mostraram padrões hematológicos distintos, nos quais, com o aumento de linfócitos
atípicos houve uma significante maior leucopenia na população de DENV3 e uma tendência a
maior diminuição de plaquetas em DENV1. Os estudos realizados demonstram que a dengue é
uma doença com características regionais específicas. Portanto, a implementação das atividades
de manejo das epidemias dependem da caracterização das variantes genéticas dos DENV e sua
relação com a população acometida. / Dengue, caused by four different serotypes of the virus (DENV1-4), is the most prevalent arbovirose in humans in the world. Molecular studies are needed to better understand diseases caused by different serotypes and genetic variants. In relation to its origin and evolutionary history, phylogenetic and epidemiological analyzes suggest that more virulent genotypes are replacing those of less virulence. This work aimed to characterize the transmission dynamics and
molecular epidemiology of DENV circulating in the medium-sized city of the State of São Paulo,
Marília, with 233,639 inhabitants, during a dengue epidemic occurred in 2007. For this purpose,
samples were obtained of patients with clinical and epidemiological diagnosis (without
laboratory confirmation) during the occurrence of a dengue epidemic. The comparative study of
the hematological and demographic characteristics of patients with the presence of DENV NS1
antigen in the samples revealed a significant association with leukopenia and thrombocytopenia
(median: DENV + = 3,715 cells / mL and DENV- = 6,760 cells / mL; 134,896 cells / mL and
DENV- = 223,872 cells / mL, respectively), and increase of atypical lymphocytes. This
hematological pattern was maintained during the long period of the epidemic, allowing the
determination of the pattern preserved in the first stages of an epidemic, to be used to implement
measures for the diagnosis of new cases, as well as for the control and treatment of patients in
the remainder of the period. Detection and identification of the viral serotype by PCR and
Nested-PCR, respectively, targeting the gene coding for the junction of the capsid and premembrane
(C / prM) structural proteins, confirmed the co-circulation of DENV1 (33 %) and
DENV3 (67%) in 2007. From the sequences obtained from the C / prM junction of the DENV1
and DENV3 of these samples, the phylogenetic reconstruction was performed. The results
indicated that the DENV1 population probably originated from the northern region of Brazil, as
it presents little genetic variability and high similarity with DENV1 samples from patients from
Belém do Pará isolated in the same year. The DENV3 population showed genetic variability,
probably due to the microevolution in the region itself, since the Marília-SP samples presented
high similarity with virus samples isolated from patients from Venezuela in 2001. The two
serotypes showed different hematological patterns in the which, with the increase of atypical
lymphocytes, there was a significant greater leucopenia in the DENV3 population and a
tendency to a greater decrease of platelets in DENV1. Preliminary data from another epidemic
were obtained in 2015, from which we tested 100 positive samples to date, with 87% belonging
to serotype 1 by means of molecular typing using the gene coding for the C / prM junction.
Studies show that dengue is a disease with specific regional characteristics. Therefore, the the
implementation of epidemic management activities depend on the characterization of genetic
variants of DENV and its relationship with the affected population.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:BDTD:106537 |
| Date | January 2017 |
| Creators | Carmo, Andréia Moreira dos Santos |
| Contributors | Sperança, Marcia Aparecida, Sasaki, Sergio Daishi, Puzer, Luciano, Tanaka, Harki, Gregori, Fábio |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf, 144 f. : il. |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFABC, instname:Universidade Federal do ABC, instacron:UFABC |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=106537&midiaext=74704, http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=106537&midiaext=74703, Cover: http://biblioteca.ufabc.edu.brphp/capa.php?obra=106537 |
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