Η μεθυλοτρανσφεράση της θειοπουρίνης (TPMT) είναι ένα ένζυμο του κυτταροπλάσματος, που καταλύει τη μεθυλίωση των θειοπουρινικών φαρμάκων, όπως η 6-μερκαπτοπουρίνη (6-MP), η οποία έχει καθιερωθεί στη θεραπεία συντήρησης παιδιών με ΟΛΛ. Ένα πολυμορφικό στοιχείο (VNTR) στον υποκινητή του γονιδίου ΤΡΜΤ, φαίνεται να επηρεάζει τα επίπεδα δραστικότητας του ενζύμου που παράγεται. Πρόκειται για διαδοχικές επαναλήψεις τριών διαφορετικών αλληλουχιών (A, B και C), ο αριθμός των οποίων κυμαίνεται από τρεις έως εννέα. Η περιοχή VNTR είναι πλούσια σε επαναλήψεις των βάσεων GC, οι οποίες αποτελούν πιθανές θέσεις πρόσδεσης μεταγραφικών παραγόντων.
Μερικοί ασθενείς, οι οποίοι ακολουθούν θεραπεία με 6-ΜΡ, δεν είναι ανθεκτικοί στην καθιερωμένη δόση του φαρμάκου και παρουσιάζουν μυελοτοξικότητα ως αποτέλεσμα της ανεπάρκειας του ενζύμου TPMT.
Στην παρούσα εργασία πραγματοποιήθηκε μία εκτεταμένη μελέτη της περιοχής VNTR, με απώτερο σκοπό την αξιολόγησή της ως πιθανό φαρμακογονιδιωματικό δείκτη, που να σχετίζεται με την πρόβλεψη ανεπιθύμητων παρενεργειών σε ασθενείς με ΟΛΛ, οι οποίοι λαμβάνουν 6-ΜΡ.
Αρχικά, προσδιορίστηκε η συχνότητα των διαφορετικών VNTR αλληλομόρφων στον ελληνικό πληθυσμό, σε ένα σύνολο υγιών ατόμων, με σκοπό να αντιπαραβάλλουμε τις συχνότητες αυτές με δεδομένα από άλλες πληθυσμιακές ομάδες. Τα αποτελέσματά που προέκυψαν συμφωνούν με τα αντίστοιχα στοιχεία που υπάρχουν για άλλους πληθυσμούς. Οι μέθοδοι γονοτύπησης που εφαρμόσθηκαν περιλαμβάνουν την αντίδραση της PCR και τον προσδιορισμό αλληλουχίας κατά Sanger.
Στη συνέχεια μελετήθηκε η επίδραση συγκεκριμένων μοτίβων VNTR στον υποκινητή του γονιδίου υγιών ατόμων, στη μεταγραφή του γονιδίου, καθώς και στην έκφραση του ενζύμου ΤΡΜΤ. Η ικανότητα μεταγραφής εκτιμήθηκε με τη μέθοδο της ποσοτικής Real Time PCR, ενώ τα επίπεδα έκφρασης του ενζύμου προσδιορίστηκαν μέσω της αντίδρασης χημειοφωταύγειας, με χρήση κατάλληλων αντισωμάτων.
Ο μικρός αριθμός δειγμάτων δεν επέτρεψε την εξαγωγή ασφαλών συμπερασμάτων για το ρόλο της VNTR περιοχής, στην μεταγραφή του γονιδίου ΤΡΜΤ. Σύμφωνα με τα αποτελέσματά μας, διακρίνεται μία τάση συσχέτισης, η οποία όμως απαιτεί περαιτέρω διερεύνηση. / Thiopurine S-methyltransferase (TPMT) is a cytosolic enzyme that catalyzes S-methylation of thiopurine drugs, such as 6-mercaptopurine (6-MP), which is typically used as maintenance therapy in pediatric acute lymphoblastic leukemia (ALL). A variable number of tandem repeat (VNTR) within the TPMT promoter has been reported to “modulate” levels of this enzyme activity. The VNTR region architecture is defined by three types of repeats (A, B and C) rang¬ing from three to nine (VNTR*3 to VNTR*9). These repeats are GC rich, and are putative binding sites of various transcription factors.
Some patients do not tolerate standard doses of 6-MP and develop myelotoxicity as a consequence of inherited TPMT deficiency.
In this study, we performed an extensive analysis of VNTR region, in order to evaluate it as a putative pharmacogenomic marker to predict 6-MP toxicity, in ALL patients.
The frequency of TPMT alleles bearing different VNTR architectures was investigated in the Hellenic population. The results of this study were consistent with data, already existed, from other populations. The number and type of tandem repeats were determined by PCR amplification followed by direct re-sequencing.
Moreover, we explored the influence of specific VNTR motifs, within the TPMT promoter of healthy individuals, on transcription and expression of TPMT gene. Quantitative Real-Time PCR was performed in order to investigate the influence of VNTR architecture on TPMT gene transcription. The expression levels of TPMT enzyme were estimated by chemiluminescence reaction, using appropriate antibodies.
The role of VNTR region on TPMT gene transcription was not clarified through this study, owing to small cohort of samples included. A statistical trend of association has been observed, requiring, however, further investigation.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:upatras.gr/oai:nemertes:10889/6325 |
| Date | 11 October 2013 |
| Creators | Κασσελά, Αικατερίνη |
| Contributors | Πουλάς, Κωνσταντίνος, Kassela, Aikaterini, Πατρινός, Γεώργιος, Σπυρούλιας, Γεώργιος |
| Source Sets | University of Patras |
| Language | gr |
| Detected Language | Greek |
| Type | Thesis |
| Rights | 0 |
| Relation | Η ΒΚΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της. |
Page generated in 0.002 seconds