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Previous issue date: 2016-07-12 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The transposable elements are known for their ability to move and integrate into
the genome ofthe host organism randomly. They have two classifications: Class I is the
retrotransposons' class that have as an intermediary transposition RNA, which from it is
synthesized cDNA and this is inserted into the genome. The retrotransposons are
classified in two ways, those with long terminal repeats, called retrotransposons LTRs
and those who do not have this repetition is called retrotransposons not - LTRs. The
retrotransposons not - LTRs can still be classified as LINEs (long interspersed elements)
and SINES (short interspersed elements); Class II is composed of DNA transposons,
which have their own DNA as an intermediary migrating or being directly copied and
inserted into the genome. The Rex1 is retrotransposon not-LTR of Rex family and is
found in several types of organisms. Several studies indicate that the Rex family
retrotransposons have the capacity to respond to environmental stress. In this study we
were made chromosome mapping and the absolute quantification Rex1 in Colossoma
macropomum that have undergone environmental stress by water contamination with
copper. The results corroborate the hypothesis that this retrotransposon has a response
to that kind of stress in the muscle tissue of the Tambaqui. Found in chromosome
mapping by fluorescence in situ hybridization, highest number oftags in animals which
were subjected to stress and images were quantified in the FLIMA software, confirming
that data through the highest fluorescence ratio. In Tambaqui absolute quantitation of
muscle samples from the PCR Real - Time also found larger numbers ofcopies ofRex1
the samples were subjected to environmental stress copper. / Os elementos transponíveis são conhecidos pela capacidade de se mover e se
integrar no genoma do organismo hospedeiro. Eles possuem duas classificações: a
classe I é a classe dos retrotransposons que possuem como intermediário da transposição
o RNA, a partir do qual é sintetizado o cDNA e este é inserido no genoma. Os
retrotransposons são classificados de duas maneiras, os que possuem repetições
terminais longas, chamados de retrotransposons LTRs, e os que não possuem essa
repetição, sendo chamados de retrotransposons não – LTRs. Os retrotransposons não –
LTRs ainda podem ser classificados como LINEs (elementos longos interespaçados) e
SINEs (elementos curtos interespaçados); a classe II é composta por transposons de
DNA, que possuem como intermediário o próprio DNA migrando diretamente ou sendo
copiado e inserido no genoma. O Elemento Retrotransponível Rex1 é um
retrotransposon não LTR da família Rex e é encontrado em vários tipos de organismos.
Vários estudos apontam que os retrotransposons da família Rex possuem a capacidade
de resposta ao estresse ambiental. Nesse estudo foram feitos o mapeamento
cromossômico e a quantificação absoluta de Rex1 em Colossoma macropomum
submetidos a estresse ambiental por contaminação da água com cobre. Os resultados
encontrados corroboram a hipótese de que esse retrotransposon possua uma resposta a
esse tipo de estresse no tecido muscular do Tambaqui. No mapeamento cromossômico
encontramos, através da hibridização in situ por fluorescência, maior número de
marcações em animais que foram submetidos ao estresse e as imagens foram
quantificadas no software FLIMA, confirmando esse dado através do maior coeficiente
de fluorescência. Na quantificação absoluta das amostras de músculo de Tambaqui a
partir da PCR Real – Time, também encontramos maiores números de cópias de Rex1
nas amostras que foram submetidas ao estresse ambiental por cobre.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:localhost:tede/2290 |
| Date | 12 July 2016 |
| Creators | Silva, Hallana Cristina Menezes da |
| Contributors | Matoso, Daniele Aparecida, Ribeiro, Leila Braga |
| Publisher | Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEv), INPA, Brasil, Coordenação de Pós Graduação (COPG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do INPA, instname:Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, instacron:INPA |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -5829914500254207356, 600, 600, 600, 3806999977129213183, -4671505905809893211 |
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