La transcription de l’ADN en ARN constitue la première étape de l’expression d’un gène. Durant les dix dernières années, plusieurs études ont montré qu’environ 80-90% du génome est transcrit et que la transcription peut démarrer presque partout. Ce phénomène, connu sous le nom de transcription envahissante, représente une menace sérieuse contre l’expression correcte du génome car il peut interférer non seulement avec d’autres évènements de transcription mais également avec n’importe quel procédé impliquant l’ADN. Une terminaison sélective est donc un mécanisme de la plus haute importance pour la stabilité du génome et la correcte régulation de l’expression des gènes. Ici nous décrivons la terminaison road-block, un nouveau mécanisme de la terminaison par l’ARN polymerase II, qui a pour fonction de limiter la transcription envahissante et de limiter les conséquences d’une translecture au niveau des sites de terminaison canoniques de S.cerevisiae. Nous démontrons également que plusieurs facteurs de transcription peuvent entrainer cette terminaison et que certains sites génomiques y sont associés. De plus, nous explorons également la possibilité que ces terminaisons road-block puissent contribuer à rendre spécifiques les origines de réplication. / Transcription of DNA into RNA intermediates constitutes the first step in gene expression. During the last decade, several studies showed that about 80-90% of the genome is transcribed, and that transcription can initiate almost anywhere. This process—known as pervasive transcription—represents a serious threat to proper gene expression as it has the potential to interfere with not only other transcription events, but any DNA-based process. Selective transcription termination is therefore a mechanism of paramount importance for genome transcriptome stability and correct regulation of gene expression. Here we describe road-block termination, a novel termination mechanism for RNA polymerase II that functions to limit pervasive transcription and buffer the consequences of readthrough transcription at canonical terminators in S.cerevisiae. We show that several transcription factors can elicit this termination and that a number of unexpected genomic loci are associated with it. Additionally, we explore the possibility that road-block termination might contribute to specification of replication origins.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:theses.fr/2016SACLS587 |
| Date | 12 December 2016 |
| Creators | Candelli, Tito |
| Contributors | Université Paris-Saclay (ComUE), Libri, Domenico |
| Source Sets | Dépôt national des thèses électroniques françaises |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation, Text, Image, StillImage |
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