Pesquisa do vírus TT (Torque Teno Virus) em primatas não humanos e em frangos de corte(Gallus g. domesticus), pela técnica de reação em cadeia pela polimerase (PCR) e caracterização do genoma viral / Research of TT virus (torque Teno Virus) in non-human primates and in chickens of cut (Gallus g. domesticus)by the polymerase chain reaction(PCR) technique and characterization of viral genome

Description

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Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O Torque Teno Vírus (TTV) foi primeiramente identificado em 1997, no Japão, em urn paciente com hepatite aguda pós-transfusão, de etiologia desconhecida, sendo após, caracterizado como urn pequeno vírus DNA circular de fita simples e não envelopado. Recentemente, o Torque Teno Vírus foi classificado em urn novo gênero chamado Anellovírus, que compreende também, o Torque Teno Mini Vírus (TTMV), Torque Teno Midi Vírus (TTMDV) e pequenos anelovírus (SAV). 0 TTV tern sido detectado em uma ampla gama de primatas nao humanos, bem como em animais domésticos. Este trabalho teve por objetivo pesquisar o TTV no soro e sangue total de primatas nao humanos e em plasma de frangos domésticos de corte (Gallus g. domesticus), pela aplicação da Nested-PCR da região não codificadora (UTR) e pel a Semi­Nested-PCR da região codificadora N22, seguido de seqüenciamento genômico e de análise filogenética. Através da Nested-PCR da região não codificadora (UTR) o DNA do TTV foi detectado no soro de 4 (5,3%) de 75 Cebus apella, 2 (40%) de 5 Alouata fusca, 1 (20%) de 5 Alouata caraya, 1 (5.2%) de 19 Callithrix penicilata, 1 (4%) de 25 Callithrix jacchus, 1 (20%) de 5 Saimiri sciureus e 1 (25%) de 4 Leontopithecus chrysomelas. Nao se obteve amplificação por PCR-UTR em nenhuma amostra de sangue total. A análise filogenética revelou que as seqüências detectadas em 8 amostras apresentaram maior identidade com as seqüências de TTV isoladas de macacos japoneses do novo mundo: So-TTV2 (Saüíinus oedipus) e At-TTV3 (Aotes Trivirgatus). Trt!!s seqüências (uma de Callithrix penicilata, uma de Leontopithecus crysomelas e uma de Cebus apella) mostraram similaridade com uma seqüência de Torque Teno Mini Vírus (TTMV) de humanos. Não se obteve amplificação por PCR-UTR em nenhuma amostra de plasma de frangos domésticos de corte (Gallus g. domesticus). Três amostras foram positivas pela amplificação da região ORF2. 0 DNA do TTV da região ORF2 foi detectado em uma amostra de soro de Cebus apella e em uma amostra de sangue total de Callithrix jacchus, e em uma de plasma de frango doméstico de corte (Gallus g. domesticus). As seqüências amplificadas pela região ORF2 nao mostraram diferenças entre as de humano, primatas nao humanos e de frango doméstico Pela Semi-Nested-PCR da região codificadora (N22), o DNA do TTV foi
detectado no sangue total de 3 (4%) de 75 Cebus apella e de 1 (25%) de 4
Leontopithecus chrysomelas. Não se obteve amplificação por PCR em
nenhuma amostra de soro. A análise filogenética revelou que uma amostra de
Cebus apella agrupou-se com seqüências de macacos japoneses do novo
mundo: Saguinus oedipus (So-TTV2) e Aotes trivirgatus (At-TTV3); duas
amostras de Cebus apella mostraram similaridade com uma seqüência de
Torque Teno Mini Vírus (TTMV) de humanos e uma (Cebus apella) mostrando
similaridade com uma seqüência de chimpanzé (Pt-TTV6) e com uma
seqüência de TTV de humano, cepa protótipo denominada TA278. Não se
obteve amplificação por PCR-N22 em nenhuma amostra de plasma de frangos
domésticos de corte (Gallus g. domesticus). Os resultados apresentados
mostraram que este é o primeiro relato da ocorrência de Torque Teno Vírus e
Torque Teno Mini Vírus em primatas não humanos do novo mundo e em
frangos de corte (Gallus g. domesticus) no Brasil. / Torque Teno Virus (TTV) was first identified in the serum of a patient with
acute post-transfusion hepatitis of unknown etiology in 1997 and was
characterized as a small nonenveloped virus with a circular, single-stranded
DNA. Recently, Torque Teno Virus has been classified to the newly genus
called Anellovirus, which also comprises Torque Teno Mini Virus (TTMV),
Torque Teno Midi Virus (TTMDV) and small Anellovirus. TTV has been
detected in a range of non-human primates as well as domestic animals. The
purpose of this study was to search TTV in the serum and total blood of nonhuman
primates and in plasma of domestic chickens of cut (Gallus g.
domesticus) by application the nested-PCR of the non-coding region (UTR) and
by semi-nested-PCR of the coding region (N22), followed by a genomic
sequence and phylogenetic analysis. By nested-PCR of non-coding region
(UTR), the TTV DNA was detected in sera from 4 (5.3%) of 75 Cebus apella, 2
(40%) of 5 Alouata fusca, 1 (20%) of 5 Alouata caraya, 1 (5.2%) of 19 Callithrix
penicilata, 1 (4%) of 25 Callithrix jacchus, 1 (20%) of 5 Saimiri sciureus e 1
(25%) of 4 Leontopithecus chrysomelas. No PCR-UTR amplification in any total
blood sample was obtained. Phylogenetic analysis revealed that sequences
detected in 8 samples had presented greater identity with TTV sequences
isolated of Japanese new world non-human primates (So-TTV2 - Sagüínus
oedipus and At-TTV3 - Aotes Trivirgatus). Three sequences (1 of Callithrix
penicilata, 1 of Leontopithecus crysomelas and 1 of Cebus apella) showed
similarity with a human Torque Teno Mini Virus (TTMV) sequence. No PCRUTR
amplification in any domestic chicken plasma sample was obtained. Three
additional samples were positive by the amplification of the ORF-2 region. TTV
ORF2 DNA was detected in one sera sample of Cebus apella and one whole
blood sample of Callithrix jacchus and in one plasma sample of domestic
chicken of cut (Gallus g. domesticus). The sequences amplified by the ORF2
region showed no differences between human, non-human primates and
domestic chicken. By semi-nested-PCR of coding region (N22), the TTV DNA
was detected in total blood from 3 (4%) out of 75 Cebus apella and from 1
(25%) out of 4 Leontopithecus chrysomelas. No PCR amplification in any serum
sample was obtained. Phylogenetic analysis revealed that one sample of Cebus apella clustered with sequences isolated of Japanese new world non-human
primates (Saguinus oedipus - So-TTV2 and Aotes trivirgatus - At-TTV3); two
samples of Cebus apella showed similarity with a human Torque Teno Mini
Virus (TLMV) sequence. The other sample of Cebus apella showed similarity
with one sequence of the chimpanzee (Pt-TTV6) and with the human TTV strain
called TA278. No PCR amplification any domestic chicken plasma sample was
obtained. The presented results showed that this is the first occurrence of
Torque Teno Virus and Torque Teno Mini Virus in new world non-human
primates and domestic chicken of cut (Gallus g. domesticus) in Brazil. / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Links & Downloads

1. CATROXO, Márcia Helena Braga. Pesquisa do vírus TT (Torque Teno Virus) em primatas não humanos e em frangos de corte(Gallus g. domesticus), pela técnica de reação em cadeia pela polimerase (PCR) e caracterização do genoma viral. 2008. 86 f. Tese (Doutorado em Ciências) – Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, 2008.
2. http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/24123
3. Publico-24123.pdf

Tags

Torque teno virus

Primatas

Galinhas

Additional Fields

Identifer	oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.unifesp.br:11600/24123
Date	January 2008
Creators	Catroxo, Marcia Helena Braga [UNIFESP]
Contributors	Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Diaz, Ricardo Sobhie [UNIFESP]
Publisher	Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Source Sets	IBICT Brazilian ETDs
Language	Portuguese
Detected Language	Portuguese
Type	info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Format	86 f.
Source	reponame:Repositório Institucional da UNIFESP, instname:Universidade Federal de São Paulo, instacron:UNIFESP
Rights	info:eu-repo/semantics/openAccess