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Tese completa Tatiana Prado doutorado BP pdf.pdf: 8757483 bytes, checksum: 8a4d7a0b6c6b6d917034f958c665cd1a (MD5) / Made available in DSpace on 2012-12-27T16:54:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2011 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Este estudo teve como objetivo avaliar a presença de rotavírus (RVA), adenovírus (AdV),
norovírus (NoV) e vírus da hepatite A (HAV) em amostras ambientais (esgoto e lodo de esgoto
primário e tratado) geradas e obtidas em diferentes Estações de Tratamento de Esgoto (ETEs) da
cidade do Rio de Janeiro pela detecção, quantificação e caracterização molecular, assim como
determinar a eficiência de diferentes metodologias de recuperação viral em lodo de esgoto. A
concentração destes vírus foi determinada em ETEs hospitalares que operam por processos
anaeróbios (reator UASB e filtros anaeróbios) e aeróbio (lodo ativado de aeração prolongada) e
em uma ETE urbana de grande porte (Alegria, Caju) que utiliza processo de lodo ativado
convencional. Os resultados demonstraram que os efluentes hospitalares são contaminados com
elevadas cargas virais, especialmente RVA, apontando para o risco da disseminação ambiental
quando processos de tratamento biológicos convencionais (aeróbios e anaeróbios) não são
adequados para a remoção viral. Uma grande variabilidade de genótipos virais foi encontrada nos
efluentes hospitalares, particularmente para AdV, para os quais foram detectadas espécies C e D,
comumente envolvidas em casos de infecções respiratórias e conjuntivite nosocomial. Apenas
genótipo GII.4 de NoV foi detectado nos efluentes hospitalares, confirmando a prevalência desse
genótipo no Brasil. No estudo que avaliou a detecção de HAV nas águas residuárias urbanas foi
constatado que 58% das amostras de esgoto bruto foram positivas para HAV e as cargas de
genomas virais não foram detectadas nos efluentes tratados do processo de lodo ativado
convencional. A análise filogenética baseada na região do genoma VP1/2A de HAV detectados
em 2009-2010 demonstrou a prevalência do subgenótipo IA e os isolados apresentaram maior
identidade de nucleotídeos com isolados de HAV do Brasil e Argentina. A detecção viral obtida
em diversas etapas da ETE de grande porte demonstrou a predominância de RVA e AdV e o
sistema de lodo ativado convencional reduziu as cargas de genomas virais em 1 – 1,5 unidades
log10 no efluente final tratado. A análise da eficiência dos métodos de detecção viral em lodo de
esgoto demonstrou que a presença de inibidores nas amostras afeta o desempenho da amplificação
de ácidos nucléicos e o uso do controle interno (bacteriófago PP7) pode ser adequado para
monitorar as etapas de detecção viral. O método baseado na eluição utilizando extrato de carne foi
o mais viável para recuperar os vírus pesquisados, sobretudo AdV em lodo de esgoto. Os AdV
foram predominantes nas amostras de lodo de esgoto tratado e, portanto, poderiam ser
considerados bons indicadores para a presença de vírus de disseminação entérica nesses resíduos.
Esse é o primeiro estudo demonstrando a ocorrência de RVA e NoV GII em lodo de esgoto
digerido anaerobicamente no Brasil, e espera-se que esse trabalho contribua para expandir essa
linha de investigação, incluindo a análise de biossólidos produzidos por outros processos de
estabilização. / The aim of this study was to evaluate the presence of rotavirus (RVA), adenovirus (AdV),
norovirus (NoV) and hepatitis A virus (HAV) in environmental samples (sewage and primary and
treated sewage sludge) produced in different wastewater treatment plants (WWTPs) in Rio de
Janeiro city through the detection, quantification and molecular characterization, as well as,
determining the efficiency of different viral recovery methods in sewage sludge. Viral
concentrations were determined in hospital WWTPs that operates by anaerobic processes (UASB
reactor and anaerobic filters) and aerobic (activated sludge process with prolonged aeration) and
in a great urban WWTP (Alegria, Caju) that operates by conventional activated sludge process.
The results demonstrate that hospital wastewaters and treated effluents by anaerobic and aerobic
processes are contaminated with high viral loads, especially RV-A, pointing environmental
dissemination risks when conventional biological treatment processes are not suitable for virus
removal. A great variability of viral genotypes was found, mainly for AdV, which species C and
D involved in respiratory infectious diseases and nosocomial keratoconjuctivites cases were
detected. Only NoV GII.4 was obtained in hospital wastewaters, confirming the prevalence of this
genotype in Brazil. In the study that evaluated HAV detection in urban wastewaters was
demonstrated that 58% of the raw sewage samples were positive for HAV and the viral genome
loads were not detected in the treated effluents from activated sludge process. Phylogenetic
analysis based on VP1/2A genome region of HAV detected in 2009-2010 demonstrated the
prevalence of subgenotype IA and the isolates showed higher nucleotide identity with HAV
isolates from Brazil and Argentina. Virus detection determined in distinct stages of the
conventional activated sludge process demonstrated the predominance of RVA and AdV and viral
genome loads were reduced in 1 – 1,5 log10 units in the treated effluent. Analysis of the virus
recovery methods efficiency in sewage sludge demonstrated that the presence of inhibitors affect
the performance of the nucleic acid amplification reactions and the use of an internal control (PP7
bacteriophage) can be suitable to monitoring viral detection stages. The method based on beef
extract elution was more viable for recovering viruses, mainly AdV in sewage sludge.
Adenoviruses are predominant in these samples and, therefore, could be considered good
indicators to evaluate the viral contamination in these residues. This is the first Brazilian report on
the occurrence of RV-A and NoV GII in sewage sludge treated by anaerobic digestion and is
expected that the present study contributes for the investigation of the enterically disseminated
viruses in biosolids treated by other stabilization processes.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/6066 |
| Date | January 2011 |
| Creators | Prado, Tatiana |
| Contributors | Gaspar, Ana Maria Coimbra, Miagostovich, Marize Pereira |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ |
| Rights | Tatiana Prado, info:eu-repo/semantics/openAccess |
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