No presente trabalho, nós desenvolvemos um modelo de mecânica estatística para a dinâmica do cotransporte. Em particular, foram analisados o simporte de lactose e H+ catalisado pela LacY, e o antiporte de triose-P e Pi catalisado pelo TPT. Em ambos os casos, nosso ponto de partida foi determinar a curva de energia livre do ciclo de transporte com base na estrutura bioquímica de cada estado. Então, usando o algoritmo de Metropolis em um modelo do caminho aleatório não-homogêneo, nós determinamos a dinâmica do ciclo expressa na curva de energia livre obtida anteriormente. Tanto no caso da LacY quanto no caso do TPT, a concordância entre as predições do nosso modelo e os dados experimentais sugere que a nossa curva de energia livre é apropriada para descrever os processos de transporte através da membrana plasmática. / In the present work, we developed a statistical mechanical model for the dynamics of cotransport. In particular, the symport of lactose and H+ and the antiport of triose-P and Pi were analyzed. In both cases, our starting point was to determine the free-energy curve of the transport cycle based on the biochemical structure of each state. Then, using the Metropolis algorithm in a nonhomogeneous random walk model, we determined the dynamics of the cycle expressed in the free-energy curve obtained previously. Both in the case of LacY and TPT, the agreement between our model predictions and the experimental data suggests that our free-energy curve is appropriate for describing the transport process across the plasma membrane.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:usp.br/oai:teses.usp.br:tde-10092019-122537 |
| Date | 30 July 2019 |
| Creators | Barreto, Yan Borges |
| Contributors | Alencar, Adriano Mesquita |
| Publisher | Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| Source Sets | Universidade de São Paulo |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | Dissertação de Mestrado |
| Format | application/pdf |
| Rights | Liberar o conteúdo para acesso público. |
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