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Identificação de genes diferencialmente expressos em amendoim, submetido a estresse hídrico

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Previous issue date: 2008-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Peanut is a worldwide important product for food industries. In Brazil this crop is quite representative due its high consume. Most part of production is concentrated in the Southeast, Center-West and Northeast regions. In this last one, the wheather is a limiting factor for the crop; however, some botanical types present tolerance to prolonged dry conditions. The aim of this work was to identify genes differentially expressed in a peanut cultivar submitted to water stress which could aid on selective processes in the improvement programs carried out with this crop in the Northeast region. The cv. Senegal 55437 was chosen for this study due its recognizable tolerance to drought. It was submitted to five days of water stress under greenhouse conditions. The total RNA was collected from foliar tissues when plants reached 50% stomatic closure. RT-PCR assays were performed using ten ISSR primers and the c- DNAs obtained were re-amplified, purified and cloned into Escherichia coli, INFα cell (Invitrogen). A total of twenty-nine cDNA fragments were obtained, being seventeen at the down regulated condition, two at over regulated and ten activated. These later, only found in stressed samples, were sequenced. Sequences obtained were compared into databanks, focusing on Arabidobis thaliana and Arachis banks, andfour showed homology with genes which are involved in metabolic routes to abiotic and biotic factors. One of these sequences, with about 700pb, showed homology with Arabinogalactan protein 10 of A. thaliana. This structural protein present in the leaves, stems and roots is associated to regulatory processes initiated during the water loss by the cell, which genes increase protection to the cytoplasm, organelles,cell membranes, cellular osmotic potential alteration and improve better regulation in the expression of other genes. The result here obtained suggests a possible relation of this gene with the response routes to water stress. / O amendoim é um produto de grande importância mundial para a indústria de alimentos, sendo bastante representativo no Brasil que é um dos maiores produtores e consumidores dessa oleaginosa. Grande parte da produção está concentrada nas regiões Sudeste, Centro-Oeste e Nordeste. Nesta última região, o clima é um fator limitante ao seu cultivo, embora alguns tipos botânicos apresentem tolerância às condições de estiagem prolongada. O presente trabalho teve como objetivo identificar genes diferencialmente expressos em amendoim, submetido a estresse hídrico, que possam auxiliar nos programas de melhoramento genético da cultura na região Nordeste. Para este estudo a cultivar Senegal 55437, de reconhecida tolerância à seca, foi submetida a cinco dias de estresse hídrico em condições de casa de vegetação. O RNA total foi coletado a partir de tecidos foliares, quando as plantas atingiram 50% de fechamento estomático. Para a identificação de genes diferencialmente expressos, procedeu-se ensaios de RT-PCR utilizando-se primers ISSR. Os c-DNAs obtidos foram reamplificados, purificados, ligados em vetor pGEMT-Easy e clonados em Escherichia coli, célula INFα (Invitrogen). Foram obtidos vinte e nove fragmentos de cDNA dos quais dezessete na condição de subregulados,dois super-regulados e dez ativados, estes últimos encontrados apenas nas amostras estressadas, os quais foram seqüenciados. As seqüências obtidas foram comparadas em bancos de dados, evidenciando os bancos de Arabidobis thaliana e Arachis. Dentre as seqüências, quatro apresentaram homologia com genes conhecidos e envolvidos em rotas metabólicas de resposta a fatores abióticos e bióticos. Uma dessas seqüências com cerca de 700 pb apresentou homologia com a proteína Arabinogalactana 10 de A. thaliana. Essa proteína estrutural presente nas folhas, caules e raízes dos vegetais esta associada a processos regulatórios iniciados durante a perda de água pela célula, cujos genes envolvidos promovem aumento da proteção do citoplasma, organelas, membranas celulares, alterações do potencial celular osmótico e maior regulação da expressão de outros genes. O resultado aqui obtido sugere uma possível relação desse gene no envolvimento das rotas de resposta ao estresse hídrico.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:tede2:tede2/6226
Date27 February 2008
CreatorsDUARTE, Elizabeth Amélia Alves
ContributorsMELO FILHO, Péricles de Albuquerque, NOGUEIRA, Rejane Jurema Mansur Custódio, SANTOS, Roseane Cavalcanti dos, NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do, LIMA, Liziane Maria de, ANUNCIAÇÃO FILHO, Clodoaldo José da
PublisherUniversidade Federal Rural de Pernambuco, Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas, UFRPE, Brasil, Departamento de Agronomia
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE, instname:Universidade Federal Rural de Pernambuco, instacron:UFRPE
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
Relation-6234655866848882505, 600, 600, 600, 600, -6800553879972229205, 2615607299470131967, -2555911436985713659

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