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Création d'outils pour l'automatisation d'analyses phylogénétiques de génomes d'organites

Le traitement des données de séquençage pour les rendre utilisables dans une analyse phylogénétique est long et répétitif. De plus, certaines analyses plus complexes peuvent difficilement être entreprises sans l'automatisation de certaines tâches. La création d'outils bioinformatiques permettrait de diminuer le temps consacré à la préparation des données.

Le but de cette recherche est de développer des outils informatiques
permettant d'automatiser le traitement de données provenant du séquençage
d'organites. Pour ce faire, il a été nécessaire de créer:

item des bases de données de gènes d'organites;
item des outils pour l'extraction des séquences génétiques dans différents formats;
item des outils pour l'identification des gènes d'organismes nouvellement séquencés;
item des outils de préparation des données pour l'utilisation lors d'analyses phylogénétiques.

Finalement, le bon fonctionnement des outils a été vérifié par l'exécution d'une analyse phylogénétique dont les résultats ont déjà été publiés.

Identiferoai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QQLA.2004/21635
Date04 1900
CreatorsGagnon, Jules
ContributorsLemieux, Claude
PublisherUniversité Laval
Source SetsLibrary and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada
LanguageFrench
Detected LanguageFrench
TypeElectronic Thesis or Dissertation
Formattext/html, application/pdf
Rights© Jules Gagnon, 2004

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