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Previous issue date: 2017-12-14 / O sagui comum (Callithrix jacchus), um pequeno primata de novo mundo, tem sido
amplamente empregado como modelo biol?gico, n?o apenas para decifrar
disfun??es em transtornos neuropsiqui?tricos como tamb?m para compreender
circuitos neurais envolvidos no comportamento social humano. A este respeito, a
disponibilidade de dados de express?o g?nica advindos de tecnologias nextgeneration
sequencing (NGS) representam uma oportunidade para novos estudos
aprofundados na gen?tica e na epigen?tica desta esp?cie. Uma das fronteiras na
neuroci?ncia ? manusear esses dados em larga escala a fim de conectar vias
moleculares ao comportamento do sistema nervoso. Para tornar esses dados mais
acess?veis para a comunidade cient?fica sem forma??o em bioinform?tica, foi criado
o CajaDB, um banco de dados que fornece uma interface web para dados de
gen?mica, express?o g?nica e splicing alternativo, incluindo ferramentas para
an?lises biol?gicas. Com os dados processados para esta plataforma foram
realizadas duas an?lises distintas: (1) Express?o diferencial de genes nos
hemisf?rios direito e esquerdo, uma vez que lateraliza??o ? um aspecto crucial do
funcionamento da arquitetura cerebral para habilidades cognitivas, onde foram
encontrados 49 genes diferencialmente expressos, sendo 24 para o hemisf?rio
esquerdo e 25 para o hemisf?rio direito; (2) Express?o diferencial de genes entre
machos e f?meas, com foco em c?rtex frontal e compara??o com dados
equivalentes de humanos. Neste ?ltimo caso, foi verificado que genes com
express?o enviesada para machos s?o conservados e enriquecidos para fun??es de
manuten??o celular. J? genes com express?o enviesada para f?mea foram
relacionados a fun??es de plasticidade neural, envolvidos com remodelamento dos
circuitos sin?pticos, cascatas de estresse e comportamento visual. Com base em
conhecimentos sobre dimorfismo comportamental entre sexos de saguis, ? sugerido
que estas express?es diferenciais podem estar relacionadas a determinadas
circuitarias neurais associadas ?s estrat?gias adaptativas de sobreviv?ncia e
reprodu??o para cada sexo. Diante do exposto, espera-se que os dados dispon?veis
no banco de dados associados ?s ferramentas biol?gicas dispon?veis facilitem a
gera??o de hip?teses e a interpreta??o de resultados sobre o funcionamento
cerebral nesta esp?cie que ? um modelo biol?gico largamente utilizado, abrindo
perspectivas de investiga??o e desenvolvimento de novos tratamentos para doen?as
neuropsiqui?tricas no futuro. CajaDB est? dispon?vel em cajadb.neuro.ufrn.br. / Common marmoset (Callithrix jacchus), a small New World monkey, has been widely
used as a biological model not only to elucidate brain dysfunction in neuropsychiatric
disorders, but also for deciphering neural circuits involved in human social behaviors.
In this regard, the availability of gene expression data derived from next-generation
sequencing (NGS) technologies represents an opportunity for deeper studies on the
genetic and epigenetic architecture of this species. One of the frontiers in
neuroscience field requires handling omics large-scale data sets for connecting
molecular pathways to nervous system behavior. To make these omics datasets more
accessible for the scientific community without a solid bioinformatics background, we
have created CajaDB, a database that provides a friendly interface for genomic,
expression and alternative splicing data, including tools for biological analyses. Using
the processed data two analysis were conducted: (1) Differential expression between
right and left hemispheres, once lateralization is a crucial aspect of the functional
brain architecture for cognitive abilities. It was found 49 differentially expressed
genes, where 24 genes had left hemisphere bias and 25 genes had right hemisphere
bias. (2) Sex-biased gene expression with focus in frontal comparing to humans. It
was found that genes whose expression is male biased are conserved between
marmosets and humans and enriched with "housekeeping" functions. On the other
hand, female-biased genes are more related to neural plasticity functions involved in
remodeling of synaptic circuits, stress cascades and visual behavior. Based on
knowledge of dimorphic social behavior of male and female common marmosets we
discuss that these differences might be linked to neuronal circuitry underlying the
expression of the adaptive strategies in each sex and related to survival and
reproductive behavior traits. Hence, it is expected that data available in the webpage
associated with available biological tools will facilitate generation of hypotheses and
interpretation of results on brain functioning, facilitating improvements in neurological
diseases treatment in the future. CajaDB is available at cajadb.neuro.ufrn.br.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufrn.br:123456789/24818 |
| Date | 14 December 2017 |
| Creators | Nogueira, Viviane Brito |
| Contributors | 06705430478, Albuquerque, Fabiola da Silva, 64379620468, Lima, Jo?o Paulo Matos Santos, 79332021368, Souza, Sandro Jos? de, Sousa, Maria Bernardete Cordeiro de |
| Publisher | PROGRAMA DE P?S-GRADUA??O EM CI?NCIAS DA SA?DE, UFRN, Brasil |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFRN, instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte, instacron:UFRN |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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