Memoria para optar al título de Químico / Los puentes de halógeno son interacciones estables entre un átomo de halógeno y otro
átomo electronegativo cercano. Esta interacción se produce por la presencia del
denominado agujero σ; una región positiva originada por la anisotropía en la
distribución de la densidad electrónica en los halógenos.
En esta tesis, se desarrolló una nueva metodología para estudiar la naturaleza de
estos puentes de halógeno en sistemas biológicos usando resultados experimentales
donde estas interacciones están presentes. Mediante cálculos mecano cuánticos y
simulaciones de dinámica molecular se estudiaron dos series de inhibidores de la
enzima catepsina L. A través de la aplicación de esta metodología se explica el
aumento de afinidad observado de estos inhibidores halogenados comparado con otros
sin sustitución con halógeno.
La fuerza de los puentes de halógeno reproducen la tendencia experimental observada
en el orden Cl < Br < I. Esta interacción no está presente en compuestos sustituidos
con flúor o grupo metilo. Además se reporta una correlación entre los valores
experimentales de IC50 y datos cristalográficos disponibles. / Halogen bonds are stable interactions between a halogen atom and a close
electronegative atom. This interaction is produced by the presence of σ hole; a positive
region caused by the anisotropic distribution of the charge density on the halogen atom.
In this thesis, a new methodology was developed to study the nature of these halogen
bonds in biological systems using experimental results where these interactions are
present. Through quantum mechanics along with molecular dynamics simulations two
series of cathepsin L inhibitors were studied aiming to explain the observed enhanced
affinity of various halogenated ligands compared with those without halogen
substitution.
The strength of halogen bonds reproduced the increased observed experimental trend
in the order of Cl < Br < I. It is worth to mention that this interaction is absent in
compounds bearing fluorine and methyl groups. Our results correlate in good
agreement with experimental IC50 values and the crystallographic data available.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UCHILE/oai:repositorio.uchile.cl:2250/114909 |
| Date | January 2013 |
| Creators | Saavedra Rivas, Leslie |
| Contributors | Zapata Torres, Gerald Amilcar, Cassels Niven, Bruce, Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas, Departamento de Química Inorgánica y Analítica |
| Publisher | Universidad de Chile |
| Source Sets | Universidad de Chile |
| Language | Spanish |
| Detected Language | Spanish |
| Type | Tesis |
Page generated in 0.0165 seconds