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Phenotypic diversity in fruit and seed traits, and neutral genetic diversity in Allanblackia Floribunda

Allanblackia floribunda est un arbre des forêts denses humides tropicales valorisé pour la teneur élevée en acides gras de ses graines, essentiellement constitués d’acides stéarique et oléique dont l’efficacité dans la réduction du mauvais cholestérol de l’organisme humain a été prouvée. Pour cette raison, les graines de A. floribunda collectées en milieu naturel sont commercialisées. Toutefois, les travaux sur la culture de cette espèce sont encore à leur phase initiale. Nous avons déterminé la possibilité d’amélioration génétique de cette espèce en échantillonnant 17 à 40 fruits par arbre de 70 arbres distribués sur quatre sites en milieu naturel. La matière grasse a été extraite des graines, et les teneurs en acides stéarique et oléique estimées à l’aide de méthodes développées au cours de cette étude. La variation phénotypique des traits des fruits et des graines a été caractérisée dans et entre les arbres, et entre les sites. Les estimations de répétabilité des caractères mesurés ont été effectuées. Des corrélations phénotypiques entre les traits étudiés ont aussi été estimées, et quatre traits ont été retenus pour effectuer la sélection multi-caractère de 20 arbres-plus qui constitueront la population d’amélioration de cette espèce pour la production des graines. Nous avons par la suite isolé 10 marqueurs moléculaires de type microsatellite polymorphes à partir de A. floribunda, et sept de ces marqueurs étaient polymorphes à la fois chez Allanblackia gabonensis et Allanblackia stanerana. La variation de huit loci microsatellites a permis de caractériser la structure génétique neutre de 10 populations de A. floribunda de zone de forêt naturelle du Cameroun, puis d’inférer l’histoire récente des forêts humides d’Afrique Centrale. Aucune différence significative n’a été observée entre les paramètres génétiques de la population d’amélioration et celle existant en milieu naturel indiquant qu’une amélioration de cette espèce à partir des 20 arbres sélectionnés ne réduirait pas sa diversité génétique neutre. Toutefois, une légère augmentation du taux de consanguinité a été observée dans la population d’amélioration, et des recommandations sont formulées pour la conservation des ressources génétiques durant l’amélioration de A. floribunda. / Allanblackia floribunda or tallow tree is a tropical forest-tree species that is valued for its seeds, which are rich in hard fat consisting mostly of stearic and oleic acids, reported to lower plasma cholesterol levels, thus reducing the risks of heart attack. Owing to this fat profile, Allanblackia oil is used for margarine production and in soap and ointments manufacture, and seeds extracted from Allanblackia fruits by local communities are traded. We determined whether the species could be genetically improved for fruit/seed production by sampling 17 to 40 fruits from each of 70 trees that were distributed among four sites in wild stands. Fat was extracted from the seeds, and stearic and oleic acid content of the fat was estimated using methods developed in this study. Phenotypic variation in fruit/seed traits was assessed within- and among-trees, and among sites. Repeatabilities were estimated for measured characters, and relationships between these characters investigated. Twenty “plus trees” were selected for breeding, and implications for improvement discussed. Then we isolated and characterized ten microsatellite primer pairs for A. floribunda. Seven of these microsatellite loci were polymorph for both Allanblackia gabonensis and Allanblackia stanerana species as well. Using eight informative microsatellite loci, we have characterized the genetic structure of A. floribunda natural populations from Cameroon, and inferred the recent history of rainforests from Central Africa. No significant difference was identified in genetic parameters between wild stands and the breeding population, indicating that breeding A. floribunda from 20 trees would not reduce nuclear genetic diversity. However, a slight increase in inbreeding was observed in the breeding population, and recommendations for genetic diversity conservation during tree improvement in the species are made.

Identiferoai:union.ndltd.org:LAVAL/oai:corpus.ulaval.ca:20.500.11794/21340
Date16 April 2018
CreatorsAtangana, Alain Rene
ContributorsKhasa, Phambu, Beaulieu, Jean
Source SetsUniversité Laval
LanguageEnglish
Detected LanguageFrench
Typethèse de doctorat, COAR1_1::Texte::Thèse::Thèse de doctorat
Formatviii, 101 p., application/pdf
CoverageCameroun
Rightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2

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