Submitted by Alessandra Portugal (alessandradf@ioc.fiocruz.br) on 2013-09-19T10:59:42Z
No. of bitstreams: 1
BÁRBARA VIEIRA DO LAGO.pdf: 2140185 bytes, checksum: 9c5e08ce133a045f4fffdbc15c6ce1ff (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-19T10:59:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1
BÁRBARA VIEIRA DO LAGO.pdf: 2140185 bytes, checksum: 9c5e08ce133a045f4fffdbc15c6ce1ff (MD5)
Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A infecção pelo vírus da hepatite B (HBV) representa um grave problema de saúde
pública mundial, apesar da existência de uma vacina eficiente. Estima-se que cerca
de 400 milhões de indivíduos no mundo estejam cronicamente infectados, com uma
estimativa de 65 milhões de portadores crônicos do HBV na África. Os oito genótipos
do HBV (A-H) apresentam distribuição mundial característica, que reflete suas
origens e o fluxo migratório das populações infectadas. Devido à sua área
geográfica restrita, isolados do HBV do genótipo E não têm sido extensivamente
estudados. O objetivo do presente estudo é analisar a diversidade genética do HBV
entre indivíduos positivos para o HBsAg em Luanda, Angola. Um total de 31 de 43
amostras foram amplificadas com sucesso para o genoma completo do HBV
(aproximadamente 3,200 pares de bases) por reação em cadeia da polimerase
(PCR). Quinze genomas completos do HBV puderam ser sequenciados diretamente
a partir de seus produtos de PCR. Quatorze deles foram classificados como HBV/E,
e um como HBV/A/A1. Conforme vem sendo descrito para o genótipo E, as
distâncias genéticas entre as amostras foram baixas: 1,0% para o genoma completo;
0,7% para a pré-S/S; 0,9% para a polimerase, 1,7% para a pré-C/C e 1,2% para a
ORF X. Análises nucleotídicas da região pré-S/S/Pol, demonstraram que 3 pacientes
com coinfecção HIV-HBV sob terapia (HAART), possuíam mutações de resistência a
lamivudina e em um deles verificou-se também uma mutação de resistência ao
adefovir. Em relação à região pré-C/C, verificou-se em 3 das amostras presença da
dupla mutação A1762T-G1764A do BCP, associada ou não às substituições
G1896A e G1899A. Dentre as 5 amostras clonadas com sucesso, 4 foram
classificadas como HBV/E E, e uma como HBV/A/A1. A análise filogenética das
subpopulações evidenciou assinaturas moleculares e deleções específicas de cada
população. Este estudo poderá contribuir para um maior conhecimento sobre a
variabilidade genética dos isolados de HBV circulantes em Angola, bem como para
elucidar características sobre a patogênese e o curso clínico da doença que visem à
adoção de medidas preventivas e de controle da infecção / Hepatitis B virus (HBV) infection is one of the major global human health problems,
despite the introduction of vaccination programs. It is estimated that more than 400
million people are chronically infected with HBV worldwide, among then 65 million
are living in Africa. The sequence heterogeneity of HBV isolates has led to the
classification of HBV into eight genotypes, A to H, based on full-length genomic
divergence of more than 8%. Genotype E is mainly found in Sub-Saharan Africa. Due
to their restricted geographic prevalence area, HBV genotype E isolates have not
been extensively studied with regard to genetic variability. The aim of this study was
to analyze the genetic diversity of HBV complete genome from HBsAg positive
individuals in Luanda, Angola. From a total of 43 samples, 31 were amplified
successfully for the HBV complete genome (approximately 3.200 bp) by polymerase
chain reaction (PCR). Fifteen HBV complete genomes were sequenced directly from
their PCR products. For them, fourteen were classified as HBV/E, and one as
HBV/A/A1. The genetic distances between the samples were low, as described for
genotype E: 1.0% for the entire genome, 0.7% for pre-S/S, 0.9% for polymerase,
1.7% for pre-C/C and 1.2% for ORF X. Pre-S/S/Pol region nucleotide sequence
analysis from 3 patients with HIV-HBV coinfection under HAART therapy, presented
lamivudine resistance mutations and one of these 3, presented also adefovir
resistance mutation. Regarding the region of the pre-C/C, it was found in 3 samples a
BCP double mutation A1762T-G1764A, with or without G1896A and G1899A
substitutions. Subpopulations analysis of five different samples, 4 classified as
HBV/E, and one as HBV/A/A1 revealed molecular signatures specific to each
population. This study will contributes to a better knowledge about HBV genetic
variability strains circulating in Angola, and to elucidate the molecular features and
clinical characteristics aiming the adoption of preventive measures and infection
control.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/6936 |
| Date | January 2010 |
| Creators | Lago, Bárbara do Vieira |
| Contributors | Moraes, Milton Ozório, Lima, Leila Mendonça, Silva, Edson Elias da, Martins, Regina Maria Bringel, Niel, Christian Maurice Gabriel, Soares, Caroline Cordeiro, Gomes, Selma de Andrade |
| Publisher | Instituto Oswaldo Cruz |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Page generated in 0.074 seconds