Eukaryotní DNA se váže kolem nukleozomů, čím ovplyvnuje vyšši strukturu DNA a přístup k vazebním mistům pro všeobecní transkripční faktory a oblasti genů. Je proto důležité vědet, kde se nukleozomy vážou na DNA, a jak silná tato vazba je, abychom mohli porozumět mechanizmům regulace genů. V rámci projektu byla implementována nová metoda pro predikci nukleozomů založená na rozšíření Skrytých Markovových modelů, kde jako trénovací a testovací sada posloužila publikována data z Brogaard et al. (Brogaard K, Wang J-P, Widom, J. Nature 486(7404), 496-501 (2012). doi:10.1038/nature11142). Správne predikováno bylo zhruba 50% nukleozomů, co je porovnatenlný výsledek s existujícimi metodami. Okrem toho byla provedena řada experimentů popisující vlastnosti sekvencí nukleozomů a ich organizace.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:nusl.cz/oai:invenio.nusl.cz:412874 |
| Date | January 2013 |
| Creators | Višňovský, Marek |
| Contributors | Bendl, Jaroslav, Martínek, Tomáš |
| Publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií |
| Source Sets | Czech ETDs |
| Language | English |
| Detected Language | Unknown |
| Type | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Rights | info:eu-repo/semantics/restrictedAccess |
Page generated in 0.0048 seconds