Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2016-07-29T17:57:19Z
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Previous issue date: 2016-02-29 / Facepe / Este trabalho apresenta uma metodologia in silico para o estudo de complexos
de inclus o utilizados na inova o terap utica. Um complexo de inclus o
formado por um host (hospedeiro), e por um guest (h spede). Neste trabalho, o
host estudado a ciclodextrina (e seus derivados) e o guest, um ligante
(f rmaco, em potencial), formando o complexo host:guest. O objetivo desse
projeto desenvolver uma plataforma (CycloMolder) capaz de realizar estudos
in silico dos complexos de inclus o de forma autom tica e precisa, fazendo uso
de uma interface gr fica de usu rio. Esse objetivo foi tra ado para facilitar os
estudos de modelagem molecular para este tipo de sistema qu mico, com
interesse farmac utico. A plataforma composta por dois m dulos: CycloGen e
CycloDock. O primeiro m dulo (CycloGen) constr i modelos com mais de uma
estrutura para representar um derivado de ciclodextrina. O segundo m dulo
(CycloDock) realiza o c lculo de docking molecular entre as mol culas host e
guest, utilizando o programa Autodock Vina e apresenta os resultados obtidos,
incluindo gr ficos que mostram a distribui o energ tica e as intera es
intermoleculares do complexo. O programa CycloMolder foi testado atrav s de
estudos de casos inspirados em problemas farmac uticos reais. Os testes
realizados destacaram a import ncia da gera o de mais de uma configura o
para representar significativamente um derivado de ciclodextrina, e tamb m
mostrou o potencial anal tico do programa, proporcionado pela automa o do
estudo de modelagem, execu o dos c lculos e an lise dos resultados. De
forma geral, o programa CycloMolder atinge seus objetivos, automatizando e
simplificando os estudos in silico dos complexos de inclus o, contribuindo
desta forma para a inova o terap utica. / This work presents an in silico methodology for study of inclusion complexes
used in therapeutic innovation. An inclusion complex is formed by a host and a
guest. In this work, the host is the cyclodextrin and their derivatives and the
guest is a potential drug, forming a host:guest complex. The goal of this work is
to development a platform (CycloMolder) able to perform in silico studies of
inclusion complexes in an automated and precise fashion, making use of a
graphical user interface. The platform (CycloMolder) consists of two modules:
CycloGen and CycloDock. The first module (CycloGen) builds models with
more than one chemical structure to represent a cyclodextrin derivative. The
second module (CycloDock) performs the molecular docking calculations
between the host and guest molecules, using the AutoDock Vina program, and
displays the results, including graphs showing the energy distribution and
intermolecular interactions present in the host:guest complexes. The
CycloMolder program was tested through case studies inspired by real
pharmaceutical problems. The tests highlighted the importance of generating
more than one chemical structure to better represent a ciclodextrin derivative,
also showed the analytical potential of the program, provided by the automation
of the modeling study, execution of calculations and analysis of results. Overall,
the CycloMolder program achieves its goals by automating and simplifying the
in silico studies of inclusion complexes, thus contributing to the therapeutic
innovation.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/17588 |
| Date | 29 February 2016 |
| Creators | RABELLO, Marcelo Montenegro |
| Contributors | HERNANDES, Marcelo Zaldini |
| Publisher | Universidade Federal de Pernambuco, Programa de Pos Graduacao em Inovacao Terapeutica, UFPE, Brasil |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE |
| Rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
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