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Previous issue date: 2011-03-23 / Bancos de dados de ligantes de acesso p?blico oferecem atualmente mais de 20 milh?es ligantes para os usu?rios. Em contrapartida, a realiza??o de testes in silico com esse elevado volume de dados ? computacionalmente muito custoso, que vem demandar o desenvolvimento de novas solu??es para a redu??o do n?mero de ligantes a ser testado em seus receptores alvo. No entanto, ainda n?o h? m?todo para efetivamente reduzir esse n?mero elevado em um valor gerenci?vel, constituindo-se assim, um grande desafio do Planejamento Racional de F?rmacos. Este trabalho tem o objetivo de desenvolver uma fun??o heur?stica para realizar uma triagem virtual com ligantes dispon?veis, cuja inten??o ? selecionar os candidatos mais promissores. A fun??o desenvolvida ? baseada na geometria da cavidade do substrato do receptor, filtrando apenas os ligantes compat?veis com esta cavidade considerando as varia??es 3D do modelo totalmente flex?vel do receptor. Para testar a efic?cia da fun??o proposta foram feitas duas avalia??es utilizando como estudo de caso a enzima do Mycobacterium tuberculosis, a InhA. Os resultados obtidos deste filtro melhoraram o processo de triagem virtual, descartando a realiza??o dos testes de docagem molecular dos ligantes que n?o se encaixam na cavidade do substrato do receptor.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:tede2.pucrs.br:tede/5151 |
| Date | 23 March 2011 |
| Creators | Quevedo, Christian Vahl |
| Contributors | Souza, Osmar Norberto de |
| Publisher | Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul, Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia da Computa??o, PUCRS, BR, Faculdade de Inform?ca |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS, instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, instacron:PUC_RS |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 1974996533081274470, 500, 600, 1946639708616176246 |
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