Les glycosyltransferases sont les enzymes responsables de la synthèse d'oligosaccharides, de polysaccharides et de glycoconjugués. Elles catalysent le transfert d'un saccharide à partir d'un substrat donneur, en général un nucléotide sucre, vers un substrat accepteur. Le mécanisme de réaction des glycosyltransférases peut avoir lieu avec une inversion ou une rétention de l'anomérie de liaison du sucre transféré. De nombreuses incertitudes subsistent au sujet du mécanisme des glycosyltransférases transférant avec rétention de l'anomérie. L'élucidation de ce mécanisme aiderait à la conception d'inhibiteurs ciblés afin de soigner des maladies allant des infections virales et bactériennes au cancer. De nombreuses protéines sont actives à l'état cristallin, ce qui fait de la cristallographie aus rayons X un outil de choix pour étudier le mécanisme d'enzymes. La « cristallographie cinétique » est un terme qui regroupe l'ensemble des techniques permettant d'initier une activité biologique in crystallo pour générer et piéger une quantité significative d'un état intermédiaire de réaction, afin de résoudre sa structure par cristallogrpahie aux rayons X. Le but de mon projet était d'étudier le mécanisme catalytique d'une glycosyltransférase transférant avec rétention de l'anomérie, par cristallographie cinétique. De cette façon, j'ai étudié une enzyme du groupe sanguin responsable du transfert d'un galactose à partir d'UDP-Gal vers l'antigène H. J'ai étudié les effets de la cryoprotection sur la structure de la protéine, et j'ai effectué les études préalables nécessaires à l'application de deux techniques issues de la cristallographie cinétique à l'étude de ces enzymes : « Déclencher-tremper »et « Tremper-déclencher ». / Glycosyltransferases are a large class of enzymes responsible for the synthesis of oligosaccharides, polysaccharides and glycoconjugates. They catalyze the transfer of a saccharide from a donor substrate, usually a nucleotide sugar, to an acceptor. Glycosyltransferase reactions can occur with either retention or inversion of the anomeric configuration of the transferred sugar. Many uncertainties remain concerning the catalytic mechanisms of retaining glycosyltransferases even though the elucidation of this mechanism would help in the rationale design of potent inhibitors to treat diseases ranging from viral and bacterial infections to cancer. Many proteins function in the crystalline state which makes X-ray crystallography a potential powerful tool for studying enzymatic mechanisms. ‘Kinetic crystallography' is a term coined to name the ensemble of techniques to initiate a biological turnover in crystallo in order to generate and trap a significant amount of a given intermediate reaction state, and then solve its X-ray structure. The aim of my project was to investigate the catalytic mechanism of a retaining glycosyltransferase, by kinetic crystallography methods. In this way, I studied a human blood group synthase responsible for the transfer of a galactose from UDP-Gal to the H antigen. I investigated the effects of the cryoprotectant on the structure of the protein, and I made preliminary studies to apply two kinetic crystallography techniques to the enzyme: freeze-trigger and trigger freeze experiments.
Identifer | oai:union.ndltd.org:theses.fr/2013GRENV047 |
Date | 11 December 2013 |
Creators | Batot, Gaëlle |
Contributors | Grenoble, Royant, Antoine, Breton, Christelle |
Source Sets | Dépôt national des thèses électroniques françaises |
Language | French |
Detected Language | French |
Type | Electronic Thesis or Dissertation, Text |
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