Peptidoglycan (PGN) är en bakteriecellväggskomponent och känd för att känna igen olika receptorer eller enzymer för att leda aktiveringsimmunsystemet. Den allmänna strukturen för PGN består av sockerkedjor inklusive N-acetylglutamin (GlcNAc), N-acetylmuraminsyra (MurNAc) och tvärbundna peptidkedjor. PGN-fragment med D-Lac-ändpeptider har hittats från vankomycinresistenta enterokocker men ett kemiskt syntetiserat PGN-fragment med en D-Lac-ändpeptid har inte undersökts i detalj. Således fokuserade vi på syntesen av PGN-fragmentstrukturer som inkluderar en D-Ala-D-Lac-rest vid den terminala delen av peptidkedjan. För att syntetisera dessa fragmentstrukturer planerade vi att kombinera fastfassyntes (för Lac-peptiddelen) och lösningsfassyntes (för glykanberedning och kondensation). Detta tillvägagångssätt är fördelaktigt för framställning av peptidoglykanfragment med en komplex grenad peptiddel. Först beredde vi sockerdelen MurNAc-derivatet i lösningsfassyntes från ett glukosderivat. Medan den Lac-innehållande peptiden framställdes med fastfas-peptidsyntes med användning av 2-klortritylkloridharts. Med denna förening gav kondensationen av dessa två föreningar det önskade D-Lac-avslutade peptidoglykanfragmentet. / Peptidoglycan (PGN) is a bacterial cell wall component and known to be recognized by various receptors or enzymes to lead the activation immune system. The general structure of PGN consists of sugar chains including N-acetylglutamine (GlcNAc), N-acetylmuramic acid (MurNAc) and cross-linked peptide chains. PGN fragments having D-Lac terminus peptides have been found from vancomycin-resistant enterococcus, but a chemically synthesized PGN fragment having a D-Lac terminus peptide has not been examined in detail. Thus, we focused on the synthesis of PGN fragment structures that include a D-Ala-D-Lac residue at the terminal part of the peptide chain. In order to synthesize these fragment structures, we planned to combine solid-phase synthesis (for the peptide- Lac part) and solution-phase synthesis (for glycan preparation and the condensation). This approach is advantageous for the preparation of peptidoglycan fragments having complex branched peptide moiety. First, we prepared the sugar moiety MurNAc derivative in solution-phase synthesis from a glucose derivative. While, the Lac-containing peptide was prepared with solid-phase peptide synthesis using 2-chlorotrityl chloride resin. Having this compound, the condensation of these two compounds gave the desired D-Lac-terminated peptidoglycan fragment.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:kth-300085 |
| Date | January 2021 |
| Creators | Saito, Yu |
| Publisher | KTH, Kemiteknik |
| Source Sets | DiVA Archive at Upsalla University |
| Language | English |
| Detected Language | Swedish |
| Type | Student thesis, info:eu-repo/semantics/bachelorThesis, text |
| Format | application/pdf |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | TRITA-CBH-GRU ; 2021:161 |
Page generated in 0.0026 seconds