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Previous issue date: 2014-02-20 / CAPES / CNPq / FINEP / O gênero Shewanella é um representante da classe das Gammaproteobactérias,
família Shewanellaceae, compondo um grupo de bactérias gram-negativas, móveis,
baciliforme, oxidase positiva, comumente encontrada em ambiente marinho e isolada do trato digestivo de animais aquáticos. Devido a suas características vem sendo amplamente testado como probiótico na carcinicultura. Estes têm sido utilizados na aquicultura para o controle biológico, aumento da taxa de conversão alimentar e sistema imune dos camarões. Este estudo teve por objetivo identificar potenciais bactérias probióticas retiradas do hepatopâncreas e estômago do camarão cultivado em sistema heterotrófico, avaliar as relações filogenéticas das cepas com o gênero Shewanella e caracteriza-las através de análisesmorfológicas, bioquímicas, produção de biofilme e antibiograma. A partir do cultivo heterotrófico de Litopenaeus vannamei, foram selecionadas as cepasIPA-S.51, IPA-S.111 e IPA-S.252para identificação através do sequenciamento parcial do gene 16S rRNA e comparados ao GenBank – NCBI e RDP - Seqmatch. As cepas foram alinhadas a 45 espécies do gênero Shewanella e avaliadas filogeneticamente utilizando os métodos Neighbor-Joining, Máxima Verossimilhança e Inferência Bayesiana. Quanto àsanálises morfológicas foram avaliadas parâmetros de acordo com a similaridade a padrões estabelecidos. Os testes bioquímicos
foram realizados com o auxílio dos kits BACTRAY I, BACTRAY II e BACTRAY III
(Labroclin®), totalizando 30 testes bioquímicos. A avaliação da capacidade de formação de biofilme foi realizada segundo Christensen e colaboradores. No antibiograma as cepas bacterianas foram submetidas a 13 antibióticos distintos segundo à técnica de Kirby e Bauer, com três repetições. O sequenciamento das cepas revelou alta similaridade a espécie Shewanella algae, utilizando o GenBank e o RDP-seqmath. A Inferência Bayesiana apresentou maior aporte estatístico e fidelidade dentre os métodos analisados. A Shewanella upenei apresentou alta similaridade as cepas estudadas, assim como a S. algae. As análises filogenéticas não descartam a hipótese de novas espécies para IPA-S.51, IPA-S.111 e IPAS. 252. As cepas estudadas foram sensíveis aos antibióticos Ampicilina/Subactan, Ofloxacina e Tetraciclina. A caracterização fenotípica fortalece a hipótese de especiação para as cepas testadas. Portanto, a capacidade de formação de biofilme, adicionada ao alto potencial enzimático e antagonismo a patógenos, característico do gênero Shewanella, tornam estas cepas potenciais probióticos para carcinicultura. / The genus Shewanella is one representant of Gammoproteobacteria class, family
Shewanellaceae, being part of gram-negative bacteria group, mobile, bacilliform, oxidasepositive, commonly found on marine environments and isolated from the digestive tract of aquatic animals. Due to its characteristics, some tests as probiotics are being carried out in carciniculture. They are being used on aquaculture for biological control, augmentations on feed conversion rates and immune system of shrimps. This study has as objective identify potentials probiotics bacteria found in the hepatopancreas and stomach of shrimps cultivated on heterotrophic based system, evaluating the strain phylogenetic relationships with Shewanella genus and characterizing them through morphological and biochemical analysis, biofilm production and antibiogram. The strains IPA-S.51, IPA-S.111 e IPA-S.252 were selected from the heterotrophic cultivation of Litopenaeus vannamei, identified through partial 16S rRNA sequencing and compared to GenBank – NCBI and RDP - Seqmatch.The strains were aligned to 45 species of Shewanella genus and phylogenetically evaluated using Neighbor-Joining,Maximum-Likelihood estimation and Bayesian Inference.Regarding the morphological analysis parameters were evaluated according with established standard similarities. The biochemical tests were conducted with the assistance of BACTRAY I, BACTRAY II and BACTRAY III (Labroclin®) kits, totalizing 30 biochemical tests.The Biofilm capacity evaluation was made according Christensen et al. Regarding the antibiogram, the bacterial strains had undergone 13 distinct antibiotics according Kirby and Bauer, with three repetitions. The strains sequencing showed high similarity to Shewanella algae species, using GenBank and RDP-seqmath.The Bayesian inference displayed higher
statistic contribution e fidelity among the other methods.The Shewanella upenei showed high similarity to the strains in study also as Shewanella algae.The phylogenetic analysis does not exclude the hypothesis of IPA-S.51, IPA-S.111 e IPA-S.252 being new species.The strains studied were sensitives to the antibiotics Ampicillin/Sulbactam, Ofloxacin, Tetracyclin. The phenotypic characterization of the strains supports the hypothesis of speciation. Thus, the capacity of biofilm formation plus the high enzymatic potential and antagonism interactions to pathogens, characteristics found in the Shewanella genus, make these strains potential probiotics to carciniculture.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/15667 |
| Date | 20 February 2014 |
| Creators | SANTOS, Rogério William |
| Contributors | BEZERRA, Ranilson de Souza, OLIVEIRA, José de Paula |
| Publisher | Universidade Federal de Pernambuco, Programa de Pos Graduacao em Ciencias Biologicas, UFPE, Brasil |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Breton |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE |
| Rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
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