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Análisis de clustering de secuencias genómicas de SARS-COV-2 identificadas en Perú

El presente proyecto de tesis tiene como objetivo el desarrollo de una herramienta
analítica interactiva para representar visualmente la diversidad de las secuencias genómicas de
SARS-CoV-2 en el Perú, que facilite el análisis de agrupamientos en el espacio y tiempo; y,
que permita incorporar nuevas secuencias. Este trabajo pretende resolver la necesidad de
realizar una analítica avanzada que incluya representaciones de agrupamiento en el espacio y
tiempo de la diversidad de las secuencias genómicas de SARS-CoV-2 en el Perú con el fin de
apoyar la vigilancia genómica.
Esta investigación surge debido a la pandemia y al virus que evoluciona aceleradamente
presentando constantes variantes genómicas, por lo que, la comunidad académica y autoridades
sanitarias están interesados en entender la diversidad de estas para así realizar más estudios
sobre su propagación. En el caso del Perú, de acuerdo a la revisión bibliográfica, no se
encontraron estudios publicados que investiguen la distribución de las variantes del virus
SARS-CoV-2. Comprender esta dinámica es importante porque ayudará a conocer el impacto
de la pandemia en el país, además de tener un mejor conocimiento de la propagación del virus
SARS-CoV-2 para que las autoridades sanitarias tomen acciones informadas.
Por ello, los objetivos planteados son el desarrollo de un módulo de software que permita
realizar una representación visual espacio-temporal de las secuencias genómicas SARS-CoV-
2; el desarrollo de un módulo de software que permita realizar un análisis de agrupamiento de
las secuencias genómicas SARS-CoV-2 con la capacidad de incorporar nuevas secuencias; y
la implementación de vistas con capacidades interactivas en ambos módulos para que el usuario
interactúe con ellos.
Finalmente, la herramienta desarrollada cumple con realizar un análisis de agrupamiento
y una representación visual en el espacio-tiempo de la diversidad de secuencias genómicas
SARS-CoV-2 para apoyar la vigilancia genómica en el Perú.

Identiferoai:union.ndltd.org:PUCP/oai:tesis.pucp.edu.pe:20.500.12404/26334
Date02 November 2023
CreatorsMejia Mujica, Carolina Estefania
ContributorsVillanueva Talavera, Edwin Rafael
PublisherPontificia Universidad Católica del Perú, PE
Source SetsPontificia Universidad Católica del Perú
LanguageSpanish
Detected LanguageSpanish
Typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
Formatapplication/pdf, application/pdf
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess, Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Perú, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/pe/

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