Le système baculovirus / cellules d’insectes est un outil performant pour la production de vecteurs AAV recombinant pour la thérapie génique. Cette production nécessite que, les gènes rep et cap de l’AAV ainsi que le transgène encadré par les ITR, soient codés dans le génome du baculovirus AcMNPV. L’utilisation de cassettes de recombinaison pour intégrer ces gènes provoque à grande échelle une certaine instabilité au sein des 134Kb du génome. Pour pallier à ce phénomène, une nouvelle stratégie d’intégration de gènes a été mise en place. Celle-ci doit permettre notamment d’éviter la présence de cicatrices de recombinaison et de modifier le génome du bacmid d’AcMNPV. Basée sur la technique de Gibson Assembly, nous avons tenté d’assembler de novo le génome du baculovirus d’AcMNPV à partir de fragments PCR chevauchants. Nous avons réussi à pré assembler en 4 parties la totalité du génome. Celles-ci ont permis d’insérer le gène de la GFP comme gène d’intérêt mais également d’éliminer le gène de résistance antibiotique et le Mini-F réplicon, facteur d’instabilité en cellules d’insecte. Plusieurs clones obtenus ne contiennent aucune mutation. Cette technique pourrait être appliquée à la production de vecteurs AAVr. / The baculovirus / insect cell system allows AAV vector production for gene therapy purposes. Current baculoviruses used for the production of rAAV vectors are a bottleneck for Scaling up production. Indeed the use of recombination boxes to insert the genes brings instability to the134kb genome. To avoid this, a new gene integration strategy has been implemented. In this work, we have assayed the full assembly of AcMNPV´s genome using the Gibson Assembly technic. PCR fragments covering the totality of genome and able to assemble through overlapping terminal regions have been pre-assembled in 4 segments. The finally assembly should contain the eGFP gene used has gene of interest along with replacement of the Mini-F replicon by polyhedrin gene. This feasibility study has shown that we could obtain segments without any mutation. Final assembly is still on-going. This technology should be applied next for the generation of baculovirus used for the production of rAAV vectors. This marker less combination method should solve problems of genome instability.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:theses.fr/2017SACLE013 |
| Date | 13 June 2017 |
| Creators | Boutin Fontaine, Marjorie |
| Contributors | Université Paris-Saclay (ComUE), Merten, Otto-Wilhelm, Galibert, Lionel |
| Source Sets | Dépôt national des thèses électroniques françaises |
| Language | French |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation, Text, Image, StillImage |
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