Santrauka Visų ląstelės baltymų analizė – tai metodas teikiantis fenotipinės informacijos. Jis plačiai naudojamas grupuoti bakterijų kamienus, nustatyti jų pirminį identitetą. Rezultatų patikimumas daugeliu atvejų prilygsta DNR-DNR hibridizacijai – pagrindiniam genotipinės informacijos metodui. Tuo pačiu visų ląstelės baltymų analizės metodas yra greitai atliekamas ir pigus. Dėl šių priežasčių metodas plačiai naudojamas medicininės diagnostikos, o taip pat su maisto pramone susijusiose laboratorijose. Šiuolaikiniame pasaulyje pramonėje labai svarbūs yra termostabilūs fermentai, o Geobacillus genties bakterijų kamienai būdami termofilai, yra tokių fermentų producentai. Dėl šios priežasties Geobacillus gentis yra aktualus tyrimų objektas. Labai svarbu tiksliai identifikuoti kamienus produkuojančius tiriamus fermentus. Vienu iš pirminio identifikavimo būdų galėtų būti visų ląstelės baltymų analizės metodas. Šiame darbe buvo parodyta, kad Geobacillus genties kamienų tarpusavio panašumas gali būti nustatytas visų ląstelės baltymų analizės metodu. Tarp G. stearothermophilus rūšies kamienų visų ląstelės baltymų elektroforetinių profilių panašumas buvo apie 80% ir atitiko DNR-DNR hibridizacijos rezultatus. Taip pat sutapo ir 22 kamieno panašumas su tipiniu G. vulcani kamienu: WCPP parodė 84% panašumą, DNR-DNR hibridizacija – 93,9%. Pagal visų ląstelės baltymų analizės metodą gauti rezultatai paneigė G. stearothermophilus 10 DSM 13240 kamieno priklausomybę šiai rūšiai. Pagal panašumo... [toliau žr. visą tekstą] / Summary Electrophoretic whole-cell protein profile analysis (WCPP) – is a method providing phenotypic information. It is widely used to group bacterial strains and estimate their primal identity. In most cases reliability of this method is equal to DNA-DNA hybridization – that is the main method of genotypic information. WCPP is performed quickly and it is cheap. Therefore this method is widely used in laboratories of medical diagnostic and laboratories related to food industry. In modern world termostable enzymes are very important in industry, whereas thermophilic bacterial strains of the genus Geobacillus are producers of these enzymes. Consequently genus Geobacillus is an actual object of research. It is very important to strictly identify bacterial strains producing needed enzymes. One of the primal ways for identification of this genus could be WCPP. During this work it was shown that similarity of strains of the genus Geobacillus can be determined by WCPP. There was an 80% similarity among strains of G. stearothermophilus. These results matched with DNA-DNA hybridization of these strains. Also there were similar results of WCPP and DNA-DNA hybridization between strain 22 and typical strain of G. vulcani: 84% and 93,9% respectively. Results of WCCP denied dependence of strain G. stearothermophilus 10 DSM 13240 to this species. According to similarity dendrogram this strain should be assigned to G. vulcani because of its 97% similarity to this species. There were also... [to full text]
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LABT_ETD/oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2007~D_20140620_204214-76687 |
| Date | 20 June 2014 |
| Creators | Jasinskytė, Džiuginta |
| Contributors | Čitavičius, Donaldas Jonas, Vilnius University |
| Publisher | Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), Vilnius University |
| Source Sets | Lithuanian ETD submission system |
| Language | Lithuanian |
| Detected Language | Unknown |
| Type | Master thesis |
| Format | application/pdf |
| Source | http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2007~D_20140620_204214-76687 |
| Rights | Unrestricted |
Page generated in 0.0022 seconds