Les polérovirus infectent de nombreuses plantes d'intérêt économique telles que la pomme de terre, la betterave à sucre et les cucurbitacées. Ces virus icosaédriques renferment un ARN simple brin et leur capside est constituée d'une protéine majeure (CP) et d'un composant mineur (RT*) localisé à la surface des virions. Ces virus sont restreints aux cellules du phloème dans lesquelles ils se multiplient et se déplacent. Les protéines CP et RT sont essentielles à la dissémination du virus par le puceron vecteur et à son mouvement dans la plante. L'objectif de cette étude a consisté à identifier dans les cellules du phloème, les protéines associées aux virions susceptibles d'intervenir dans le cycle viral en criblant une banque d'ADNc de cellules compagnes (CC) d'A. thaliana avec les protéines de structure ou des domaines protéiques du CABYV. Quatre gènes codant pour une protéine Heat Shock (HSP), la profiline 3 (PRF3) une glysosyl hydrolase ; et la protéine " Response to low sulfur 3 " ont été identifiés. Tous ces gènes candidats interagissent avec le domaine RTC-ter du CABYV et avec la protéine RT* pour la protéine HSP. En plus de ces gènes candidats, je me suis intéressée à la protéine ALY, identifiée au laboratoire, au cours du criblage d'une banque d'ADNc de puceron entier avec les deux protéines de structure du Turnip yellows virus (un autre polérovirus). Cette protéine possède quatre orthologues chez Arabidopsis susceptibles d'être impliquées dans le mécanisme de gene silencing mis en place contre le Tomato Bushy Stunt Virus. Les protéines ALY sont donc des candidats intéressants et j'ai montré une interaction entre les protéines de structure du CABYV et du TuYV et les quatre orthologues d'Arabidopsis. L'implication de ces gènes candidats n'a pas pu être confirmée à ce jour dans des mutants knock-out d'arabidopsis. Les résultats complexes obtenus pour le candidat PRF3 au cours des analyses de validation fonctionnelle, m'a conduit à étudier l'interaction entre ce candidat et le domaine RTC-ter du CABYV in planta par FLIM mais aucune interaction n'a pu être confirmée à ce jour. Tous les candidats isolés lors du criblage de la banque d'ADNc de CC interagissant avec le domaine RTC-ter du CABYV, ce travail m'a conduit à analyser le rôle dans le cycle viral de ce domaine et de la protéine RT (sous sa forme complète ou dépourvue du domaine RTC-ter), en étudiant l'accumulation de ces mutants dans les plantes et le clivage de la protéine RT. Tout d'abord, afin de localiser précisément le site de clivage de la protéine RT, des mutants ponctuels dans la zone de clivage ont été réalisés ce qui a permis de montrer que la structure secondaire de la protéine est importante pour son clivage. Puis, afin d'analyser le rôle du domaine RTC-ter dans le cycle viral, j'ai obtenu par délétion, un mutant n'exprimant plus ce domaine. Ce mutant synthétise uniquement la protéine RT tronquée, forme des particules virales semblables au virus sauvage et est transmissible par puceron. Par contre, de façon surprenante, ce mutant est incapable d'envahir les feuilles non-inoculées d'une plante. Ce résultat suggère que les deux formes de la protéine RT (complète et tronquée) sont indispensables au mouvement à longue distance du virus et nous proposons un modèle dans lequel le domaine C-terminal de la protéine RT agit en trans sur la particule virale pour promouvoir le mouvement du CABYV à longue distance.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:CCSD/oai:tel.archives-ouvertes.fr:tel-00998392 |
| Date | 15 February 2013 |
| Creators | Boissinot, Sylvaine |
| Publisher | Université de Strasbourg |
| Source Sets | CCSD theses-EN-ligne, France |
| Language | fra |
| Detected Language | French |
| Type | PhD thesis |
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