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Previous issue date: 2012 / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas / Este estudo objetivou investigar a ocorrência de rotavírus aviário (RVA), picobirnavírus
(PBV) e reovírus aviário (ARV) em aves de corte criadas em granjas situadas na
Mesorregião Metropolitana de Belém, Pará, no período compreendido entre 2008 a 2011.
Para tal, foram colhidos 85 pools de amostras fecais provenientes de 37 granjas
pertencentes a oito municípios. O RNA viral foi extraído a partir das suspensões fecais e
submetido à eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA) seguido da RT-PCR. Foi
selecionada pelo menos uma amostra de cada município positivo para o sequenciamento de
nucleotídeos dos genes NSP4 (rotavírus), RdRp (picobirnavírus) e S2 (reovírus), sendo que
no caso dos picobirnavírus as amostras foram clonadas antes do sequenciamento. A EGPA
demonstrou positividade em 0/85 (0%) amostras para RVA do grupo A, 13/85 (15,3%)
amostras para PBV e 01/85 (1,2%) amostras para ARV. No caso da RT-PCR foi verificado
positividade em 35/85 (41,2%), 42/85 (49,4%) e 28/85 (32,9%) das amostras para RVA, PBV
e ARV, respectivamente. Dos oito municípios estudados, sete apresentaram amostras
positivas para PBV e seis apresentaram amostras positivas para RVA e ARV. Das 37
granjas estudadas foi observada a presença dessas infecções virais em 19 (51,4%) para
RVA e ARV e 21 (56,8%) para PBV. As sequências do gene NSP4 apresentaram entre 86,3
e 90,5% de similaridade ao nível de nucleotídeo (nt) com protótipos de frangos e 93,5 e
100% de similaridade ao nível de nt quando comparadas entre si. As sequências do gene
RdRp apresentaram uma grande heterogeneidade genética com variantes gênicas
apresentando entre 56,1 e 100% de similaridade ao nível de nt com protótipos pertencentes
a várias espécies e fontes de contaminação e entre 50,3 e 100% de similaridade ao nível nt
quando comparadas entre si. Na análise das sequências do gene S2 de ARV foi observado
entre 90,9 e 94,4% de similaridade ao nível de nt com protótipos de frangos e 90,1 e 100%
de similaridade ao nível de nt quando comparadas entre si. Os RVA, PBV e ARV foram
detectados em granjas de frangos de corte da Mesorregião Metropolitana de Belém, sendo a
detecção por RT-PCR a mais eficiente ao detectar pelo menos um dos vírus nos oito
municípios pesquisados. Excetuando-se o PBV, que apresentou relacionamento
heterogêneo com os protótipos utilizados, o RVA e ARV deste estudo relacionaram-se
especificamente com amostras obtidas em aves. Este é o primeiro estudo envolvendo o
sequenciamento gênico do RVA, PBV e ARV em frangos de corte na região norte do Brasil. / This study aimed to investigate the occurrence of avian rotavirus (AvRV),
picobirnavirus (PBV) and avian reovirus (ARV) in chickens raised on farms located in
the Metropolitan mesoregion of Belém, Pará state, in the period of 2008 to 2011. For
this purpose, 85 pools of fecal samples were collected from 37 farms belonging to
eight counties. Viral RNA was extracted from fecal suspensions and subjected to
polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) followed by RT-PCR. At least one sample
was selected of each municipality wich positive result for nucleotide sequencing of
the genes NSP4 (AvRV), RdRp (PBV) and S2 (ARV), and in the case of the PBV
samples were cloned before sequencing. PAGE showed positive in 0/85 (0%)
samples for AvRV group A, 13/85 (15.3%) samples for PBV and 01/85 (1.2%)
samples for ARV. In the case of RT-PCR positive results was observed in 35/85
(41.2%), 42/85 (49.4%) and 28/85 (32.9%) of the samples for AvRV, ARV and PBV,
respectively. Of the eight counties studied, seven showed positivity to PBV, and six
for AvRV and ARV. Of the 37 farms studied the presence of these viral infections
was observed in 19 (51.4%) to AvRV and ARV and 21 (56.8%) to PBV. NSP4 gene
sequences had a similarity between 86.3 and 90.5% at the nucleotide level (nt) with
prototypes from chicken and 93.5 and 100% similarity at the nt level when compared
among them. RdRp sequences showed a high genetic heterogeneity with gene
variants resulting between 56.1 and 100% similarity at the nt level with prototypes
belonging to different species and sources of contamination and between 50.3 and
100% similarity at nt level when compared among them. S2 gene sequences
analysis showed between 90.9 and 94.4% similarity at the nt level with chicken
prototypes and 90.1 and 100% similarity at the nt level when compared each other.
AvRV, ARV and PBV were detected in broiler farms of the Metropolitan mesoregion
of Belém, being the detection by RT-PCR more efficient to detect at least one type of
virus in the eight counties surveyed. Except for the PBV, which showed
heterogeneous relationship with the prototypes used, the AvRV and ARV of this
study related specifically to the samples obtained in birds. This is the first study
involving the genomic sequencing of the AvRV, ARV and PBV in broilers in northern
Brazil.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpa.br:2011/6796 |
| Date | 29 August 2012 |
| Creators | SILVA, René Ribeiro da |
| Contributors | MASCARENHAS, Joana D'Arc Pereira, SILVA, Artur Luiz da Costa da |
| Publisher | Universidade Federal do Pará, Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais, UFPA, Brasil, Núcleo de Medicina Tropical |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPA, instname:Universidade Federal do Pará, instacron:UFPA |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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