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Previous issue date: 2012-08-08 / CAPES / Yersinia pestis é o agente causador da peste, doença primária de roedores transmitida por
pulgas, que pode afetar o homem e outros mamíferos. A subtipagem molecular das cepas de Y. pestis
tem sido dificultada pela grande similaridade genética entre os isolados. A análise dos locos CRISPR
(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) trouxe avanços em estudos filogenéticos
e tipagem de cepas de Y. pestis dos numerosos focos dos diversos países. O objetivo deste trabalho foi
avaliar a diversidade intraespecífica em cepas brasileiras de Y. pestis através do estudo dos locos
CRISPR. As três sequências CRISPR (YPa, YPb e YPc) reconhecidas da Y. pestis foram amplificadas
nas 98 cepas analisadas, originadas de diferentes fontes, focos e momentos epidemiológicos. Os
amplicons obtidos por PCR foram analisados em gel de agarose e sequenciados. O loco YPa se
mostrou o mais polimórfico, apresentando seis alelos de 449 a 630 pares de base (pb), seguido pelo
YPb, com quatro alelos de 271 a 392 pb. O loco YPc, monomórfico, apresentou apenas um alelo de
331 pb em toda as cepas. Foi observado que as repetições diretas (DRA) são compostas de 28 pb,
separadas por sequências espaçadoras únicas de 32 ou 33 pb em todos os locos. Dos 137 espaçadores já
conhecidos 18 foram encontrados nas cepas analisadas e, adicionalmente, 19 novos espaçadores foram
observados, 15 no loco YPa e quatro no loco YPb. A análise da distribuição dos espaçadores definiu 20
perfis genotípicos, refletindo a diversidade intraespecífica das cepas brasileiras, e evidenciou uma
correlação entre a presença de alguns conjuntos de sequências espaçadoras e os focos de origem das
cepas. A maioria dos perfis é exclusiva de uma cepa de um foco, e alguns são dispersos em vários
focos e períodos. As incorporações/perdas de motivos observadas nos locos YPa e YPb sugerem que
estes estão ativos e a ausência de alterações no loco YPc sugere inatividade. Em conclusão, a análise
dos locos CRISPR revelou heterogeneidade e identificou características genéticas exclusivas nas cepas
brasileiras que podem ser atribuídas à microevolução da bactéria após sua introdução no país.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/12610 |
| Date | 08 August 2012 |
| Creators | FRANÇA, Camila Tenorio |
| Contributors | ALMEIDA, Alzira Maria Paiva de, OLIVEIRA, Maria Betânia Melo de |
| Publisher | Universidade Federal de Pernambuco |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Breton |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE |
| Rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
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