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Previous issue date: 2010 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / A compreensão dos vários mecanismos de defesa vegetal tornou-se uma área central nas
pesquisas mundiais. Em plantas, uma primeira linha de defesa contra invasores inclui uma
variedade de peptídeos antimicrobianos, tais como defensinas - uma classe de pequenos
peptídeos básicos, ricos em cisteínas, distribuídos por todos os reinos. A crescente
disponibilidade de genomas completos recentemente sequenciados, grandes quantidades de
sequências expressas (ESTs Expressed Sequence Tags) e o desenvolvimento de tecnologias
computacionais ofereceram vários recursos e algoritmos que possibilitaram a aplicação de
abordagens baseadas em bioinformática para identificar potenciais peptídeos antimicrobianos.
Assim, o presente trabalho visou ao desenvolvimento de uma rotina computacional para
identificar e caracterizar prováveis defensinas nos genomas vegetais atualmente sequenciados.
Tal rotina foi desenvolvida com base em programas de computadores gratuitos disponíveis
pela internet, envolvendo a integração de dados provindos de sequências, reconhecimento de
padrões e motivos conservados em proteínas, perfil diferencial de expressão, análise evolutiva
e modelagem comparativa. Um exemplo da aplicabilidade dessa rotina foi demonstrado
usando o genoma expresso da cana-de-açúcar, evidenciando a presença de 17 sequências de
prováveis defensinas, evolutivamente relacionadas com peptídeos com atividade antifúngica
descritos em outras espécies. Em cana-de-açúcar parecem existir seis grupos de defensinas
envolvidas na defesa do organismo, cujos membros, apesar de bastante similares, apresentam
um padrão de expressão tecidual específico. A resolução da estrutura tridimensional através
de modelagem comparativa mostrou peptídeos globulares anfifilícos altamente compactos,
estabilizados por quatro pontes de cisteínas. A rotina estabelecida se mostrou eficaz e
potencialmente aplicável tanto às defensinas como a qualquer classe de peptídeos
antimicrobianos. O presente trabalho incluiu também revisões sobre o estado de arte atual das
pesquisas com defensinas vegetais, sua identificação e os principais bancos de dados que as
compõem, revelando que a eficiência da estratégia utilizada em cana-de-açúcar,
especialmente se integrada a dados oriundos de diversas fontes. Informações preliminares
como as presentemente apresentadas são fundamentais para a escolha de moléculas com
potencial antimicrobiano para o desenvolvimento de produtos farmacológicos
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/1271 |
| Date | 31 January 2010 |
| Creators | SILVA, Luis Carlos Belarmino da |
| Contributors | ISEPPON, Ana Maria Benko |
| Publisher | Universidade Federal de Pernambuco |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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