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Previous issue date: 2006 / O câncer do colo do útero é o segundo câncer em número de casos entre as
mulheres e o sétimo de maior incidência no mundo com 493 mil novos casos por
ano, com uma taxa de mortalidade de 50 a 55%. A estimativa para o Brasil é de
19.260 novos casos para 2006, com um risco estimado de 20,31 casos a cada 100
mil mulheres. No Brasil, assim como nos outros países em desenvolvimento, a
freqüência do teste de Papanicolau é baixa e os casos são normalmente
diagnosticados em fase avançada. Em todo o mundo o Papillomavirus Humano
(HPV), diretamente associado ao câncer do colo do útero, é um problema de saúde
pública. A análise do genoma, através da genômica comparativa, dos HPVs de alto
e baixo risco pode indicar regiões de grande importância associadas à sua
patogenicidade. O presente trabalho propõe uma metodologia capaz de classificar o
risco à carcinogenicidade utilizando as seqüências de cinco proteínas, E6, E7, E1,
L1 e L2 que estão presente em 78 genomas de HPV disponíveis nos bancos de
dados públicos. Utilizando-se dos Modelos Ocultos de Markov (HMM) foram
selecionadas 24 regiões nas cinco proteínas. Destas 24 regiões, oito foram
escolhidas após aplicação de modelo discriminativo baseado em Máquinas de
Vetores de Suporte (SVM) acoplado a um algoritmo genético. Diferentes
combinações destas oito regiões produziram um conjunto de classificadores
capazes de predizer com 100% de eficiência o tipo de risco do HPV. Esta técnica
permitiu determinar regiões de potencial importância na carcinogenicidade do HPV.
Tais resultados sugerem regiões gênicas de interesse para o desenvolvimento de
um método de diagnóstico da presença do DNA viral, contribuindo na prevenção do
câncer do colo do útero
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/2002 |
| Date | January 2006 |
| Creators | Henrique Madeiros Castelletti, Carlos |
| Contributors | Luiz de Lima Filho, José |
| Publisher | Universidade Federal de Pernambuco |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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