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Previous issue date: 2005 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) exibe uma enorme variabilidade
genética. Tal característica é criticamente importante para que o vírus possa se
adaptar às mudanças ambientais e escapar ao sistema imune do hospedeiro,
desenvolver resistência à drogas e impedir o sucesso de eventuais vacinas.
Portanto, entender esta diversidade é fundamental para se desenvolver vacinas e
drogas eficientes, extremamente necessárias para se conter a epidemia de
HIV/AIDS. Neste estudo, nós investigamos a magnitude da diversidade das
principais variantes de HIV-1 circulante no Brasil, através de seqüênciamento e
análise de genoma completo.
O DNA foi extraído de 22 amostras previamente classificadas em nosso
laboratório como sendo 6 subtipos B, 8 subtipos C e 8 subtipos F, com base no
seqüênciamento de pequenos amplicons. A reamplificação do DNA destas amostras
foi realizada por PCR de fragmentos sobrepostos, seguido por seqüênciamento
direto.
Duas de seis amostras identificadas parcialmente como subtipo B e seis de
oito amostras identificadas parcialmente como subtipo F foram então
caracterizadas como BF recombinantes pela análise de seus genomas completos.
Todas as 8 amostras previamente classificadas como subtipo C apresentaram-se
como cepas não recombinantes através da análise de genoma completo. Dois
recombinantes BF possuem estrutura de recombinação genômica idêntica, porém
diferente da cepa Argentina CRF 12_BF, e provavelmente representam uma nova
forma recombinante circulante no Brasil. As análises das seqüências dos subtipos
C e F revelaram uma linhagem distinta altamente suportada pela filogenia, cada
qual correspondendo a sua cepa de referência brasileira. Nossos dados indicam
fortemente que a atual epidemia Brasileira de HIV-1 com as cepas dos subtipos C e
F foi introduzida no país por um único evento, e não por fontes múltiplas. Além
disso, a evidencia da recombinação BF obtida pela análise do genoma completo do
HIV, indica uma disseminação dos recombinantes BF em nossa população de
infectados pelo HIV-1 que pode representar força significativa na evolução do vírus. / BV UNIFESP: Teses e dissertações
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.unifesp.br:11600/20590 |
| Date | January 2005 |
| Creators | Sanabani, Sabri Saeed [UNIFESP] |
| Contributors | Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Sabino, Ester Cerdeira [UNIFESP] |
| Publisher | Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | 102 f. |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UNIFESP, instname:Universidade Federal de São Paulo, instacron:UNIFESP |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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