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Avaliação do potencial de biodegradação de gasolina por bactérias do gênero burkholderia / Evaluation of potential gasoline biodegradation by bacteria of the genus Burkholderia

BRITO, D. Avaliação do potencial de biodegradação de gasolina por bactérias do gênero burkholderia. 2012. 69 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Campus de Sobral, Universidade Federal do Ceará, Sobral, 2012. / Submitted by Djeanne Costa (djeannecosta@gmail.com) on 2016-06-21T15:49:02Z
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Previous issue date: 2012 / The generic taxon Burkholderia presents a high metabolic diversity that allows these
protobacteria live in a wide range of habitats, among these are the soil, water (including
sea water), plants, fungi, animals and even humans. A remarkable biotechnological
application is the capacity to promote the pollutants biodegradation. Thus, this study
aimed the identification of Burkhoderia SMF 090 isolate, as well the evaluation of its
potential on the utilization of gasoline as a carbon source and the identification of
metabolic pathways possibly involved in the degradation of gasoline on its components
through realization of proteomic analysis. The identification of the SMF 090 isolate and
the analysis of molecular phylogeny were carried out by 16S rRNA gene sequencing. In
addition, the molecular phylogeny was analyzed and phylogenetic trees were
reconstructed using other bacteria from the same genus. In order to characterize the
growth pattern of SMF 090, bacterial growth curves were assessed using the media TY
(a nutritive media), BH (a medium without carbon), BH plus commercial gasoline and
BH plus D-glucose. The study of differentially expressed proteins was performed using
bidimensional electrophoresis, mass spectrometry and bioinformatics analysis. After the
16S rRNA analysis was suggested that SMF 090 is related to Burkholderia
sabiae Br3407 and both descended from a recent common ancestral. The strain grown
in mineral media containing gasoline as the unique carbon source. Differentially
expressed proteins were observed between the tested groups and these proteins may be
associated to the metabolic degradation of hydrocarbons. The analysis of data provided
by 2DE electrophoresis and mass spectrometry allowed the identification of various
proteins related to the monocyclic and polycyclic aromatic hydrocarbons catabolism
pathway. Therefore, this study showed relevant results about the growth of
Burkholderia as a potential gasoline biodegradant. / O táxon genérico Burkholderia apresenta grande diversidade metabólica, possibilitando
que estas proteobactérias vivam numa variedade de habitats, dentre os quais destacamos o solo, água (incluindo água do mar), plantas, fungos, animais e até mesmo seres humanos. Uma das aplicações biotecnológicas mais marcantes é a capacidade
de promover a biodegradação de poluentes. Assim, este estudo visou a identificação do
isolado de Burkholderia SMF 090, bem como a avaliação do potencial na utilização da
gasolina como fonte de carbono e a identificação de vias metabólicas possivelmente
envolvidas na degradação dos componentes da gasolina através da realização de
análises proteômicas. A identificação do isolado SMF 090 e análise da filogenia
molecular foi realizada pelo sequenciamento do gene 16S rRNA. Posteriormente, foram
realizadas análises de filogenia molecular e reconstrução de árvores filogenéticas com
outras bactérias do gênero. Para a caracterização do perfil de crescimento do isolado
SMF 090 foram realizadas curvas de crescimento em meio nutritivo (TY), meio sem
fonte de carbono (BH), BH suplementado com gasolina comercial e BH suplementado
com D-glicose. O estudo das proteínas diferencialmente expressas ocorreu através de
eletroforese bidimensional, de espectrometria de massa e análises de bioinfomática.
Através da análise do 16S rDNA, sugeriu-se que SMF 090 está relacionada
à Burkholderia sabiae Br3407 e ambos descendem de um ancestral comum recente. A
bactéria estudada foi capaz de crescer em meio mineral contendo gasolina como única
fonte de carbono. Foi possível observar proteínas diferencialmente expressas entre os
grupos testados, as quais podem estar associadas ao metabolismo de degradação de
hidrocarbonetos. As análises dos géis de 2DE e os dados de espectrometria de massas
permitiram a identificação de várias proteínas das vias de catabolismo dos
hidrocarbonetos aromáticos monocíclios e policíclicos. Portanto, o estudo apresentou
informações relevantes sobre o metabolismo de Burkholdeiras como potenciais biodegradadoras de gasolina

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.repositorio.ufc.br:riufc/17833
Date January 2012
CreatorsBrito, Daniel de
ContributorsCunha, Rodrigo Maranguape Silva da
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFC, instname:Universidade Federal do Ceará, instacron:UFC
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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