The phenylpropanoid pathway is highly researched due to t he putative nutraceutical benefits of its secondary metabolites. The enzymes of this pathway are member of gene families, but the exact number of gene homologues has to date been unknown. In this study, expressed sequence tags (ESTs) were used to identify all homologues in the isoflavonoid pathway of soybean (Glycine max L. Merr.). Gene expression of all homologues in whole tissues, and at a cellular level in the pod was also investigated using laser capture microdissection (LCM) and real time reverse-transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR). Computational promoter analysis was undertaken to identify common regulatory motifs among the gene homologues. We have identified novel 2-hydroxyisoflavanone dehydratase and isoflavone-7-O-glucosyltransferase homologues. Differential expression of multiple gene homologues was discovered in numerous tissues. Our promoter analysis discovered five motifs which were previously identified within the promoter regions of the phenylpropanoid pathway in other plant species. / La plupart des gènes de la voie métabolique des phenylpropanoïdes chez le soya incluent plusieurs homologues, mais leur nombre exact pour chacun des gènes demeure inconnu. L'expression de tous les homologues fut observée dans plusieurs tissus et au niveau cellulaire dans la cosse utilisant les méthodes de « laser capture microdissection » et de « real-time reverse-transcription polymerase chain reaction ». Une analyse de promoteurs in silico a été réalisée afin d'identifier des motifs régulateur commun chez les homologues. Cette étude a identifié un gène 2-hydroxyisoflavanone dehydratase nouveau en plus de cinq gènes isoflavone-7-O-glucosyltransferase. En outre, l'expression différentielle de plusieurs des homologues fut observée surtout dans les racines, les cotylédons et dans la couche exocarpe de la cosse. L'analyse de promoteur a découvert cinq motifs, qui ont auparavant été identifiés aussi dans des promoteurs de la voie métabolique des phenylpropanoid de d'autres espèces de plantes.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LACETR/oai:collectionscanada.gc.ca:QMM.66992 |
| Date | January 2009 |
| Creators | Livingstone, Julie |
| Contributors | Martina Stromvik (Supervisor) |
| Publisher | McGill University |
| Source Sets | Library and Archives Canada ETDs Repository / Centre d'archives des thèses électroniques de Bibliothèque et Archives Canada |
| Language | English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation |
| Format | application/pdf |
| Coverage | Master of Science (Department of Plant Science) |
| Rights | All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated. |
| Relation | Electronically-submitted theses. |
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