En el primer estudi d’aquesta tesi, es vàren estudiar diferents brots que presentàven
patología respiratòria per tal de detectar-ne la presència de virus de la influença porcina.
En catorze casos es vàren detectar virus de la grip circulants. Aquests van ser aïllats,
seqüenciats a nivell de genoma complet i comparats amb altres virus de la influença
coneguts. Els virus aïllats pertanyien als subtipus H1N1 (n=6, incloent un virus
pandèmic H1N1 humà), H3N2 (n=4), i H1N2 (n=4). En 11/14 casos es van detectar
possibles reorganitzacións genètiques mitjançant l’anàlisi filogenètica. En una segona
part es va analitzar l’evolució genètica d’aïllats H1N1 obtinguts en un estudi
longitudinal d’un lot de porcs durant 6 mesos. La seqüenciació de 22 aïllats obtinguts en
aquesta explotació van indicar la co-circulació de dues variants del mateix virus, així
com l’emergència de noves soques recombinants en diferents moments. Aquests
resultats indiquen que les reorganitzacions genètiques són comuns i corroboren la
importància de conèixer la epidemiologia dels virus de la influenza porcina,
particularment en explotacions endèmiques. En el segon estudi d’aquesta tesi, els aïllats
seqüenciats prèviament es varen analitzar mitjançant la inhibició de l’hemaglutinació.
Aquesta anàlisi es va fer amb l’ús de sèrums mono-específics obtinguts de porcs
immunitzats i amb 100 sèrums obtinguts d’explotacions porcines comercials
seropositives a grip i no vacunades. Els resultats obtinguts van permetre detectar una
gran diversitat antigènica dels virus H1N1. En canvi, els virus H1N2 i H3N2 circulants
semblen ser més homòlegs per subtipus al analitzar la seva reactivitat creuada. Quan es
van comparar les seqüències d’amino àcids del gen de la hemaglutinina es va observar
que els virus H1N1 també presentaven una major quantitat de canvis de residus que els
altres dos subtipus. Les causes d’aquestes característiques antigèniques diferents de
cada subtipus no es coneixen i probablement són reflex una epidemiologia diferent. / En el primer estudio de esta tesis, se estudiaron diferentes brotes de enfermedad
respiratoria en cerdos para detectar la presencia del virus de la influenza porcina. En
catorce casos se obtuvo el aislamiento de virus influenza A. Los aislados víricos se
secuenciaron en todos sus genes y las secuencias se compararon con otros virus de la
influenza porcina. Los virus aislados pertenecían a los subtipos H1N1 (n=6, incluyendo
un virus pandémico H1N1 humano), H3N2 (n=4), y H1N2 (n=4). En 11/14 casos se
detectaron posibles reorganizaciones genéticas en los genes examinados. En una
segunda parte se analizó la evolución genética de aislados H1N1 obtenidos en un
estudio longitudinal de un lote de cerdos durante 6 meses. La secuenciación de 22
aislados obtenidos en esa explotación indicaron la co-circulación de dos variantes del
mismo virus, así como la emergencia de virus recombinantes en diferentes momentos.
Estos resultados indican que las reorganizaciones genéticas son comunes y corroboran
la importancia las situaciones endémicas. En el segundo estudio de esta tesis, los
aislados secuenciados previamente se analizaron mediante la inhibición de la
hemaglutinación (IHA). Este análisis se hizo con el uso de sueros mono-específicos
obtenidos de cerdos inmunizados con los aislados obtenidos anteriormente y con 100
sueros obtenidos de explotaciones porcinas comerciales no vacunadas. Los resultados
obtenidos permitieron detectar una gran diversidad antigènica entre los virus H1N1. En
cambio, los virus H1N2 y H3N2 circulantes parecen ser más homólogos al analizar su
reactividad cruzada. Cuando se compararon las secuencias de aminoácidos del gen de la
hemaglutinina se observó que los virus H1N1 también presentaban una mayor cantidad
de cambios en los residuos aminoacídicos que los otros dos subtipos. Las causas de
estas diferentes características antigénicas de cada subtipo no se conocen y
probablemente son reflejo de particularidades epidemiológicas. / In the first study of the present thesis, outbreaks of respiratory disease were investigated
for the presence of swine influenza virus (SIV). In 14 cases the circulating
influenzaviruses were isolated, fully sequenced and compared with other known SIV.
H1N1 (including human pandemic H1N1) was the most common subtype involved in
the outbreaks (n=6), followed by H3N2 (n=4) and H1N2 subtypes (n=4). In 11/14 cases
the phylogenetic analyses indicated the occurrence of possible reassortment events. In
the second part of the study, the genetic evolution of a H1N1 isolate was assessed over a
six-month period in a longitudinal study in closed group of pigs. Sequencing of 22
isolates retrieved during that follow-up indicated the co-circulation of two different
variants of the same virus. Also, the emergence of SIV reassortants at certain timepoints
was evidenced. These results indicate that reassortment events in SIV are
common, and point towards the need for a better understanding of the epidemiology of
SIV, particularly in endemic farms. In the second study of the present thesis, SIV
isolates sequenced in the first study where analyzed by means of the haemagglutination
inhibition assay (HI) using monospecific sera obtained from pigs immunized with the
different isolates. Also, 100 serum samples obtained from seropositive and
unvaccinated commercial farms were analyzed. Based on those analysis, a high
antigenic diversity was found when comparing the H1N1 viruses. In contrast, HN2 and
H3N2 viruses circulating in Spanish swine seemed to have less antigenic diversity
regarding their cross-reactivity in the HI. Comparing the amino acid sequences of the
haemagglutinin of the analyzed isolates, H1N1 viruses had more changes than the other
subtypes. The causes behind this different behavior depending on the subtype are
unknown and probably reflect a different epidemiology.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:TDX_UAB/oai:www.tdx.cat:10803/117539 |
| Date | 14 December 2012 |
| Creators | Martin Valls, Gerard Eduard |
| Contributors | Mateu, Enric M., Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals |
| Publisher | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Source Sets | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Language | English |
| Detected Language | Spanish |
| Type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis, info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| Format | 244 p., application/pdf |
| Source | TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess, ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs. |
Page generated in 0.0025 seconds