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Role and regulation of MAPKinases in pathogen-induced signaling in Arabidopsis thaliana / Rôle et régulation des MAPKinases dans la signalisation induite par les pathogènes chez Arabidopsis thaliana

Les plantes induisent des réponses de défense après la perception de pathogènes. Des protéines appelées mitogen-activated protein kinases (MAPKS) sont impliquées dans le réseau complexe de signalisation établi pendant cette défense. Cependant, la connaissance actuelle de leur fonction est encore limitée. L'objectif de ma thèse était de contribuer à une meilleure compréhension de leur rôle et régulation pendant la défense. Premièrement, j'ai participé au décryptage des contributions spécifiques et coopératives de trois MAPKS impliquées dans l'immunité, à savoir MPK3, MPK4 et MPK6. Nous avons montré que ces MAPKS sont d'importants régulateurs de la reprogrammation transcriptionnelle induite pendant la défense. Deuxièmement, nous avons réalisé des approches de phosphoprotéomique et nous avons développé un protocole permettant d'enrichir des protéines associés à la chromatine, ce qui a permis d'identifier de nouveaux phosphosites ainsi que des protéines différemment phosphorylées pendant la défense, notamment de probables substrats des MAPKS. Troisièmement, nous avons identifiés plusieurs dizaines de protéines interagissant potentiellement avec le module MEKKI-MKK2-MPK4. Globalement, ce travail a révélé de nouvelles fonctions des MAPKS dans l'immunité des plantes. Ce travail a aussi permis d'identifier de nouveaux substrats potentiels des MAPKS et suggère que le module MEKK1-MKK2-MPK4 est soumis à une régulation hautement complexe via de multiples interacteurs proétiques et PTMS. / Plants induce defense responses after perception of invading pathogens. Proteins called mitogen-activated protein kinases (MAPKS) are implicated in the complex signaling network occuring in plant immunity. However, the current knowledge of their function is still limited. The objective of my PHD was to contribute to a better understanding of their role and regulation in plant defense. First, i was involved in the deciphering of the specific and cooperative contributions of three MAPKS involved in plant immunity, namely MPK3, MPK4 and MPK6. We charcacterized several hallmarks of defense in WT and MAPK mutant plants. We showed notably that immune MAPKS are important regulators of the transcriptional reprogramming occuring during defense. Second, we applied phosphoproteomic approaches and we developed a protocol to enrich for chromatin-associated proteins which allowed identifying new phosphosites as well as proteins differentially phosphorylated during defense, notably some probable MAPKS substrates. Third, we identified several tens proteins potentially interacting with the immune MEKK1-MKK2-MPK4 module via the purification of protein complexes in vivo. Fourth, we identified diverse post-translational modification (PTMS) on each component of the MEKK1-MKK2-MPK4 module. Overall, this work revealed new functions for MAPKS in plant immunity. This work also provided new candidate MAPK substrates and suggests that the MEKK1-MKK2-MPK4 module is subjected to a highly complex regulation via multiple interacting proteins and PTMS.

Identiferoai:union.ndltd.org:theses.fr/2014EVRY0032
Date03 December 2014
CreatorsBigeard, Jean
ContributorsEvry-Val d'Essonne, Hirt, Heribert
Source SetsDépôt national des thèses électroniques françaises
LanguageEnglish
Detected LanguageFrench
TypeElectronic Thesis or Dissertation, Text, Image

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