Acinetobacter baumannii est une bactérie responsable d’infections communautaires, en particulier dans les régions tropicales et chez des blessés lors de conflits armés. Or, les réservoirs extra-hospitaliers de la bactérie sont peu connus. L’objectif de ce travail était d’étudier ces réservoirs dans une zone tropicale, l’île de la Réunion, en étudiant à la fois le réservoir animal (dépistage), environnemental et humain. En parallèle, des études ont été conduites en zone tempérée (France métropolitaine), avec le dépistage des animaux domestiques. Dans un premier temps, l’identification des espèces du complexe Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii par spectrométrie de masse a été perfectionnée sur l’automate VitekÒ MS. La deuxième partie du travail a permis de mettre en évidence une prévalence élevée de portage de la bactérie chez les animaux domestiques réunionnais (6,5 et 8,5%). Une prévalence inférieure a été décelée chez les animaux domestiques de métropole (2,7%). Dans tous les réservoirs étudiés, une grande diversité des souches a été retrouvée lors de l’analyse par Multi-Locus Sequence Typing, avec la mise en évidence de nouveauxSequence Types. Enfin, 2 souches productrices d’OXA-23 et OXA-24 ont pu être isolées respectivement en portage chez un patient et un animal d’élevage de l’île de la Réunion, et 2 souches productrices d’OXA-23 ont été isolées chez des animaux de compagnie de métropole. Ce travail a permis des observations intéressantes sur l’épidémiologie communautaire d’ A. baumannii. D’autres travaux restent à prévoir pour mieux comprendre les relations entre les réservoirs extra-hospitaliers, mais aussi avec le réservoir hospitalier. / Acinetobacter baumannii is a bacterium responsible for community-acquired infections, especially in tropical areas and among soldiers during warfare. However, community reservoirs of this bacterium are not very well known. The aim of this work was to study these reservoirs in a topical area, Reunion Island, by analyzing at the same time the animal (carriage), the environmental, and the human reservoirs. Studies were also performed in a temperate zone (metropolitan France), by analyzing carriage of companion animals. First, identification of species belonging to the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex by mass spectrometry has been improved on the VitekÒ MS automated system. In asecond part of the study, a high prevalence of A. baumannii carriage has been observed in domesticated animals of La Reunion Island (6,5 and 8,5%). A lower prevalence has been detected in metropolitan companion animals (2,7%). Within allthe reservoirs studied, a great diversity of strains isolated has been shown by Multi-Locus Sequence Typing analysis, with the dicovery of new Sequence Types. At last, 2 strains producing OXA-23 and OXA-24 have been isolated respectively in carriage in a patient and in a livestock animal of La Reunion Island, and 2 strains producing OXA-23 have been isolated in metropolitan companion animals. This work has permitted to do some interesting observations on the community epidemiology of A. baumannii. Other studies are needed to better understandrelationships between the different community reservoirs, and also with the hospital reservoir.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:theses.fr/2016ANGE0014 |
| Date | 27 May 2016 |
| Creators | Pailhories, Hélène |
| Contributors | Angers, Eveillard, Matthieu |
| Source Sets | Dépôt national des thèses électroniques françaises |
| Language | French |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation, Text |
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