[pt] A comparação das respostas bioquímicas, morfológicas e genotóxicas de organismos coletados em áreas com e sem histórico de contaminação é útil para avaliar a qualidade ambiental dos ecossistemas. Este trabalho analisou as respostas de biomarcadores utilizando Mugil liza, Geophagus brasiliensis e Tilapia rendalli. Os peixes foram coletados da Lagoa Rodrigo de Freitas, Magé (Praia de Ipiranga e Olaria), São Gonçalo (Gradim), Itaipu e Lagoa de Jacarepaguá. Em laboratório foi realizada a morfometria dos peixes, para cálculo do Índice Gonadossomático (IGS), Índice Hepatossomático (IHS) e Fator de Condição (FC). Foram retirados os encéfalos das tainhas para obtenção da Acetilcolinesterase, que foi exposta a soluções padrão de hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPA), para verificar a influência destes na atividade da enzima. As bílis dos peixes foram retiradas para determinação da concentração de metais e de biliverdina. Os fígados e gônadas foram retirados para análises histopatológicas. Os resultados indicaram que não houve correlações entre o IGS e o IHS. Os dados preliminares da atividade da AChE em presença de HPA não foram conclusivos. As análises das bílis de peixes para o teor de metais demonstraram a presença de Níquel, Selênio, Arsênio e Cromo na bílis da espécie Mugil liza, tanto da Praia de Ipiranga quanto de Itaipu. A concentração de biliverdina não apresentou relação significativa com a concentração de HPA, como sugerido por alguns autores. As análises histopatólogicas indicaram anormalidades celulares mais aparentes na Praia de Ipiranga do que em Itaipu, com presença maior que o normal de melanomacrófagos, infiltrações leucocitárias e parasitas. / [en] The comparison of biochemical, morphological and genotoxic responses sampled from areas protected from cronic or acute contamination with responses of organisms sampled from historically contaminated areas is useful in determining the environmental quality of ecosystems. This study aimed to analyse biomarker responses using Mugil liza (mullets), Geophagus brasiliensis (acaras) and Tilapia rendalli (tilapias). The fish were sampled from the Rodrigo de Freitas Lagoon, Magé (Ipiranga beach and Olaria), São Gonçalo (Gradim), Itaipu and Jacarepaguá Lagoon. At the laboratory, morfometric measurements were taken, in order to calculate the Gonadossomatic Index (GSI), Hepatossomatic (HSI) and Condition Factor (CF). Mullet brains were removed to obtain Acetilcolinesterase, which was then exposed to standard-solutions of polycylic aromatic hydrocarbons (PAH), to verify the influence these compounds might have on the activity of the Acetilcolinesterase enzyme. The fish bile was removed to determine metals and billiverdin concentrations. Livers and gonads were removed to conduct hystopathological analyses. Results indicated no correlation between the GSI and HSI. Preliminary data on the AChE activity in the presence of HPA were not conclusive. The fish bile analysis regarding metals demonstrated the presence of Nickel, Selenium, Arsenium and Chrome in the bile of the species Mugil liza, both from Ipiranga beach and Itaipu. Billiverdin concentrations did not present significant relationship with HPA concentration, as suggested by some authors. The hystopathological analyses indicated more cellular abnormalities in fish sampled from Magé than in Itaipu, with the presence of higher than normal number of melanomacrophages, leucocitary inflitrations and parasites.