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Caracterização ambiental do complexo de espécies Cryptococcus neoformans e C. gattii no interior do estado de São Paulo, Brasil /

Janeck-Araujo, Matheus January 2020 (has links)
Orientador: Márcia Marinho / Resumo: A criptococose é uma doença sistêmica causada pela inalação de basidiosporos desidratados de espécies patogênicas do gênero Cryptococcus presentes no ambiente. Os complexos espécies mais associados à doença são os complexos de espécies Cryptococcus neoformans e C. gattii. O complexo de espécies C. neoformans está associado a casos de criptococose em pacientes imunossuprimidos, sendo comumente isolados do solo e de fezes de aves. O complexo de espécies de C. gattii, por sua vez, afeta principalmente indivíduos imunocompetentes e geralmente é isolado em espécies de árvores nativas ou exóticas em estado de biodegradação. Este estudo teve como objetivo realizar o mapeamento ambiental de espécies patogênicas do gênero Cryptococcus em amostras ambientais arbóreas em locais públicos da cidade de Birigui, São Paulo. Para a coleta das amostras, foram selecionadas regiões com maior trânsito neste município. Após processamento, foram realizados testes morfo-fisiológicos, bioquímicos, teste de assimilação de carbono e nitrogênio e PCR URA5 e RFLP com dupla digestão enzimática para caracterização do complexo de espécies/espécie de Cryptococcus. Entre fevereiro de 2018 e março de 2019, foram coletadas 100 amostras de diferentes árvores em locais arborizados públicos. A porcentagem de colonização das árvores por C. gattii VGII foi de 5%, por C. neoformans VNIV de 1% e foram encontrados 6% de C. laurentii e 3% de C. albidus. Estes resultados sugerem a existência de micro-focos e diversidade ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Cryptococcosis is a systemic disease caused by the inhalation of dehydrated basidiospores of pathogenic species of Cryptococcus genus present in the environment. The two species complex associated with the disease are the Cryptococcus neoformans and C. gattii species complex. C. neoformans species complex are associated with cases of cryptococcosis in immunosuppressed patients, being commonly isolated from the soil and birds feces. C. gattii species complex affects mainly immunocompetent individuals and are often isolated in native or exotic tree species in some state of biodegradation. This study aimed to perform the environmental mapping of pathogenic species of the genus Cryptococcus in tree samples of public places of the city of Birigui, São Paulo. For collection, the samples were collected from regions with greater traffic in this city. After processing, morphophysiological, biochemical, carbon and nitrogen assimilation and URA5 PCR and RFLP with double enzymatic digestion tests were performed to characterize the Cryptococcus species/species complex. Between february 2018 and march 2019 was collected a total of 100 samples from different trees in public arborized locations. The percentage of tree colonization by the C. gattii VGII was 5%, for C. neoformans VNIV was 1% and was found 6% of C. laurentii and 3% of C. albidus species. These results obtained suggests that there are a micro-foci and diversity of pathogenic Cryptococcus species in some arboreal environment loca... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Desempenho e caracterização de sementes de diferentes procedências de Cedrela fissilis Velozzo /

Baldo, Tatiane. January 2012 (has links)
Orientador: Rinaldo César de Paula / Banca: Cibele Chalita Martins / Banca: Sérgio Roberto Garcia dos Santos / Resumo: O presente trabalho objetivou avaliar a qualidade fisiológica e caracterizar as sementes de Cedrela fissilis de diferentes procedências do Estado de São Paulo. Sementes de seis procedências (Assis, Bauru, Mogi Guaçu, Pindorama, Piracicaba e Promissão) foram submetidas a caracterização biométrica (comprimento, largura, espessura e massa de 1.000 sementes); ao teste de germinação a 25 °C, sob luz continua, entre papel, por 14 dias e aos seguintes testes de vigor: teste de envelhecimento acelerado a 45 °C por 48 h; condutividade elétrica a 25 °C e 75 mL de água por 2, 4, 6, 12, 24, 48, 72, 96 e 120 h; comprimento de plântulas; massa de matéria seca de plântulas e germinação sob estresse hídrico simulado com o uso de polietileno glicol (PEG 6000), nos seguintes potenciais osmóticos: 0,0; -0,1; -0,2; -0,3; -0,4; -0,5; -0,6; -0,8; -1,0 e -1,2 MPa. Os dados foram submetidos à analise de variância, teste de Tukey para comparação das médias e regressão. Verificou-se diferenças em tamanho e massa de sementes, bem como na capacidade germinativa e vigor das sementes de cedro de diferentes procedências. O teste de envelhecimento acelerado foi eficiente para a avaliação da qualidade fisiológica das sementes de cedro. Não houve influência do tamanho e massa das sementes sobre a germinação. A tolerância de sementes de cedro ao estresse hídrico é variável entre as procedências / Abstract: This study aimed to evaluate and characterize the physiological quality of seeds of different provenances Cedrela fissilis the State of São Paulo. Seeds of six provenances (Assis, Bauru, Mogi Guaçu, Pindorama, Piracicaba and Promissão) were evaluated to biometric characteristics (length, width, thickness and weight of 1000 seeds) to the germination test at 25 °C under light continues among paper for 14 days and the following tests vigor: accelerated aging test at 45 °C for 48 h; the electrical conductivity at 25 °C, and 75 mL of water for 2, 4, 6, 12, 24, 48, 72 , 96 and 120 h; seedling length, dry weight of seedlings and also to the germination test under water stress, simulated with polyethylene glycol (PEG 6000) in the following osmotic potentials: 0.0, -0.1, -0.2, -0.3, -0.4, -0.5, -0.6, -0.8, -1.0 and -1.2. The data were subjected to analysis of variance, Tukey test and regression. There were differences in biometric traits and germination and vigor of cedar seeds from different provenances. The accelerated aging test is efficient to evaluate the physiological quality of seeds of cedar. There were not influence the size and weight of seeds on germination. The tolerance of seeds to water stress varies among provenances / Mestre
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Variabilidade genética em progênies de guapuruvu Schizolobium parahyba (Vell.) Blake /

Chinelato, Fernanda Carolina Silva, 1979. January 2011 (has links)
Orientador: Edson Seizo Mori / Banca: Simey Thuruy Vieira Fisch / Banca: Mário Luiz Teixiera de Moraes / Resumo: O guapuruvu Schizolobium parahyba (Vell.) S. F. Blake é uma espécie pioneira de rápido crescimento da família Fabaceae (Leguminosae) de grande importância em projetos de restauração. Com o objetivo de verificar a variabilidade genética de progênies Schizolobium parahyba da região de Botucatu - SP foram estimados os parâmetros genéticos das características quantitativas de 10 locais. As mudas foram produzidas no viveiro do Departamento de Ciência Florestal - UNESP/Campus de Botucatu. O teste de progênies de polinização aberta foi instalado na Fazenda Experimental Lageado, UNESP/Campus de Botucatu e disposto no delineamento experimental em blocos casualizados com 60 progênies, três repetições, quatro plantas por parcelas lineares e em espaçamento 3 x 2 m. Os caracteres avaliados foram: diâmetro na altura do peito (DAP) e altura de plantas (H), em quatro idades: 2, 7, 14 e 20 meses, assim como a porcentagem de sobrevivência, aos 20 meses. Os dados foram analisados pelo software Selegen-REML-BLUP. Em média, as progênies de guapuruvu, aos 14 meses, atingiram 2,23 m de altura e 2,96 m aos 20 meses, com 6,0 e 7,5 cm de DAP, aos 14 e 20 meses, respectivamente. Os coeficientes de variação genética individual, variação genotípica entre progênies e variação relativa, mostraram uma variabilidade genética um pouco restrita e muito influenciada pelo ambiente, mesmo em condições onde os coeficientes de variação residual estão aceitáveis entre 12,8 e 21,1%, sendo um comportamento típico de caracteres altamente poligênicos, sugerindo o uso de seleção recorrente para a espécie. Os coeficientes de herdabilidade ao nível individual foram maiores para altura (0,32, 0,01, 0,25 e 0,39) em relação ao DAP (0,13, 0,01, 0,02 e 0,02) ... / Abstract: Guapuruvu Schizolobium parahyba (Vell.) S.F. Blake is a species of rapid growth belonging to the Family Fabaceae (Leguminosae), highly important for restoration programs. Aiming to verify the genetic variability of S. parayba progenies from Botucatu region, SP, Brazil, we estimate quantitative genetic parameters of 10 different provenances. Seedlings were done in nursery of Department of Forest Science (DCF) - São Paulo State University (UNESP) - Botucatu, São Paulo, Brazil. The open pollinated progeny trial was set up in Lageado Experimental Station of São Paulo State University (UNESP) - Botucatu through statistical design of randomized blocks, with 60 progenies, three replications, four plants per linear plots, and by 3 x 2 m of plant spacing. The studied traits were diameter of breast height (Dbh) and plant height (H) for four ages: 02, 07, 14, and 20 months old, and for plant survival we only studied by the 20 months old. Data were analyzed though Selegen-REML-BLUP software. In average, guapuruvu progenies by the 14 months old, reached 2.23 m of height and 2.96 m by the 20 months old, with 6.0 and 7.5 cm of Dbh, through 14 and 20 months old, respectively. Coefficients of individual genetic variation, genotypic variation among progenies, and relative variation have shown low genetic variability, and therefore, high environmental influence, even with coefficients of residual variation in acceptable levels from 12.8 to 21.1%. The presented coefficients are the typically occurrence by the polygenic traits, showing the necessity of use of recurrent selection in breeding programs. Heritability coefficients by the individual levels were higher for plant height (0.32, 0.01, 0.25, and 0.39) than Dbh (0.13, 0.01, 0.02, and 0.02) through the 02, 07, 14, and 20 months old, respectively. Similar values were found for additive heritability within progenies. Close results were obtained for heritability ... / Mestre
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Estudo dos impactos do corte seletivo de árvores na diversidade genética e demografia de população de araucaria angustifolia, utilizando modelagem ecogene /

Dal Bem, Edjair Augusto. January 2014 (has links)
Orientador: Alexandre Magno Sebbenn / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Banca: João Antonio da Costa Andrade / Banca: Ana Aparecida Bandini Rossi / Banca: Paulo Henrique Muller da Silva / Resumo: Araucaria angustifolia é uma árvore conífera, dióica, polinizada pelo vento e economicamente importante na região sudeste e Sul do Brasil. No século passado, a espécie foi intensamente explorada pelo regime de corte raso, sendo que hoje existem menos de 3% de suas florestas originais. Recentemente, levantou-se a hipotese de voltar a explorar as florestas remanescentes de A. angustifolia, utilizando-se o corte seletivo, com base para planos de manejo de baixo impacto. Este trabalho tem por objetivo investigar como o corte seletivo de árvores de A. angustifolia afeta no longo prazo a demografia, produção de madeira e a diversidade genética de suas populações e quais são os cenários de corte seletivo que garantam a sustentabilidade na produção de madeira e não afete drasticamente a diversidade genética das populações exploradas utilizando o modelo Ecogene. O estudo foi conduzido com dados de locos microssatélites, demográficos, dendrométricos e ecológicos de uma população pequena e fragmentada de A. Angustifolia. Foram estudados diferentes cenários de corte seletivo, que representam combinações de diferentes diâmetro minimo de corte (DMC), intensidade de exploração (IE) e ciclo de corte (CC). Com base nos resultados, o corte seletivo mostrou dois principais efeitos sobre as populações: (a) redução no número total de indivíduos reprodutivos e da área basal (AB); (b) aumento na distância genética entre a população original e após os ciclos de corte e no número de genótipos unilocos. A população controle, sem exploração manteve seu tamanho estável em relação à população inicial durante todo períodos de simulações. O número médio de indivíduos (N) para o cenário controle após 122 anos foi de 515. Para DMC de 50 cm e IE de 20, 40 e 90%, após quatro ciclos de corte e ano do quinto corte, o N foi de 476 (-7,7%), 441 (-14,4%) e 415 (-19,5%), respectivamente. Para ... / Abstract: Araucaria angustifolia is a conifer, dioecious and wind pollinated tree economically important in the southeastern and southern Brazil. In the past century, the species was heavily exploited by the regime of clear-cutting, and today there are less than 3% of its original forests. Furthermore, recently, rose the chance to re-explore the remaining forests of A. angustifolia, using reduced impact logging (RIL) procurements. The Eco-gene model was used to investigate the long-term impacts of logging on the demography and genetic diversity of A. angustifolia populations and to determine what are the scenarios of selective logging that ensure sustainable production of wood and not drastically affect the genetic diversity of exploited populations. The study was conducted with data from microsatellite loci, demographic, ecological and dendrometric of a small fragmented population of A. angustifolia. In this research, different scenarios of selective cutting, which represent combinations of different minimum cutting diameter (MCD), intensity of exploitation (IE) and cutting cycle (CC) were studied. Based on the results, selective logging showed two main effects on the populations: (a) reduction in the total number of reproductive individuals (N), b) increase in genetic distance between the original population and after cycles court and the number of unilocus genotypes. The average number of individuals (N) for scenario control after 122 years was 515. For DMC of 50 cm and IE 20, 40 and 90%, after four cycles of cutting and the year of the fifth cutting, the N was 476 (-7.7%), 441 (-14.4%) and 415 (-19.5% ), respectively. For the DMC 75 cm, N was reduced for the three IE from 9.0 to 10.4% and for DMC and 100 cm, from 4.8 to 5.8%. Therefore, smaller IE, result in fewer individuals being explored and less difference compared to a situation without selective logging (control). For DMC of 50 cm and IE 20, 40 and 90%, ... / Doutor
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Divergência genética entre árvores matrizes de Ceiba speciosa St. Hil. para características de frutos e sementes /

Roveri Neto, Antonio. January 2014 (has links)
Orientador: Rinaldo César de Paula / Banca: Cibele Chalita Martins / Banca: Miguel Luiz Menezes Freitas / Resumo: A Ceiba speciosa St. Hil. (paineira-rosa) é uma espécie arbórea tropical pertencente à família Malvaceae, cuja árvore na idade adulta, pode superar os 20 metros de altura e 120 centímetros de diâmetro a altura do peito (DAP). Possui reprodução mista, com predominância de alogamia. Seus principais agentes polinizadores são aves, insetos e morcegos. Sua madeira pode ser empregada na indústria para confecção de canoas, cochos, móveis, aeromodelos, caixotaria e produção de pasta celulósica; a sua paina é bastante utilizada para o enchimento de almofadas, cobertores e travesseiros. A espécie apresenta grande importância na recuperação de ecossistemas degradados. O presente estudo objetivou avaliar a divergência genética entre árvores matrizes de Ceiba speciosa, a partir de caracteres de frutos e sementes. Para tanto foram coletados frutos e sementes de 36 árvores matrizes, determinando-se em cinco frutos por matriz o diâmetro, comprimento, massa de matéria fresca e seca e número de sementes/fruto e em 100 sementes (5 repetições de 20 unidades), o comprimento, diâmetro e peso de 100 sementes. Quatro repetições de 25 sementes por árvore matriz foram submetidas ao teste de germinação, conduzido a 27 ºC por 21 dias em substrato mata-borrão, avaliando-se a porcentagem de sementes com protrusão de radícula e o índice de velocidade de germinação. A qualidade fisiológica das sementes foi avaliada pelo teste de envelhecimento acelerado (EA), conduzido a 45 ºC por 72 horas, de condutividade elétrica conduzido com quatro repetições de 40 sementes embebidas em 75 mL de água desionisada a 25º C por 24 h e pelo teste de submersão, em que as mesmas sementes do teste de condutividade elétrica foram mantidas na mesma solução por 120 h. Após o teste de EA e de submersão, as sementes foram submetidas ao teste de germinação a 27 ºC durante 10 dias. Os dados foram submetidos à análise de variância e ... / Abstract: Ceiba speciosa St. Hil. is a tropical tree species of the Malvaceae family, which in adulthood, the tree may exceed 20 meters in height and 120 cm in diameter at breast height. Reproduction has mixed, predominantly outcrossing. Its main pollinators are birds, insects and bats. Its wood can be used in industry for making canoes, troughs, furniture, model airplanes, crates and production of pulp; their seed cotton is widely used for filling pillows, blankets and pillows. The species has great importance in the recovery of degraded ecosystems. The present study aimed to evaluate the genetic divergence among mother trees of Ceiba speciosa, from characters of fruits and seeds. Fruits and seeds of 36 mother trees of C. speciosa were collected, determining in five fruits per array diameter, length, fresh weight and dry weight and number of seeds per fruit and 100 seed (5 replicates of 20 units), the length, diameter and weight of 100 seeds. Also, four replicates of 25 seeds per mother tree were subjected to germination test, conducted at 27 º C for 21 days in substrate blotter, by assessing the percentage of seeds with radical protrusion and the germination speed index. The seed quality was evaluated by accelerated aging test conducted at 45 ° C for 72 hours, electrical conductivity conducted with four replications of 40 seeds soaked in 75 mL of deionized water at 25 ° C for 24 h by the submersion test in which the seeds of the same electrical conductivity test were kept in this solution for 120 h. After the EA and submersion test, seeds were subjected to germination test at 27 º C for 10 days. Data were subjected to analysis of variance and comparison of means by the Scott-Knott test, estimating also the genotypic determination coefficient, repeatability and correlation among traits. The genetic divergence among mother trees was obtained by the method of Ward and optimization Tocher, from the average Euclidean distance between pairs ... / Mestre
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Qualidade fisiológica de sementes de Senna multijuga de diferentes procedências do estado de São Paulo /

Flávio, João José Prieto. January 2014 (has links)
Orientador: Rinaldo Cesar de Paula / Banca: Sérgio Roberto Garcia dos Santos / Banca: Marina Crestana Guardia / Banca: Sergio Valiengo Valeri / Banca: Eduardo Custodio Gasparino / Resumo: Senna multijuga (Rich.) H. S. Irwin e Barneby vem sendo muito utilizada em reflorestamentos por apresentar grande potencial de adaptação em diferentes ambientes. O presente estudo teve como objetivo determinar a qualidade fisiológica de sementes de Senna multijuga provenientes de diferentes localidades do Estado de São Paulo por meio de testes de germinação e vigor. Nove lotes foram formados com sementes provenientes dos municípios de Promissão, Ribeirão Grande, Capão Bonito, Pradópolis, Altinópolis, Luiz Antônio, Batatais e Guatapará. O teste de germinação foi realizado a 25, 30, 35 e 25-35 ºC com sementes de cada lote escarificadas com ácido sulfúrico por 10, 15 e 20 minutos. O teste de envelhecimento acelerado foi conduzido com sementes de cada lote pelo método tradicional e com solução salina saturada de NaCl, por 96 horas a 45 ºC. Para o teste de condutividade elétrica, 30 e 60 sementes por lote foram embebidas em 75 mL de água a 25 ºC por 2, 4, 6, 12, 18 e 24 horas. O teste de lixiviação de K+ e Na+ foi realizado com 30 e 60 sementes por lote embebidas por 24 horas a 25 ºC. Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. Há pequenas diferenças de germinabilidade entre os lotes de sementes provenientes de diferentes localidades do Estado de São Paulo. O teste de germinação pode ser conduzido a 25 ºC com sementes escarificadas com ácido sulfúrico por 15 minutos. O teste de envelhecimento acelerado tradicional conduzido a 45 ºC por 96 horas é eficiente para promover alterações na capacidade germinativa das sementes. Os testes de envelhecimento acelerado com solução salina saturada de NaCl, conduzido a 45 ºC por 96 horas, de condutividade elétrica conduzido a 25 ºC com 30 e 60 sementes embebidas em 75 mL de água por períodos de 2, 4, 6, 12, 18 e 24 horas e de lixiviação de K+ e Na+ realizado com 30 e 60 sementes embebidas ... / Abstract: Senna multijuga (Rich.) H. S. Irwin and Barneby have been widely used for reforestation with great potential for adaptation in different environments. The present research aimed to evaluate the physiological quality of Senna multijuga seeds from different locations in São Paulo State through seed germination and vigor tests. Nine lots were formed with seeds from the cities of Promissão, Ribeirão Grande, Capão Bonito, Pradópolis, Altinópolis, Luiz Antônio, Batatais and Guatapará. The germination test was conducted at 25, 30, 35 and 25- 35 °C with seeds of each lot scarified with sulfuric acid for 10, 15 and 20 minutes. The accelerated aging test was conducted with seeds of each lot by the traditional method and saturated NaCl solution for 96 hours at 45 ºC. In the electrical conductivity test, 30 and 60 seeds of each lot were soaked in 75 mL of water at 25 °C for 2, 4, 6, 12, 18 and 24 hours. The leaching test of K+ and Na+ was conducted with 30 and 60 seeds of each lot soaked for 24 hours at 25° C. Data were subjected to variance analysis and means were compared by Tukey test at 5% probability. There are small differences between the germination of seeds from lots of different places of São Paulo State. The germination test can be carried out at 25 °C with scarified seeds with sulfuric acid for 15 minutes. The traditional accelerated aging test at 45 °C for 96 hours is effective in promoting changes in seeds germination. The accelerated aging test with saturated NaCl solution conducted at 45 °C for 96 hours, the electrical conductivity test carried out at 25 °C with 30 and 60 seeds soaked in 75 mL of water for periods of 2, 4, 6, 12, 18 and 24 hours and leaching test of K+ and Na+ performed with 30 and 60 seeds soaked in 75 mL of water for 24 hours at 25 °C are not effective to discriminate seed lots of the physiological quality / Doutor
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Época de semeadura e substrato na produção de mudas de Caesalpinia pulcherrima (L.) Sw. /

Santos, Águila Silva. January 2019 (has links)
Orientador: Kathia Fernandes Lopes Pivetta / Coorientador: Rinaldo César de Paula / Banca: Marcos Vieira Ferraz / Banca: Renata Gimenes / Resumo: Popularmente conhecida como flamboyant-mirim, flamboyanzinho e flor-do-paraíso, a espécie Caesalpinia pulcherrima (L.) Sw. é originária da América Central. Devido ao longo período de floração e à beleza de suas flores, esta espécie tem sido amplamente utilizada no paisagismo e também na arborização urbana. A germinação das sementes e o posterior desenvolvimento das mudas, são afetados por vários fatores como a época de semeadura e substrato. A época de semeadura interfere tanto na germinação das sementes quanto no desenvolvimento das mudas, produção e outras características agronômicas, em função da variação dos fatores do ambiente que reagem entre si e interagem com a planta. O substrato interfere diretamente na qualidade das plantas, devido à variação de suas propriedades físicas, químicas e biológicas, as quais podem afetar a germinação e o desenvolvimento das mudas. O objetivo do presente trabalho foi estudar o efeito da época de semeadura e de substratos comerciais na produção de mudas de Caesalpinia pulcherrima. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado. Os tratamentos foram arranjados em esquema fatorial 2 x 4 sendo duas épocas de condução (outono e primavera) e quatro substratos comerciais com diferentes composições: 1) Carolina Soil®; 2) Basaplant®; 3) Bioplant® e 4) Maxfértil®; foram cinco repetições e dez sementes por parcela. Os dados coletados foram submetidos à análise de variância e as médias, quando significativas, foram comparadas e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Popularly known as flamboyant-mirim, flamboyanzinho and paradise flower, the species Caesalpinia pulcherrima (L.) Sw. is native to Central America. Due to long flowering period and beauty of its flowers, this species has been widely used in landscaping and urban arborization. Seed germination and seedlings development are affected by many factors such as sowing time and substrate. The sowing season interferes both in seed germination and seedling development. Besides, production and other agronomic characteristics, as a function of variation of environmental factors that react with one another and interact with plant. The substrate directly interferes in quality of plants, due to variation of their physical, chemical and biological properties, which can affect germination and development of seedlings. The aim of this work was to study effect of sowing season and commercial substrates in production of Caesalpinia pulcherrima seedlings. The experimental design was completely randomized. The treatments were arranged in 2 x 4 factorial scheme, two conduction seasons (autumn and spring) and four commercial substrates with different compositions: 1) Carolina Soil®; 2) Basaplant®; 3) Bioplant® and 4) Maxfertil®; were five replicates and ten seeds per parcel. Data collected were submitted to analysis of variance and averages, when significant, were compared to each other by Tukey test at 5% of probability. Seedlings of Caesalpinia pulcherrima showed: a) high percentage of emergence independent of time in substrates Carolina Soil®, Basaplant® and Maxfertil®; b) faster development in spring than fall, but better seedlings in fall; c) more vigorous seedlings in Carolina Soil® (spring) and Maxfertil® (autumn) commercial substrates. / Mestre
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Severidade e controle da bacteriose foliar em mudas de Eucalyptus urophyla x Eucalyptus grandis em função do nível tecnológico do viveiro /

Faria, Júlia Maria Rodrigues de Carvalho, 1988- January 2013 (has links)
Orientador: Magali Ribeiro da Silva / Coorientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Carls Frederico Wilcken / Banca: Danilo Simões / Resumo: Atualmente um dos fatores que mais contribuem para perda da produtividade em mudas de Eucalyptus spp. são as doenças. Nos últimos anos tem se observado o aumento gradativo de doenças de origem bacteriana, principalmente de ocorrência foliar. A mancha foliar causada pelos gêneros Xanthomonas spp., e Pseudomonas spp., ocorrem em mudas de eucalipto em todas as fases de produção do viveiro e seus sintomas podem ser descritos na fase inicial por anasarca e, com o progresso as lesões, tornam-se necróticas e ressecadas. Na prática do dia a dia se observa que a severidade das doenças varia entre viveiros e uma das hipóteses é que este fator esteja relacionado com o nível tecnológico dos viveiros. Portanto, este estudo teve como objetivo avaliar a severidade da bacteriose foliar em dois viveiros comerciais de mudas clonais do híbrido de Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis e testar um novo manejo de controle da doença relacionando-a com o nível tecnológico de cada viveiro. Para definição e classificação do nível tecnológico de cada viveiro desenvolveu-se um questionário abrangendo questões a respeito de toda estrutura e manejo do viveiro. Esta classificação foi necessária para testar a hipótese de que há relação entre o padrão tecnológico do viveiro e o nível de severidade da bacteriose foliar nas mudas e a eficácia dos tratamentos aplicados. Os dois experimentos foram conduzidos da mesma forma nos dois viveiros, sendo cada viveiro correspondente a níveis diferentes de tecnologia, sendo alto e médio nível. Os experimentos foram realizados no período compreendido entre os meses de dezembro de 2011 a março de 2012 na região centro oeste do Estado de São Paulo. Foram aplicados nos tratamentos os produtos comerciais a base de acibenzolar-S-metil (ASM), Bion®, ativador de resistência em plantas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Nowadays the main factor that contributes Eucalyptus spp. seedlings loss are diseases. In the last years a slow increase of bacterial disease has been observed, especially that ones that occur on the lives. The spot on the lives caused by the genders Xanthomonas spp, e pseudomonas spp, occur in eucalyptus seedlings in all steps of nursery production, their symptoms can be described by "anasarca" in the initial phase and with the progress, the lesions become necrotic and dried up. In the daily practice it has been observed that the severity of diseases is variable from one nursery to the other and one of the hypothesis is that this factor is related to the nurseries technology level. Therefore, this study aims to available the severity of bacteriose foliar in two clone seedlings commercial nurseries of Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis hybrids and test a new management of disease control management relating it to the techonolgy level in each nursery. A questionnaire about the nursery's structure and management was developed in order to define and classify the technological level of each nursery. This classification was necessary for testing the hypothesis that there is a relationship among the nursery's technological level, the severity level of foliar bacterial disease in the seedlings and the applied treatment's efficiency. Two experiments were equally conducted in the two nurseries, which were of different technological levels: one high and the other medium. The experiments were conducted within December 2011 and March 2012 in the centerwest region of São Paulo State. For the treatments, the following commercial products were used : acibenzolar-S-metil (ASM), Bion® based; plants resistance activator in the doses 0,064; 0,126 e 0,26 g L-1 of... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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A data structure for spanning tree optimization problems / Uma estrutura de dados para problemas de otimização de árvores geradoras

Barbosa, Marco Aurélio Lopes 17 June 2019 (has links)
Spanning tree optimization problems are related to many practical applications. Several of these problems are NP-Hard, which limits the utility of exact methods and can require alternative approaches, like metaheuristics. A common issue for many metaheuristics is the data structure used to represent and manipulate the solutions. A data structure with efficient operations can expand the usefulness of a method by allowing larger instances to be solved in a reasonable amount of time. We propose the 2LETT data structure and uses it to represent spanning trees in two metaheuristics: mutation-based evolutionary algorithms and local search algorithms. The main operation of 2LETT is the exchange of one edge in the represented tree by another one, and it has O(√n) time, where n is the number of vertices in the tree. We conducent qualitative and quantitative evaluations for 2LETT and other structures in the literature. For the main operation of edge exchange in evolutionary algorithms, the computational experiments show that 2LETT has the best performance for trees with more than 10,000 vertices. For local search algorithms, 2LETT is the best option to deal with large trees with large diameters. / Os problemas de otimização de árvores geradoras estão relacionados a muitas aplicações práticas. Vários desses problemas são NP-difícies, o que limita a utilidade de métodos exatos e pode exigir abordagens alternativas, como metaheurísticas. Um questão relevante para muitas metaheurísticas é a estrutura de dados usada para representar e manipular as soluções. Uma estrutura de dados com operações eficientes pode aumentar a utilidade de um método, permitindo que instâncias maiores sejam resolvidas em um período de tempo razoável. Propomos a estrutura de dados 2LETT e a usamos para representar árvores geradoras em duas metaheurísticas: algoritmos evolutivos baseados em mutações e algoritmos de busca local. A operação principal da 2LETT é a troca de uma aresta na árvore representada por outra aresta. Esta operação tem tempo de O(√n), onde n é o número de vértices na árvore. Conduzimos avaliações qualitativas e quantitativas para 2LETT e outras estruturas na literatura. Para a principal operação de troca de arestas em algoritmos evolutivos, os experimentos computacionais mostram que a 2LETT possui o melhor desempenho para árvores com mais de 10.000 vértices. Para algoritmos de busca local, o 2LETT é a melhor opção para lidar com árvores grandes com grandes diâmetros.
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Empacotamento de árvores em grafos completos / Packing trees into complete graphs

Gómez Diaz, Renzo Gonzalo 28 August 2014 (has links)
Nesta dissertacao estudamos problemas de empacotamento de arvores em grafos, com enfase no caso de grafos completos. Denotamos por Ti uma arvore de ordem i. Dizemos que existe um empacotamento de arvores T1, . . . , Tn num grafo G se e possivel encontrar em G subgrafos H1, . . . , Hn, dois a dois disjuntos nas arestas, tais que Hi e isomorfo a Ti. Em 1976, A. Gyarfas e J. Lehel levantaram a seguinte questao, que conjecturaram ter uma resposta positiva: e possivel empaco- tar qualquer sequencia de arvores T1, . . . , Tn no Kn? Esta dissertacao tem como tema principal os estudos realizados por diversos pesquisadores na busca de uma resposta para esta pergunta, que permanece ainda em aberto. Tendo em vista a dificuldade para tratar esta questao, surge natural- mente a pergunta sobre a existencia de classes de arvores para as quais a resposta e afirmativa. Nessa linha, existem diversos resultados positivos, como por exemplo quando queremos empacotar estrelas e caminhos, ou estrelas e biestrelas. Por outro lado, em vez de restringir a classe das arvores, faz sentido restringir o tamanho da sequencia e reformular a pergunta. Por exemplo, dado s < n, e possivel empacotar qualquer sequencia de arvores T1, . . . , Ts no Kn? Em 1983, Bollobas mostrou ? que a resposta e afirmativa se s <= n / sqrt(2). Na primeira parte deste trabalho focamos nosso estudo em questoes desse tipo. Na segunda parte desta dissertacao investigamos algumas conjecturas que foram motivadas pela pergunta levantada por Gyarfas & Lehel. Por exemplo, Hobbs, Bourgeois e Kasiraj formularam a seguinte questao: para n par, e possivel empacotar qualquer sequencia de arvores T1, . . . , Tn no grafo bipartido Kn/2,n-1? Para essa pergunta apresentamos alguns resultados conhecidos analogos aos obtidos para a conjectura de Gyarfas & Lehel. Mais recentemente, Gerbner, Keszegh e Palmer estudaram a seguinte generalizacao da conjectura original: e possivel empacotar qualquer sequencia de arvores T1, . . . , Tk num grafo k-cromatico? Neste trabalho estudamos essas e outras questoes relacionadas e apresentamos os principais resultados que encontramos na literatura. / In this dissertation we address the problem of packing trees into graphs, with focus on complete graphs. We denote by Ti a tree of order i. We say that there exists a packing of trees T1,...,Tn in a graph G if its possible to find in G pairwise edge-disjoint subgraphs H1, . . . , Hn such that Hi is isomorphic to Ti. In 1976, A. Gyárfás and J. Lehel raised the following question, that they conjectured to have an affirmative answer: is it possible to pack any sequence of trees T1, . . . , Tn into the complete graph Kn? In this dissertation, we study a number of contributions made by various researchers in the search for an answer to this question, that is still open. In view of the difficulty of this question, it is natural to look for the existence of classes of trees for which the answer is affirmative. In this direction, some positive results have been found, as for example, when the sequences of trees are restricted to stars and paths, or stars and bistars. On the other hand, instead of restricting the classes of trees, it makes sense to restrict the length of the sequence and reformulate the question. For example, given s < n, is it possible to pack any sequence of trees T1, . . . , Ts into Kn? In 1983, Bollobás showed that the answer is affirmative if s <= n/sqrt(2). In the first part of this work, we focus on such kind of questions. In the second part of this dissertation we investigate some other conjectures that were motivated by the conjecture of Gyárfás & Lehel. For example, Hobbs, Bourgeois and Kasiraj formulated the following question: For n even, is it possible to pack any sequence of trees T1, . . . , Tn into the complete bipartite graph Kn/2,n-1? For this question, we present some known results analogous to those obtained for the conjecture of Gyárfás & Lehel. More recently, Gerbner, Keszegh and Palmer studied the following generalization of the of former conjecture: is it possible to pack any sequence of trees T1,...,Tk in a k-chromatic graph? In this dissertation, we study this and other related questions and present the main results we found in the literature.

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