FLI-1 est un facteur de transcription de la famille ETS dont le gène activé dans les érythroleucémies murines induites par le virus F-MuLV. Le gène fli-1 est également activé par le facteur SPI-1 / PU.1, un autre facteur ETS dont le gène est lui-même activé dans les érythroleucémies induites par le virus SFFV. Mon travail de thèse visait à définir la contribution de FLI-1 dans les érythroleucémies induites par SPI-1 / PU.1. Par déplétion inductible de FLI-1, j'ai montré qu'il contribue effectivement à la prolifération et au blocage de la différenciation de cellules érythroleucémiques surexprimant

Les facteurs de transcription FLI-1 et SPI-1/PU.1 appartiennent à la famille ETS et reconnaissent le même motif sur l'ADN GGAA. Leur activation est observée de manière récurrente dans les érythroleucémies murines induites par le virus de Friend. Ces observations suggèrent un rôle crucial de ces deux facteurs dans la transformation de la lignée érythrocytaire potentiellement par la dérégulation de gènes cibles communs. Mon travail de thèse a consisté à tester la contribution de ces deux facteurs au phénotype des cellules érythroleucémiques et à rechercher les gènes cibles directs communs.Nous avons pu montrer que FLI-1 et SPI-1/PU.1 ont des contributions additives au phénotype des cellules érythroleucémiques surexprimant les deux facteurs. Par une approche transcriptomique, nous avons identifié une grande proportion de gènes cibles directs communs à FLI-1 et à SPI-1/PU.1 impliqués dans différentes étapes de la biogenèse des ribosomes. La déplétion de ces facteurs induit une réduction de la biogenèse des ribosomes qui n'induit pas de stress ribosomique stabilisant p53. Néanmoins, nous avons mis en évidence une contribution spécifique de RPL11, un médiateur essentiel du stress ribosomique, à la différenciation des cellules érythroleucémiques induites par l'absence de ces facteurs.Nous avons mené en parallèle l'inventaire par ChIP-Seq des sites de recrutement de FLI-1 et de SPI-1/PU.1 sur le génome entier de 3 lignées érythroleucémiques indépendantes. Cette stratégie nous a permis de montrer que les régions de recrutement communes sont la conséquence de la proximité de consensus spécifiques et distincts et du recrutement de FLI-1 et de SPI-1/PU.1 sur leur propre consensus.

Les facteurs de transcription FLI-1 et SPI-1/PU.1 appartiennent à la famille ETS et reconnaissent le même motif sur l’ADN GGAA. Leur activation est observée de manière récurrente dans les érythroleucémies murines induites par le virus de Friend. Ces observations suggèrent un rôle crucial de ces deux facteurs dans la transformation de la lignée érythrocytaire potentiellement par la dérégulation de gènes cibles communs. Mon travail de thèse a consisté à tester la contribution de ces deux facteurs au phénotype des cellules érythroleucémiques et à rechercher les gènes cibles directs communs.Nous avons pu montrer que FLI-1 et SPI-1/PU.1 ont des contributions additives au phénotype des cellules érythroleucémiques surexprimant les deux facteurs. Par une approche transcriptomique, nous avons identifié une grande proportion de gènes cibles directs communs à FLI-1 et à SPI-1/PU.1 impliqués dans différentes étapes de la biogenèse des ribosomes. La déplétion de ces facteurs induit une réduction de la biogenèse des ribosomes qui n’induit pas de stress ribosomique stabilisant p53. Néanmoins, nous avons mis en évidence une contribution spécifique de RPL11, un médiateur essentiel du stress ribosomique, à la différenciation des cellules érythroleucémiques induites par l’absence de ces facteurs.Nous avons mené en parallèle l’inventaire par ChIP-Seq des sites de recrutement de FLI-1 et de SPI-1/PU.1 sur le génome entier de 3 lignées érythroleucémiques indépendantes. Cette stratégie nous a permis de montrer que les régions de recrutement communes sont la conséquence de la proximité de consensus spécifiques et distincts et du recrutement de FLI-1 et de SPI-1/PU.1 sur leur propre consensus. / The transcription factors FLI-1 and SPI-1/PU.1 belong to the ETS family and recognize the same DNA motif GGAA. Their activation is recurrently observed in murine erythroleukemia induced by Friend virus. These observations suggest a crucial role of these two factors in erythroid lineage transformation potentielly by deregulating common target genes. My thesis work consisted of testing both factors contribution to the phenotype of erythroleukemia cells and of searching for common direct target genes.We showed that FLI-1 and SPI-1/PU.1 have additive contributions to the phenotype of erythroleukemia cells overexpressing both factors. By a transcriptomic approach, we identified a high proportion of common direct target genes of FLI-1 and SPI-1/PU.1 involved in ribosome biogenesis at different levels. The déplétion of these factors induced a decrease of ribosome number which doesn’t induce a ribosomal stress leading to the p53 stabilization. However, we highlighted a specific contribution of RPL11, an essential ribosomal stress médiator, in erythroleukemia cell differentiation induced by depletion of both factors. In parallel, we mapped at whole génome scale by ChIP-Seq the recruitment site of FLI-1 and SPI-1/PU.1 in 3 independent erythroleukemia cell lines. This strategy allowed us to show that the common recruitment régions are the conséquence of a very close association of clearly distinct and specific consensus binding sites for FLI-1 and SPI-1/PU.1 and that each of those factor sis recruited to its own consensus.

Les stratégies actuelles de lutte contre le cancer consistent à développer de nouveaux traitements à base de molécules d’origine naturelle susceptibles de déclencher l’apoptose de cellules malignes et d’inhiber les principales voies de survie cellulaire. Le premier objectif de ces travaux porte sur les effets anti-prolifératifs et apoptotiques de l’extrait éthanolique de la plante Berberis libanotica sur les lignées érythroleucémiques humaines HEL, K562 et K562 (COX-2+) et sur son effet sur l’expression de la COX-2 dans ces lignées. Nos résultats montrent que l’extrait induit l’apoptose dans les lignées étudiées et ceci par activation de la caspase-3, le clivage de la PARP-1 et la fragmentation de l’ADN. De même, il induit la diminution de l’expression de COX-2. Nous avons démontré que les voies survie de NF-ĸB et p-AKT sont inhibées. Le deuxième objectif de ces travaux consistent à identifier la molécule présente dans cet extrait et qui est capable de déclencher ces effets anticancéreux. Nous avons démontré que la berbérine est la molécule majoritaire dans cet extrait et possède des effets apoptotiques et des effets inhibiteurs des voies de survie, ce qui est similaire aux effets de l’extrait brut.Mots clés :érythroleucémie, apoptose, berberis libanotica, berbérine, COX-2, NF-kB, p-AKT. / The first aim of this study focuses on the apoptotic effect of Berberis Libanotica on human erythroleukemia cell lines HEL, K562, and K562(COX-2+) and it is effect on the expression of COX-2. In light of the reported chemopreventive and chemosensitive effects of natural products on various tumor cells and animal models, we postulated that our Bl extract may mediate their effects through apoptosis induction with suppression of cell survival pathways. We showed that this extract induces apoptosis in eryrhtroleukemia cells by activation of the late markers of caspase-3 activation, PARP cleavage and DNA fragmentation. In the other hand, we showed that Bl extract reduced significantly expression of COX-2 by a dose-dependent manner. In regard to our results, it is clear that the simultaneous inhibition of Akt and NF-κB signalling can significantly contribute to the anticancer effects of Bl extract in human erythroleukemia cells.The second objective of this report is to elucidate wich molecule present in our extract can exert this effects. We found that berberine, the majoritory compound, can induce an apoptotic effect and inhibits the survival pathway of NF-ĸB and p-AKT similarly to the extract.Key words: erythroleukemia, apoptosis, Berberis libanotica ,berberine, COX-2, NF-ĸB, p-AKT