Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η εκτίμηση των περιβαλλοντικών και υδρογεωλογικών συνθηκών της ευρύτερης περιοχής του Μεσολογγίου, η εκτίμηση της ποιότητας νερών και πηλών στης περιοχές ενδιαφέροντος όσον αφορά τους ιαματικούς φυσικούς πόρους της περιοχής και τέλος η διερεύνηση των πιθανών πηγών ρύπανσης της περιοχής και ειδικότερα των παραπάνω θέσεων ενδιαφέροντος. Από τα αποτελέσματα της παρούσας εργασίας προκύπτει ότι τα υπόγεια νερά της περιοχής παρουσιάζουν αυξημένη αλατότητα όπως αυτό ερμηνεύεται από τις πολύ υψηλές τιμές της ηλεκτρικής αγωγιμότητας που παρουσιάζουν. Λόγω του ασήμαντου ρυπαντικού τους φορτίου δεν καθιστούν πηγή ρύπανσης των θέσεων ενδιαφέροντος. Από της άλλη μεριά τα νερά και οι πηλοί που συλλέχθησαν από ρέματα της περιοχής που καταλήγουν στην λιμνοθάλασσα, παρουσίασαν αυξημένες τιμές βαρέων μετάλλων που οφείλονται κατά κύριο λόγο στις ανθρωπογενείες δραστηριότητες της περιοχής, ενδέχεται να επιβαρύνουν τους πηλούς κυρίως σε βαρέα μέταλλα. Το μεγαλύτερο μέρος της συγκέντρωσης των βαρέων μετάλλων που ανιχνεύτηκε στους πηλούς της περιοχής δεν συνιστά πηγή δευτερογενούς ρύπανσης. Από τα αποτελέσματα της μεθόδου διαδοχικής εκχύλισης BCR-SEP φάνηκε ότι το μεγαλύτερο μέρος των βαρέων μετάλλων είναι ισχυρά συνδεδεμένο με το ίζημα (συνδεδεμένα με το κρυσταλλικό πλέγμα των ορυκτών των ιζημάτων) και ένα μικρό μέρος μπορεί να διαφύγει και να προκαλέσει ρύπανση της υδάτινης στήλης. Οι πηγές ρύπανσης των θέσεων ενδιαφέροντος είναι ο Βιολογικός Καθαρισμός του Δήμου Μεσολογγίου, οι ανεξέλεγκτες χωματερές που γειτνιάζουν με την λιμνοθάλασσα, η πόλη του Μεσολογγίου (κυρίως στο βόρειο τμήμα της Δυτικής Κλεισοβας) και τέλος οι διάφορες ανθρωπογενείς δραστηριότητες της περιοχής απόβλητα των οποίων ρίχνονται στα ρέματα και μέσω αυτών καταλήγουν στην λιμνοθάλασσα. / The aim of this thesis was the assessment of environmental and hydro geologic conditions of Mesolonghi’s area, the assessment of the quality of water and sediments in the areas in question regarding their medicinal natural resources and finally the estimation of possible sources of pollution. According the results of that thesis all groundwater samples present an increased salinity (increased rates of Electrical conductivity). Due to their of no importance pollution load it is believed that groundwater do not affect areas in question. On the contrary the surface samples of water and sediments collected from flumes shows that this water which ends up in Kleisova lagoon may affect the areas mostly with heavy metals. Great part of heavy metals concentration found in sediments does not threaten areas as ectypal source of pollution. Results from sequential extraction procedure showed that heavy metals are being highly associated with minerals crystalline lattice of sediments. Sources of pollution at areas in question are the wastewater treatment plant of Mesolonghi’s Municipality, many incontrollable refuse dumps which are neighboring on Kleisova lagoon, the Mesolonghi’s city and finally the surface water of flumes which ends up in lagoon and carries an high amount of heavy metals.