Spelling suggestions: "subject:"νοημοσύνης""
1 |
Περί τυπικών προδιαγραφών ευφυών αυτόνομων διαμεσολαβητώνΖαχαράκης, Ιωάννης 14 September 2009 (has links)
- / -
|
2 |
Αναβάθμιση δυναμικού ιστότοπου διαγνωστικού κέντρου με χρήση κατάλληλων εφαρμογών λογισμικού και κανόνων τεχνητής νοημοσύνηςΚίτρου, Κωνσταντίνος 27 May 2014 (has links)
Αναβάθμιση ενός ήδη υπάρχοντος διαδικτυακού τόπου διαγνωστικού κέντρου, ώστε να περιλαμβάνει εργαλεία και επιλογές για τον επισκέπτη, που θα καταστήσουν την ιστοσελίδα, όχι απλά ενημερωτική - στατική σελίδα, αλλά έναν διαδικτυακό τόπο που θα προσεγγίζει τον τομέα της υγείας και της λειτουργίας ενός ιατρικού διαγνωστικού κέντρου από πολλές σκοπιές. / It describes the update of an existing website of a diagnostic center, in a what that it can provide interactive tools for the patient who visits it, such as artificial intelligence software
|
3 |
Μοντελοποίηση θεμελιώδους σχεδιασμού βασισμένη στην τεχνητή νοημοσύνη-Εφαρμογή στο μηχανοτρονικό σχεδιασμόΜουλιανίτης, Βασίλης Χ. 25 June 2007 (has links)
Ο σχεδιασμός, ως ανθρώπινη ενασχόληση για πολλούς αιώνες, στηρίχθηκε κυρίως στην εμπειρία και στο ταλέντο. Μετά τα μέσα του 20ου αιώνα, αναπτύχθηκαν επιστημονικές προσπάθειες ώστε ο σχεδιασμός να αποτελέσει αυτόνομο επιστημονικό πεδίο. Από τότε αναπτύχθηκαν αρκετές φιλοσοφίες, μοντέλα, μέθοδοι και τεχνικές για το σχεδιασμό. Επειδή ο σχεδιασμός είναι μια νοητική εργασία με ειδικά χαρακτηριστικά για κάθε άτομο ή ομάδα, η συστηματική του οργάνωση είναι πολύ δύσκολη. Η θεωρητική θεμελίωση του σχεδιασμού είναι ακόμη δυσκολότερη και μέχρι τώρα έχουν εμφανιστεί λίγες απόπειρες για την ανάπτυξη μιας γενικευμένης θεωρίας συστηματικού σχεδιασμού, η οποία βρίσκεται σε προεπιστημονικό στάδιο, ενώ έχει αναπτυχθεί πλούσια γνώση που αναφέρεται σε μεθοδολογίες σχεδιασμού καθώς και εφαρμογές. Στη διατριβή αυτή εισάγεται ένα μαθηματικό μοντέλο που συνεισφέρει στη συστηματικοποίηση του θεμελιώδους σχεδιασμού. Ερμηνεύονται με μαθηματικό τρόπο οι γενικές διαδικασίες παραγωγής και αξιολόγησης των λύσεων στο θεμελιώδη σχεδιασμό, και μοντελοποιούνται τα αντικείμενα και οι κανόνες χρησιμοποιώντας ασαφή ή δίτιμη ή πολύτιμη λογική ανάλογα με το πόσο καλά καθορισμένο είναι το πρόβλημα που πρέπει να επιλυθεί. Στη διατριβή αναπτύχθηκε ένα μαθηματικό μοντέλο για τη διαδικασία παραγωγής λύσεων στο θεμελιώδη σχεδιασμό. Αναπτύχθηκε ένας μηχανισμός για την αυτόματη παραγωγή βαθμών ικανοποίησης των εφικτών λύσεων ως προς τις σχεδιαστικές προδιαγραφές και των σχεδιαστικών περιορισμών. Το σύνολο των υποψηφίων τελικών λύσεων παράγεται από ένα πίνακα που περιέχει τους βαθμούς αυτούς. Η παραγωγή του συνόλου των τελικών λύσεων που είναι ένα υποσύνολο του συνόλου των υποψηφίων τελικών λύσεων πραγματοποιείται χρησιμοποιώντας το Ευκλείδειο μέτρο. Επειδή, λόγω συνδυαστικής έκρηξης, η αναζήτηση των λύσεων μερικές φορές είναι χρονοβόρα, αναπτύχθηκαν δύο ευρετικές μέθοδοι οι οποίες στηρίζονται σε στοιχεία διανυσματικής ανάλυσης για να επιταχυνθεί αυτή η διαδικασία. Εισάγεται επίσης ένα γενικευμένο πλαίσιο κατασκευής δεικτών για την αξιολόγηση των θεμελιωδών λύσεων. Για την κατασκευή των δεικτών χρησιμοποιούνται τελεστές της ασαφούς λογικής και πιο συγκεκριμένα οι T-norms και οι τελεστές μέσου όρου. Αναπτύχθηκαν επίσης οδηγίες για την επιλογή της κλάσης των τελεστών αλλά και για τους τελεστές αυτούς καθαυτούς. Ο σχεδιαστής μπορεί να κατασκευάσει δείκτες αξιολόγησης με τους οποίους μπορεί να αξιολογήσει και να επιλέξει θεμελιώδεις λύσεις με βάση ειδικά χαρακτηριστικά, όπως είναι η μηχανοτρονικότητα κ. άλ. που θέλει να κατέχει το τελικό προϊόν. Επίσης, εισήχθηκε ο “Μηχανοτρονικός Δείκτης” με τον οποίο ο σχεδιαστής μπορεί να επιλέξει τις πιο ευέλικτες, ευφυείς και με τη μικρότερη πολυπλοκότητα λύσεις. Η διαμόρφωση του δείκτη στηρίχθηκε στα τρία αυτά χαρακτηριστικά που κατέχουν τα μηχανοτρονικά προϊόντα. Αναπτύχθηκε ένα σύστημα βασισμένο σ’ αυτή τη γνώση για το μηχανοτρονικό σχεδιασμό ρομποτικών αρπάγων για το χειρισμό εύκαμπτων υλικών. Η απαραίτητη για τον σκοπό αυτό γνώση προήλθε από την σχετική βιβλιογραφία και από τους ειδικούς (experts) και κατόπιν οργανώθηκε κατάλληλα. Το σύστημα αυτό αποτελεί το πρώτο που εμφανίζεται στη βιβλιογραφία για το χειρισμό εύκαμπτων υλικών, και το πρώτο που υλοποιεί το θεμελιώδη σχεδιασμό αρπαγών. Στο σύστημα αυτό δοκιμάστηκαν και μελετήθηκαν οι παραπάνω μέθοδοι παραγωγής και αξιολόγησης λύσεων. Οι μέθοδοι που αναπτύσσονται στην παρούσα διατριβή μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την πραγματοποίηση του μηχανοτρονικού θεμελιώδους σχεδιασμού ή για την ανάπτυξη νέων πιο αποτελεσματικών συστημάτων βασισμένων σε γνώση για το μηχανοτρονικό θεμελιώδη σχεδιασμό. / Ιt was only by the middle of the 20th century when design – an intense human activity –
became the focus point of scientists towards the direction of its formalization and
“scientification”. Since then, design philosophies, models, methods and techniques have been
developed. The systematic formulation of design is very difficult since it is a perceptive
process with special characteristics for every person or team. The theoretical foundation of
design is more difficult and until now there have been made relatively few attempts for
developing a generalized theory of systematic design. This theory is still in pre-scientific
phase, while there is rich knowledge on design methodologies in specific applications.
In this thesis, a mathematical model towards systemizing the conceptual design phase is
introduced. A mathematical interpretation of the general concept generation and evaluation
processes is analyzed. The design entities and rules governing a design problem are
represented using fuzzy, Boolean and many-valued logic depending on how well-defined is
the knowledge of the field that the model is applied to.
A mechanism for the automatic generation of the degrees of satisfaction of the design
specifications by the feasible solutions subjected to the design constraints is also proposed.
From a matrix that contains these degrees, the set of all possible combined solutions is
generated. The generation of the set of final solutions, that is a subset of the set of the
combined solutions, is based on a suitable partition of the Euclidean space. In order to avoid
the combinatorial explosion that occurs during design space search, two heuristic search
methods have been developed based on vector analysis.
A frame for introducing design indices for the evaluation of alternative solutions is also
proposed. The formulation of the design indices is based on fuzzy logic and more specific on
T-norms and averaging operators. The guidelines for the selection of the class of operators
and then for the operator itself are also given. Using this frame, the designer can form
evaluation indices based on special characteristics that the product must inherit.
Furthermore, the “Mechatronics Index” is introduced. Using this index, the designer can
select the most intelligent and flexible alternative solutions that have the minimum
complexity. The formulation of the index is based on these three common characteristics of
the mechatronics products.
Finally, the knowledge for the design of grippers for handling non-rigid materials is acquired
from experts and literature and organized in a knowledge-based system. This system is the
first to appear in the international literature for the conceptual design of grippers for handling
non-rigid materials. In this system the above methods for the concept generation and
evaluation has been tested and studied.
The present thesis proposes a methodology that of it can be used for the realization of the
conceptual mechatronics design or for the development of new intelligent knowledge-based
systems for the conceptual mechatronics design of products.
|
4 |
Νέοι Memetic αλγόριθμοι με εφαρμογές στη βιοπληροφορικήΠεταλάς, Γιάννης 20 September 2010 (has links)
- / -
|
5 |
Τεχνικές εξαγωγής συμπερασμάτων στην επιχειρηματική νοημοσύνηΤασουλής, Δημήτρης 20 September 2010 (has links)
- / -
|
6 |
Δημιουργία πράκτορα τεχνητής νοημοσύνης για παιχνίδι στρατηγικήςΓουργιώτης, Γιώργος 25 January 2012 (has links)
Στην παρούσα διπλωματική εργασία παρουσιάζεται η δημιουργία ενός πράκτορα Τεχνητής Νοημοσύνης (AI agent) που μπορεί να παίζει το απλό παιχνίδι στρατηγικής Ναυμαχία εναντίον ενός ανθρώπου-παίχτη. Η εργασία συμπεριλαμβάνει την ανάπτυξη δομών για την αναπαράσταση της κατάστασης του παιχνιδιού ενός γύρου (μιας παρτίδας), το game engine που προωθεί το παιχνίδι σε κάθε γύρο, το API μεταξύ AI και μηχανής και έναν AI παίχτη. Αρχικά δημιουργείται ο χάρτης πάνω στον οποίο θα παιχτεί το παιχνίδι. Ο χάρτης περιλαμβάνει σημεία θάλασσας όπου θα γίνει η τοποθέτηση των πλοίων αλλά και νησιά. Στη συνέχεια ο διαιτητής, ο οποίος έχει στη γνώση του τους κανόνες, συντονίζει το παιχνίδι. Ο πράκτορας έχει επιλεγεί ώστε να έχει αρκετά επίπεδα ευφυΐας στο παιχνίδι του. Τέλος παρουσιάζεται ενδεικτικά μια αναπαράσταση μεταξύ δύο πρακτόρων που παίζουν αντίπαλοι ώστε να φανεί η ορθή λειτουργία τους. Ο κώδικας είναι γραμμένος στην γλώσσα αντικειμενοστραφούς προγραμματισμού JAVA, με την οποία εύκολα έγινε η αναπαράσταση της αλληλεπίδρασης μεταξύ των αντικειμένων του συστήματός μας. / This diploma dissertation presents the creation of an Artificial Intelligence agent who can play the simple strategy game Battleship against a human player. The dissertation includes a development of structures for the representation of the state of one round of the game, the game engine which promotes the game in each round, the API (application-programming-interface) between AI agent and computer and an AI player. At first the map in which the game will be played, is created. The map includes points of sea in which the boats and the islands will be placed. Afterwards the referee, who has in his knowledge the rules, coordinates the game. The agent has been selected so that he has enough levels of intelligence in his game. Finally is presented indicatively a representation between two agents who play against each other so as to show their correct operation. The code was written in object-oriented programming language JAVA, with which easily programmed the representation of interaction between the objects of our system.
|
7 |
Εξαγωγή δικτύων αλληλεπιδράσεων για την εξομοίωση βιολογικών διεργασιών σε χαμηλό και υψηλό επίπεδο μέσω ευφυών αλγορίθμων / Inference of Interaction Networks for High and Low Level Simulation of Biological Processes using Intelligent AlgorithmsΔημητρακόπουλος, Χρήστος 09 December 2013 (has links)
Η μελέτη των βιολογικών συστημάτων στα διαφορετικά επίπεδα οργάνωσης του κυττάρου είναι ένας τομέας που αναδύεται ταχύτατα στην περιοχή της υπολογιστικής βιολογίας. Η πλειοψηφία των ερευνών σε αυτό τον τομέα έχει επικεντρωθεί στον διαχωρισμό των γονιδίων σε βιολογικά μονοπάτια ή διεργασίες. Το επόμενο βήμα στην κατανόηση του κυττάρου στο συστημικό του επίπεδο είναι ο καθορισμός του τρόπου με τον οποίο οι συγκεκριμένες κυτταρικές διεργασίες λειτουργούν μαζί για να επιτελέσουν τις κυτταρικές λειτουργίες.
Βασικός σκοπός της παρούσας διπλωματικής εργασίας είναι η πρόβλεψη αλληλεπιδράσεων διαφόρων ειδών οι οποίες λαμβάνουν μέρος στα διαφορετικά επίπεδα του κυττάρου καθώς και η διερεύνηση του τρόπου με τον οποίο αυτές οι αλληλεπιδράσεις συνεργάζονται μεταξύ τους έτσι ώστε να επιτελέσουν τις κυτταρικές λειτουργίες. Στο χαμηλότερο επίπεδο του κυττάρου υπάρχουν οι φυσικές αλληλεπιδράσεις οι οποίες ισοδυναμούν με σύνδεση των πρωτεϊνών (ή μιας πρωτεΐνης και ενός DNA μορίου) στον 3-διάστατο χώρο. Η σύνδεση αυτή μπορεί να έχει διάφορα αποτελέσματα, όπως η μεταφορά ενός βιοσήματος ή η δημιουργία ενός νέου βιομορίου. Σε ένα ανώτερο επίπεδο από τις φυσικές αλληλεπιδράσεις, πραγματοποιούνται οι λειτουργικές αλληλεπιδράσεις οι οποίες μπορούν σε γενικές γραμμές να κατηγοριοποιηθούν σε σειριακές λειτουργικές αλληλεπιδράσεις (δίκτυα ρυθμιστικών αλληλεπιδράσεων), παράλληλες λειτουργικές αλληλεπιδράσεις όπως για παράδειγμα η συνθετική θνησιμότητα (γενετικές αλληλεπιδράσεις) και συνεργατικές λειτουργικές αλληλεπιδράσεις, όπως για παράδειγμα τα πρωτεϊνικά σύμπλοκα. Οι βιολογικές διεργασίες οι οποίες δραστηριοποιούνται στο ανώτατο επίπεδο του κυττάρου είναι στην πραγματικότητα ομάδες πρωτεϊνών και γονιδίων τα οποία λειτουργούν συνεργατικά. Οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ των βιολογικών διεργασιών είναι οι υψηλότερου κυτταρικού επιπέδου αλληλεπιδράσεις τις οποίες θα μπορούσαμε να ανιχνεύσουμε. Η ανίχνευση των παραπάνω διαφορετικών ειδών αλληλεπιδράσεων καθώς και η εννοιολογική σύνδεσή τους αποτελεί το αντικείμενο μελέτης της παρούσας διπλωματικής εργασίας.
Η αναγκαία πληροφορία για να οδηγηθούμε στην πρόβλεψη αλληλεπιδράσεων του ανώτερου επιπέδου του κυττάρου είναι οι χαμηλού επιπέδου (physical) πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις. Πολλές υπολογιστικές μέθοδοι έχουν εφαρμοστεί μέχρι στιγμής στο πρόβλημα της πρόβλεψης πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων, οι οποίες όμως αποτυγχάνουν στην ταυτόχρονη επίτευξη καλής απόδοσης και ερμηνευσιμότητας. Στα πλαίσια της διπλωματικής εργασίας αναλύεται το πρόβλημα της πρόβλεψης πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων. Περιγράφονται οι πιο πρόσφατες πειραματικές και υπολογιστικές μέθοδοι για την ανίχνευση τους. Αναλύονται οι διαφορές τους, τα πλεονεκτήματα και τα μειονεκτήματά τους και επιπλέον γίνεται μία προσπάθεια καταγραφής των στοιχείων που τις περιορίζουν και προτείνονται τρόποι για την μελλοντική εξέλιξη και βελτίωσή τους.
Στην συνέχεια μελετάται ο τρόπος με τον οποίο η τοπολογία των δικτύων πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων επηρεάζει τις λειτουργικές αλληλεπιδράσεις που εμφανίζονται στο εσωτερικό του κυττάρου, όπως για παράδειγμα τις ρυθμιστικές (regulatory) και τις επιστατικές (genetic) αλληλεπιδράσεις. Δημιουργείται ένα σταθμισμένο δίκτυο το οποίο περιέχει πληροφορία για τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ των πρωτεϊνών στο φυσικό επίπεδο (physical interactions). Η εκμετάλλευση της τοπολογίας του δικτύου φυσικών αλληλεπιδράσεων γίνεται μέσω τεχνικών διάχυσης πυρήνων (kernel diffusion). Τροποποιώντας τον βαθμό της διάχυσης (degree of diffusion), δημιουργούνται τα προφιλ διάχυσης (diffusion profiles). Στην συνέχεια, αυτά τα προφίλ χρησιμοποιούνται προκειμένου να χαρακτηρίσουν τις τοπολογίες που συνδέουν τις πρωτεΐνες πάνω στο δίκτυο φυσικών αλληλεπιδράσεων. Επίσης τα προφίλ διάχυσης, αποδεικνύονται εξαιρετικά χρήσιμα εργαλεία στην βελτίωση της απόδοσης των αλγορίθμων πρόβλεψης λειτουργικών αλληλεπιδράσεων.
Στην συνέχεια οι πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις χρησιμοποιούνται εκ νέου προκειμένου να προβλεφθούν εξαρτήσεις σε ένα επίπεδο υψηλότερα των λειτουργικών αλληλεπιδράσεων και συγκεκριμένα μεταξύ βιολογικών διεργασιών όπως αυτές περιγράφονται στην βάση δεδομένων Gene Ontology. Η κλασσική προσέγγιση στην μελέτη πολύπλοκων βιολογικών δικτύων βασίζεται στην ταυτοποίηση αλληλεπιδράσεων μεταξύ εσωτερικών συστατικών μεταβολικών ή σηματιδικών μονοπατιών. Επιπλέον, γνωρίζουμε σήμερα πολύ λίγα πράγματα για τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ βιολογικών συστημάτων ανώτερης τάξης, όπως είναι τα βιολογικά μονοπάτια και οι βιολογικές διεργασίες. Στα πλαίσια της διπλωματικής εργασίας προτείνεται μια μεθοδολογία για την εύρεση αλληλεπιδράσεων μεταξύ βιολογικών διεργασιών αναλύοντας σταθμισμένες και μη σταθμισμένες πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις. Βασική απόρροια της διπλωματικής εργασίας είναι οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ βιολογικών διεργασιών που προέκυψαν και μέσω των οποίων δημιουργείται ένα νεο είδος δικτύου, το δίκτυο αλληλεπιδράσεων μεταξύ βιολογικών διεργασιών.
Διάφορες βάσεις δεδομένων έχουν σχεδιαστεί για την αποθήκευση πληροφορίας σχετικής με τις πειραματικά και υπολογιστικά ταυτοποιημένες ανθρώπινες πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις. Ωστόσο, αυτές οι βάσεις δεδομένων περιέχουν πολλές λανθασμένα θετικές αλληλεπιδράσεις, έχουν χαμηλή κάλυψη και μόνο λίγες από αυτές ενσωματώνουν πληροφορία από διάφορες πηγές. Για την αποφυγή των παραπάνω προβλημάτων, έχει σχεδιαστεί η βάση δεδομένων ΗΙΝΤ-ΚΒ (http://150.140.142.24:84) η οποία είναι μία βάση γνώσης που ενσωματώνει δεδομένα από διάφορες πηγές, παρέχει ένα φιλικό περιβάλλον προς τον χρήστη για την ανάκτησή τους, υπολογίζει ένα σύνολο χαρακτηριστικών και ένα σκορ εμπιστοσύνης για κάθε πιθανή πρωτεϊνική αλληλεπίδραση. Το σκορ εμπιστοσύνης είναι βασικό για το φιλτράρισμα των λανθασμένα θετικών αλληλεπιδράσεων οι οποίες είναι παρούσες σε διάφορες υπάρχουσες βάσεις δεδομένων. Για το σκοπό αυτό δημιουργήθηκε μία νέα υβριδική μεθοδολογία μηχανικής μάθησης, η οποία ονομάζεται Μαθηματική Μοντελοποίηση Εξελικτικού Κάλμαν (ΜΜΕΚ) για την επίτευξη μιας ακριβούς και ερμηνεύσιμης διαδικασίας ανάθεσης βαρών στις πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις. Τα πειραματικά αποτελέσματα καταδεικνύουν ότι η συγκεκριμένη μέθοδος υπερτερεί σε σχέση με τις πιο γνωστές μεθόδους πρόβλεψης πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων.
Τα αποτελέσματα της διπλωματικής εργασίας φιλοδοξείται να συμβάλλουν στην πρόβλεψη νέων πιθανών αλληλεπιδράσεων του χαμηλού και του υψηλού κυτταρικού επιπέδου του ανθρώπινου οργανισμού και του οργανισμού του Ζακχαρομήκυτα (S. cerevisiae). Επιπλέον, μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την κατανόηση των ανώτερων επιπέδων οργάνωσης του κυττάρου σαν ένα ενιαίο σύστημα. Τέλος, μία ακόμη σημαντική απόρροια που προκύπτει από την ανάλυση που παρέχεται από την διπλωματική εργασία είναι η ανάγκη επανεξέτασης της state-of-the-art προσεγγίσης της βάσης δεδομένων Gene Ontology για την οργάνωση της βιολογικής γνώσης. / The study of biological systems at different levels of organization is a rapidly emerging area of computational biology. The majority of research in this field has focused on partitioning genes into biological pathways or processes. The next hurdle in moving towards the goal of understanding the cell at a systems level is to determine how these partitioned cellular processes work together to achieve the cell’s objectives.
The main goal of the thesis is the prediction of various kinds of interactions that take place in the different levels of the cell and the examination of the way that these interactions cooperate in order to fullfill the cell functions. At the lower level of the cell the physical interactions exist which entail the full range of chemical bonds between proteins DNA molecules. In addition to these physical descriptions, also functional descriptions of the cellular system can be determined. These can be broadly categorized into 1) serial function interactions, such as the regulatory network interactions, 2) parallel function interactions, such as epistatic interactions (e.g. synthetic lethality) and 3) collaborative function interactions, such as protein complexes. The biological processes which exist at the highest level of the cell are groups of proteins and genes that function collaboratively. The interactions between biological processes are the highest cellular level interactions that we can detect. The detection of the aforementioned different kinds of cellular interactions as well as their conceptual linkage is the subject that the current thesis focus on.
The necessary information that leads to the prediction of interactions at the higher level of the cell is the lower level physical protein interactions. Many computational methods have been implemented so far to the problem of predicting protein interactions, without achieving at the same time high performance and interpretability. At the framework of the current thesis the problem of PPI prediction is analyzed. The most contemporary experimental and computational methods for detecting PPIs are described. We will analyze their differences, advantages, disadvantages and restrictions and moreover ways for their future improvement and development are discussed.
Next, we focus on the way that the topology of the physical interaction network effects on the functional interactions that take place inside the cell, such as the regulatory and the genetic interactions. A physical protein interaction network is been constructed. The topology of that network is been exploited by using kernel diffusion techniques. By varying the diffusion degree, the diffusion profiles are been created. Next, the diffusion profiles are used to characterize the topologies that connect the proteins on the physical interaction network. Moreover, the diffusion profiles are proved to be excellent tools in the improvement of the performance of the algorithms that focus on the prediction of functional interactions.
Next, protein interactions are been utilized again to predict interactions at a level above the functional interactions and that is the interactions of the biological processes as they are described in the Gene Ontology database. The classical approach for studying the complex biological networks is based on the identification of interactions between the internal components metabolic or signaling pathways. Moreover, very little is known nowadays about the interactions between higher order biological systems, such as the biological processes and pathways. In the framework of the current thesis, a new methodology for the detection of interactions between biological processes is been proposed. The methodology analyzes weighted or not protein interactions. The major result of the thesis is the network constructed by using the predicted interactions between biological processes, the so called biological processes interaction network.
Various databases have been developed containing information about experimentally and computationally detected human PPIs as well as their corresponding annotation data. However, these databases contain many false positive interactions, are partial and only a few of them incorporate data from various sources. To overcome these limitations, we have developed HINT-KB (http://150.140.142.24:84), a knowledge base that integrates data from various sources, provides a user-friendly interface for their retrieval, calculates a set of features of interest and computes a confidence score for every candidate protein interaction. This confidence score is essential for filtering the false positive interactions which are present in existing databases, predicting new protein interactions and measuring the frequency of each true protein interaction. For this reason, a novel machine learning hybrid methodology, called (Evolutionary Kalman Mathematical Modelling - EvoKalMaModel), was used to achieve an accurate and interpretable scoring methodology. The experimental results indicated that the proposed scoring scheme outperforms existing computational methods for the prediction of PPIs.
The results of the current thesis are expected to contribute in the prediction of new potential interaction of the lower and the higher cell level for the two organisms of Human and S. Cerevisiae. Moreover, they can used for understanding the higher organizational cell levels as a compact system. Finally, the results are expected to enhance the possibility of reconstructing the state-of-the-art approaches for organizing the biological knowledge.
|
8 |
Αλγόριθμοι υπολογιστικής νοημοσύνης για αριθμητική βελτιστοποίηση / Computational intelligence algorithms for numerical optimizationΠαρσόπουλος, Κωνσταντίνος 22 June 2007 (has links)
Στην διατριβή αυτή εξετάζεται η αποδοτικότητα αλγορίθμων υπολογιστικής νοημοσύνης σε προβλήματα αριθμητικής βελτιστοποίησης, αναπτύσσονται τροποποιήσεις και βελτιώσεις των μεθόδων και εισάγεται ένα νέο σχήμα της μεθόδου Βελτιστοποίησης με Σμήνος Σωματιδίων, το οποίο ενοποιεί διαφορετικές εκδόσεις της συνδυάζοντας τα χαρακτηριστικά τους, μαζί με την θεωρητική ανάλυσή του. / The main goal of this thesis was the investigation of the performance of computational intelligence algorithms on numerical optimization problems, the development of modifications and improvements of the algorithms, as well as the development of a new scheme of the Particle Swarm Optimization algorithm that harnesses its main variants, along with its theoretical analysis.
|
9 |
Ανάλυση εκπαιδευτικών θεμάτων σε τάξη που χρησιμοποιεί τεχνολογία περιρρέουσας νοημοσύνηςΜακρή, Αναστασία 29 August 2008 (has links)
- / -
|
10 |
Τεχνικές δειγματοληψίας μέσω μαρκοβιανών διαδικασιών : τέλεια προσομοίωση και εφαρμογέςΚλαμαργιάς, Αριστοτέλης 23 August 2010 (has links)
- / -
|
Page generated in 0.0186 seconds