近年眾多的台商企業至中國大陸進行投資活動，利用兩岸互補優勢，降低成本耗費，進一步提高價值創造。而資訊科技（Information Technology, IT）持續進步，使企業在不同國境、區域營運時，仍可維持良好的資訊流傳遞，除能增進不同據點之間的溝通效率與互動效益，並能整合跨地區的價值活動，使作業流程更加省時、順暢。因此台商在兩岸間營運，若能善用IT的便利性與整合性，勢必能夠提升營運效率、減少不必要成本。為達成「台灣接單、大陸生產、全球運籌、世界品牌」目標，IT正扮演著一個關鍵的致能（enabling）角色。 在本研究中以個案研究方法探討五家台灣企業的跨兩岸分工模式，再提出適用的資訊科技架構作為分析框架，探討跨兩岸資訊科技應用情形，並分析外在環境異質性對跨兩岸資訊科技應用的影響。研究發現包括：台商企業在兩岸間營運多以一般水平分工模式為主，皆存在企業功能分工現象，使兩岸據點間產生大量溝通、協調與合作需求，需以IT進行輔助；IT相關決策多由台灣總公司IT部門主導，各據點電子化程度差異不大；應用系統或資料伺服器可分置兩岸或集中在台灣總公司；選擇委外廠商推動跨兩岸資訊科技應用時，多考慮與台商或外商合作，尚未有與中國大陸當地業者合作的情況；多選擇統一使用繁體中文，以減少資料格式或名詞定義不一致的問題；中國大陸據點多設有IT部門，但僅負責日常維護與問題回報工作，IT主管皆為台灣所派遣，其他則聘用當地人才；兩岸IT人員存有部份差異，需採取不同管理方式與風格因應；「網路通訊」、「安全機制」與「人員」為較關鍵的要素；兩岸政府政策與法令制度、社會文化與習慣差異，對跨兩岸資訊科技應用有較顯著的影響。本研究亦探討台商在跨兩岸資訊科技應用所遭遇的挑戰，並提出適當建議，其後則針對過往相關研究進行異同比較。 期望本研究產生之研究結果，可提供學術界與實務界對此議題有更深入的瞭解。對已進行跨兩岸分工營運、或即將採取此方式的台商企業，則盼能提供決策者些許建議與參考價值。