Identifier les processus écologiques (a)biotiques qui sous-tendent les patrons de distribution d’espèces et de dynamique de population est fondamental pour conserver efficacement les espèces menacées d’extinction. Cette thèse poursuit un double objectif: 1) comprendre les processus écologiques qui régissent la sélection des paysages du caribou forestier (Rangifer tarandus caribou) et 2) évaluer l’efficacité des politiques actuelles d’aménagement du territoire pour cet écotype. Le premier chapitre s’inscrit directement dans le premier objectif en présentant une nouvelle méthode numérique d’inférence statistique capable de modéliser l’autocorrélation spatiale présente dans les données de distribution d’espèces. Cette méthode utilise integrated nested Laplace approximations (INLA) au lieu des simulations Markov chain Monte Carlo. Je montre, qu’en plus de produire des résultats exacts et rapides, l’utilisation d’INLA permet de modéliser l’autocorrélation spatiale résiduelle tout en estimant adéquatement l’incertitude des paramètres et des prédictions du modèle. Dans le deuxième chapitre, la methode INLA est utilisée pour tester lequel des processus, parmi le climat et la distance aux routes, explique les gradients géographiques dans la sélection des paysages par le caribou forestier. Les résultats montrent une prépondérance de l’effet des routes par rapport au climat. De plus, les parterres de coupe étaient deux fois plus évités que les brulis récents. Ces résultats appuient une gestion de l’habitat du caribou forestier qui limite l’étalement du réseau routier et qui distingue l’effet des coupes forestières de celui des feux. Le dernier chapitre explore grâce à un modèle de simulation des paysages spatialement explicite les interactions spatiales entre un réseau d’aires protégées, la récolte forestière et les feux afin de quantifier leurs effets sur la dynamique de population du caribou forestier et sur les coûts économiques liés à l’aménagement forestier. Je montre la nécessité d’inclure les contarintes liées aux feux et aux aires protégées dans le calcul des niveaux de récolte, sans quoi ces niveaux ne sont durables ni pour le caribou forestier, ni pour l’industrie forestière. Les feux augmentent l’antagonisme existant entre exploitation forestière et conservation, avec ou sans coupes de récupération après feu. Cette étude illustre donc la nécessité de mieux comprendre les interactions spatiales entre dynamique des populations, aires protégées, aménagement forestier et régime de feux pour développer des stratégies de conservation qui soient plus efficaces. / Linking spatial patterns of species distribution and population dynamics with biotic and abiotic processes is central to inform effective conservation planning for endangered species. This thesis investigated how linking spatial patterns of boreal woodland caribou (Rangifer tarandus caribou), hereafter boreal caribou, to processes can 1) improve our understanding of landscape selection of this ecotype and 2) inform the efficiency of current land use policies in practice. I first present a new powerful numerical method that allows integrating properly spatial information present in species distribution data to make accurate statistical inference. This method uses integrated nested Laplace approximations (INLA) as an alternative to Markov chain Monte Carlo simulations. I show that, in addition of being accurate and rapid, the use of INLA with Bayesian hierarchical spatial models efficiently accounted for spatial autocorrelation in the residuals and fairly evaluated uncertainty in parameter estimates and predictions. I then used INLA to test which ecological processes, among climate and the distance to roads, drove the existence of geographical patterns in boreal caribou landscape selection. Data supported road-driven selection over a climate influence. Moreover, I show that boreal caribou avoidance of logged areas was two-fold stronger than burned areas. Together these results indicated that limiting the spread of road networks and accounting for the uneven impact of logging compared to wildfire should be integral parts of any habitat management plan and conservation measures within the range of this ecotype. Finally, I use a spatially explicit landscape simulation model to explore how spatial interactions among protected area networks, industrial forestry and fire regimes impacted the population dynamics of boreal caribou and the economic costs related to forest management. I show that the current policy of conservation planning and forest management in the Côte-Nord region in Québec is unlikely to be sustainable for either boreal caribou conservation or timber supply mainly because of current overestimated planned harvest levels. Fire increased antagonisms between current practices of forest management and habitat conservation, irrespective of the presence of salvage logging. This study illustrates that efficient conservation planning requires a better understanding of spatial interactions among population dynamics, protected area networks, forest management, and fire regimes.

Le thuya occidental (Thuja occidentalis L.) vit un déclin en abondance depuis plusieurs décennies et sur une grande partie de son aire de répartition. Ce déclin serait lié à un manque de semenciers, à des problèmes d'établissement de la régénération naturelle et à une grande pression de broutement. Les stratégies sylvicoles présentement mises de l'avant pour la restauration du thuya préconisent les coupes partielles afin de promouvoir la régénération naturelle et de permettre la reprise de croissance de la régénération préétablie, mais peu d'attention a été accordée aux plantations de thuya. Cette étude offre une première caractérisation des taux de croissance, de la forme des tiges et des taux de survie des thuyas en plantation. Elle évalue les effets de la compétition, des traitements sylvicoles et du broutement par le cerf, l'orignal et le lièvre sur la croissance et la forme du thuya planté. Des plantations monospécifiques et mixtes âgées de 5 à 27 ans et situées au Bas-Saint-Laurent, Québec, ont été échantillonnées. À l'intérieur comme à l'extérieur des ravages de cerfs de Virginie, les thuyas plantés montrent des taux de survie élevés et sont généralement sujets à une faible pression de broutement, mais 45% des tiges sont fourchées. La production des plants en pépinière et la grande disponibilité de lumière pourraient expliquer l'abondance des fourches, mais plus de recherche est nécessaire afin de mieux comprendre le processus de formation et le développement des fourches. Les thuyas plantés montrent des taux de croissance élevés et une forte réaction à l'élimination de la végétation compétitrice. Les résultats suggèrent qu'en l'absence de compétition, une exclusion des herbivores de 9 ans pourrait être suffisante pour établir des peuplements de thuya de plus de 3m de hauteur et à l'abri du broutement.

L’éclaircie commerciale est une activité relativement nouvelle au Québec et son utilisation est en augmentation depuis ces dernières années. Dans ce contexte, le ministère des Ressources naturelles du Québec a entrepris une étude des effets du traitement dans les peuplements forestiers de la province. La présente investigation analyse la mortalité des tiges dix ans après l’éclaircie commerciale. Avec l’appui du modèle ForestGales, il a été possible de déterminer les vitesses critiques du vent nécessaires au déracinement et à la rupture de tiges d’épinette noire (Picea mariana (Mill.) B.S.P.) et de sapin baumier (Abies balsamea (L.) Mill.). À partir de régressions logistiques, les variables les plus influentes sur le risque de mortalité au niveau des tiges individuelles ont été identifiées: le taux d’éclaircie, l’espèce, le diamètre et le type de dépôt. Finalement, cette étude propose un modèle capable de prédire le risque de mortalité pour les populations étudiées.

Les Cris de Waswanipi ont toujours bénéficié de la forêt boréale pour maintenir leur mode de vie traditionnel, basé sur des activités de chasse, pêche et piégeage. Les coupes forestières intensives depuis les années 1960 et les impacts de ces dernières dans les territoires de trappes ont fait augmenter les tensions entre la communauté de Waswanipi et les compagnies forestières. Dans ce territoire, la Convention de la Baie James et du Nord Québécois, mise à jour par l’Entente Cri-Québec en 2002, vise à harmoniser les activités de chasse, de pêche et de trappe des Cris avec les autres activités sur le territoire, notamment les activités forestières. Cependant, il est difficile d’articuler les activités traditionnelles des Cris au processus d’aménagement forestier tant les valeurs et besoins diffèrent entre les compagnies forestières et les Cris. Ainsi, dans le but d’établir une planification forestière tactique-opérationnel qui vise à être plus proches des convictions des différentes parties intéressées, cinq plans quinquennaux ont été élaborés sur les terres de Catégorie I, en collaboration avec la compagnie Mishtuk. Ces cinq plans de récolte suivent un gradient de dispersion croissant, allant des coupes agglomérées aux coupes dispersées. Ils ont été élaborés grâce au logiciel Arcgis 9.1 et intègrent les cartes d’utilisation du territoire, mais aussi les différentes contraintes établies sous forme de normes et lois par le gouvernement. Les scénarios ont ensuite été comparés à l’aide du logiciel Wood Procurement Planning Tool (WPPT), un outil d’aide à la planification présent sous forme d’extension d’Arcgis 8.x , afin d’évaluer les impacts financiers et environnementaux dus aux modifications des plans de récolte. Les résultats de cette étude nous indiquent que parmi les scénarios d’aménagement étudiés certains s’approchent davantage de notre interprétation de la vision qu’ont les Cris de leur territoire. Cette variété de scénarios permet au planificateur forestier de s’en inspirer pour ses choix futurs en vue d’un aménagement mieux adapté dans un contexte autochtone.

Au Québec, les coupes de rétention variable (i.e. les coupes avec rétention de bouquets et les coupes avec rétention d'arbres dispersés) sont effectuées afin d'aménager la forêt de façon durable par le maintien de legs biologiques et de la biodiversité. La réalisation de ces coupes peut entraîner une augmentation du chablis chez les arbres résiduels. Cette augmentation engendre la perte d'arbres marchands laissés en place pour conserver un certain couvert vertical. La présente étude a pour but d'évaluer l'impact de la réalisation de coupes de rétention variable sur l'importance du chablis chez les arbres résiduels, deux à cinq ans après traitement. Les résultats ont montré des taux de chablis plus importants en Abitibi que pour la Côte-Nord. Les caractéristiques des arbres retenus, les conditions édaphiques et la structure des peuplements sont les facteurs expliquant le mieux le chablis.

L'écologie politique souligne que même si les paysans possèdent des savoirs et des pratiques permettant de lutter contre la dégradation des ressources naturelles, leur application est soumise à diverses contraintes provenant du contexte dans lequel ils vivent. À l'aide de méthodes issues de l'ethnographie et de la méthode active de recherche participative (MARP), nous avons étudié le contexte local du village de Kankorokuy, au Mali, les savoirs et pratiques de ses paysans qui sont en lien avec la gestion des parcs agroforestiers, ainsi que les facteurs qui, selon eux, limitent l'application de ces savoirs. Parmi ces facteurs, on trouve : les conflits entre villageois, la charge de travail élevée et le manque de main-d'œuvre, le manque de moyens financiers et de matériel agricole, la sécheresse et le manque d'eau, la consommation de bière de mil, une mauvaise gestion des animaux d'élevage et une vision à court terme.

This thesis investigates whether beliefs acquired by way of prophecy are safe. By ‘prophecy’ I have in mind the presentation of the prophetic method as found in the Guide of the Perplexed, which was Moses Maimonides’ philosophical masterpiece. And by ‘safe’ I have in mind the work by Timothy Williamson on the safety condition for knowledge. Both authors have proven to be dominant forces on these respective topics. The significance of this investigation derives from the centrality of prophecy to the three monotheistic religions. My main goal in this thesis is to identify those safety risks associated with the prophetic method. In this manner I aim to undermine any presumption in favor of prophetic beliefs as a whole being safe. Importantly, this general conclusion does not entail of a specific prophetic belief p that p is unsafe. Additionally, the scope of these results is restricted to the model of prophecy found in the Guide. The thesis begins with a critical elucidation of Williamson’s extensive work on the safety condition for knowledge. Particular attention is paid to those issues related to method individuation and Williamson’s cumulative conception of bases. Matters concerning these two topics inform the reading of Maimonides on prophecy found in the second chapter. In particular, I argue that Maimonides should be read as defending a cumulative conception of prophecy. As I emphasize several times during the chapter, the epistemology of prophecy cannot be reduced to the epistemology of testimony since prophecy for Maimonides does not involve the transfer of a proposition from God to the prophet. The third chapter is devoted to identifying those elements of the prophetic method that involve room for error. I argue that while all belief-forming methods in a fallibilist epistemology contain room for error, some are riskier than others. Prophecy should be considered one of the riskier sort. The fourth and final chapter shifts attention to non-standard semantics for ‘knows,’ David Lewis’s in particular. I argue that the interaction between such semantics and the laws governing prophecy in Jewish law is problematic. In particular, I demonstrate that such semantics destabilize the prophetic phenomenon. As such, we must either choose invariantism and gain stability, or choose non-standard semantics for ‘knows’ and live with this lack of stability.

The writings of the American pragmatist thinker Charles S. Peirce (1839-1914) provide resources for what this thesis calls the “nested continua model” of theological interpretation. A diagrammatic demonstration of iconic relational logic akin to Peirce’s Existential Graphs, the nested continua model is imagined as a series of concentric circles graphed upon a two-dimensional plane. When faced with some problem of interpretation, one may draw discrete markings that signify that problem’s logical distinctions, then represent in the form of circles successive contexts by which these distinctions may be examined in relation to one another, arranged ordinally at relative degrees of specificity and vagueness, aesthetic intensity and concrete reasonableness. Drawing from Peter Ochs’s Scriptural Reasoning model of interfaith dialogue and Robert C. Neville’s axiology of thinking—each of which makes creative use of Peirce’s logic—this project aims to achieve an analytical unity between these two thinkers’ projects, which can then be addressed to further theological ends. The model hinges between diagrammatic and ameliorative functions, honing its logic to disclose contexts in which its theological or metaphysical claims might, if needed, be revised. Such metaphysical claims include love as that which unites feeling with intelligibility, hell as imprisonment within an opaque circle of interpretation whose distorted reflections render violence upon oneself and others, and the divine as both the center of aesthetic creativity and outermost horizon from which our many layers of interpretive criteria emerge. These are claims made from a particular identity in a particular cultural context, but the logical rules upon which they are based are accessible to all, and the hope of the model is to help people overcome problems of interpretation and orient themselves toward eternity without ignoring the world around them.

In this thesis I discuss one way in which evolutionary theory has been brought to bear on the evaluation of competing meta-normative views in epistemology. More specifically, I investigate whether normative realism in epistemology (epistemic realism) is compatible with the view that we are justified in holding many of the epistemic beliefs we hold, on the assumption that those beliefs can be explained in evolutionary terms. In Part I I discuss normativity in epistemology and meta-epistemology. I begin by drawing attention to the fact that there are very different ways of understanding which concepts in epistemology are normative and what their normativity consists in. I focus on the concept of an epistemic reason to illustrate this point. I then discuss, in some detail, how different interpretations of epistemic-normativity will affect the form which normative-realist views in epistemology can take. I conclude by drawing a taxonomy of epistemic-realist views which is mindful of the different interpretations of epistemic normativity which I distinguished. In Part II I turn to discuss the topic of Darwinian arguments against normative-realist views in epistemology. I begin by considering the form which Darwinian arguments have taken in recent metaethical literature. I argue that Darwinian arguments of a kind which is meant to raise a distinctively epistemological challenge for normative-realist views – I call those 'Darwinian-epistemological' arguments – represent a more interesting object of philosophical investigation than Darwinian arguments of a different 'metaphysical' kind. I then formulate a Darwinian-epistemological argument which targets normative-realist views in epistemology (DEA), explain how it works, and spend some time discussing its key premises. In Part III I engage with the Darwinian-epistemological challenge against realism about epistemic normativity that Sharon Street presents in her paper 'Evolution and the Normativity of Epistemic Reasons' (2009). I argue that Street’s epistemological challenge is best viewed as an instance of a Darwinian-epistemological argument of the kind I formulated (DEA). I then go on to reply to Street’s argument on behalf of the epistemic realist. I conclude that arguments with the form of DEA do not represent a serious threat for normative realist views in epistemology.

Cette thèse retrace le développement du vaccin antiméningococcique A par l’Institut Mérieux de Lyon entre 1963 et 1975. Dans un premier temps, nous présentons la maladie et la menace de santé publique qu’elle représente spécifiquement en Afrique subsaharienne, nécessitant le développement d’un vaccin défendu par le médecin militaire français Lapeyssonnie. Nous retraçons l'histoire de la collaboration entre l'Organisation mondiale de la Santé, l'Institut Rockefeller, le Centre International de Référence pour les Méningocoques (Pharo) et l'Institut Mérieux qui commercialisera avec succès un vaccin. Nous concluons avec le programme massif de vaccination mené au Brésil en 1974-75 dans le cadre duquel 80 millions de personnes ont été vaccinées contre la méningite pour tenter d’arrêter une épidémie mortelle de la maladie.Nous analysons cette histoire avec le concept de ‘doable problems’ développé par Joan Fujimura. Cette approche nous permet d'échapper à une simple ‘narration du progrès’ de la découverte d'un vaccin. Au lieu de cela, l'analyse en termes de niveaux d'organisation du travail et les concepts clefs d'articulation et d'alignement mettent en évidence un certain nombre d'aspects intéressants, notamment l'importance de la collaboration entre groupes et individus, ainsi que des hypothèses implicites sur la validité des différentes approches de la production vaccinale. Cette approche analytique nous permet de mettre en évidence des aspects sociaux pour compléter l’histoire technique du développement et de l’utilisation du vaccin au cours de cette période / This thesis recounts the development of a meningococcal A vaccine by the Lyon-based company Institut Mérieux between 1963 and 1975. First, we present the disease and the public health threat it posed specifically in sub-Saharan Africa giving rise to an effort to develop a vaccine championed by the French military doctor Lapeyssonnie. We trace the history of the collaboration between the World Health Organisation, the Rockefeller Institute, the International Reference Center for the Meningococcus (Pharo) and the Institut Mérieux, the company that would successfully bring a vaccine to market. We conclude with the massive vaccination programme carried out in Brazil in 1974-75 in which 80 million people were vaccinated against meningitis in an attempt to stop a deadly epidemic of the disease. We analyse this history in terms of the concept of ‘doable problems’ developed by Joan Fujimura. This approach allows us to escape the simple ‘progressive’ narrative of the discovery of a vaccine. Instead, the analysis in terms of levels of work organization and the key concepts of articulation and alignment bring to light a number of interesting aspects, notably the importance of collaboration between groups and individuals as well as implicit assumptions concerning the validity of the different approaches to vaccine production. This analytical approach allows us to bring social aspects to the fore to complement the technical history of the development and use of the vaccine in this period